| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,183,345:1 | +T | 15.4% | intergenic (+22/+468) | zupT → / ← ribB | zinc transporter/3,4‑dihydroxy‑2‑butanone‑4‑phosphate synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,183,345 | 1 | . | T | 15.4% | 336.9 / 67.5 | 104 | intergenic (+22/+468) | zupT/ribB | zinc transporter/3,4‑dihydroxy‑2‑butanone‑4‑phosphate synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (47/41); new base T (10/6); total (57/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.91e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.04e-01 | |||||||||||
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
CAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGC > NC_000913/3183248‑3183444 | aGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑gcg < 1:1246733/100‑1 (MQ=255) gCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑gcgc < 2:591827/100‑1 (MQ=255) gCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑gcgc > 1:2132884/1‑100 (MQ=255) gCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑gcgc > 1:2120914/1‑100 (MQ=255) gCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑gcgc > 2:1369292/1‑100 (MQ=255) tGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCatgcgctgg < 1:408013/100‑9 (MQ=255) tGGCGTACTATGTGGAATGGCAGTGATGGTATTCAGTCTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCatgcgctgg < 2:1504859/100‑9 (MQ=255) gCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGAc > 1:692383/1‑100 (MQ=255) tttcTATCTGCAATGTCAGTGATGGGATTCAGTCTAGTTCGGCTACAAACGGCGGGTATTGGTTAAAATCATCATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACa < 2:2257156/96‑1 (MQ=255) aCTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACt < 1:488503/100‑1 (MQ=255) cTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACtt < 1:998178/100‑1 (MQ=39) tATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACGACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTc < 1:1084208/100‑1 (MQ=255) tATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACTTc < 2:7185/100‑1 (MQ=39) tATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACTTc < 1:1522384/100‑1 (MQ=39) aTGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCt < 1:2275079/100‑1 (MQ=255) tgtgGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACTTCt < 1:8800/99‑1 (MQ=38) tgtgGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTg < 1:660781/100‑1 (MQ=255) tgtgGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTg > 2:1647304/1‑100 (MQ=255) gtgGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGc > 2:1888195/1‑100 (MQ=255) ggAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACTTCTgatg < 1:1844073/100‑4 (MQ=38) ggAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCa < 1:1120912/100‑1 (MQ=255) aaTGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGc < 2:2199192/100‑1 (MQ=255) aTGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGCAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCt < 2:2264901/100‑1 (MQ=255) gTCAGTTATGTTATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGCGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTc < 2:735443/100‑1 (MQ=255) tCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCa > 1:291260/1‑100 (MQ=255) cAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACTTCTgatgttgtttt < 1:1289188/100‑11 (MQ=25) cAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCAc > 2:1542018/1‑100 (MQ=255) cAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCAc > 2:977054/1‑100 (MQ=255) cAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAAAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCAc < 1:1887924/100‑1 (MQ=255) gTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGa > 1:2258673/1‑100 (MQ=255) tGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGaa > 2:1843856/1‑100 (MQ=255) tGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGc < 2:626101/100‑1 (MQ=255) tGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGc > 2:1345108/1‑100 (MQ=255) gATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCtt > 2:1969136/1‑100 (MQ=255) gATTCAGTGTAGTGCTACTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCCTGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCtt > 2:764142/1‑100 (MQ=255) gTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTa > 1:2305392/1‑100 (MQ=255) gTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTa > 1:2357614/1‑100 (MQ=255) gTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCATTATTCTa > 2:1064391/1‑100 (MQ=255) tttAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTAc < 2:1361381/100‑1 (MQ=255) tAGTGCCGCTACAACCGAAGGAAATAGATTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCt < 2:1215671/100‑1 (MQ=255) gTGCTGCTACAACCGGCGGGAATTGGGTAAAAACAACATCAGAACTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCATGAACGGCTTAGTCTACCttt > 2:1514514/1‑100 (MQ=255) gTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCttt > 1:517919/1‑100 (MQ=255) tgctgcTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCtttt < 1:1261631/100‑1 (MQ=255) gctgctACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAAAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTc > 2:1357915/1‑100 (MQ=255) ctgctACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCg > 1:1868609/1‑100 (MQ=255) ctgctACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCg < 2:796237/100‑1 (MQ=255) gctACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGc < 1:395112/100‑1 (MQ=255) gctACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGc < 2:1713710/100‑1 (MQ=255) gctACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGc > 1:956494/1‑100 (MQ=255) ctACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACCACTTCTGCCAGCTTCCCGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCt < 1:2011357/100‑1 (MQ=255) tACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTg > 1:506267/1‑100 (MQ=255) tACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTg > 2:1948491/1‑100 (MQ=255) cAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGtc > 2:308221/1‑100 (MQ=255) cAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGtc > 2:9098/1‑100 (MQ=255) aaaCGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGtct < 2:378198/100‑1 (MQ=255) aaCGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGtctc > 1:1510521/1‑100 (MQ=255) ggcggGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGtctcttc > 2:1537974/1‑100 (MQ=255) ggcggGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGtctcttc > 2:1935654/1‑100 (MQ=255) ggcggGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGtctcttc < 1:1283217/100‑1 (MQ=255) ggcggGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGtctcttc < 2:1766122/100‑1 (MQ=255) gcggGAATTGGTTAAAAACAACATCAGATGTTTTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCATCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGtctcttc < 2:96689/99‑1 (MQ=255) gcggGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGtctcttcn < 2:1331976/100‑2 (MQ=255) cggGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGtctcttctc < 1:328648/100‑1 (MQ=255) ggAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTtctctc > 1:850950/1‑100 (MQ=255) gAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTTCA‑GAGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACGTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCg > 2:1081219/1‑100 (MQ=255) aaTTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGt < 1:759184/100‑1 (MQ=255) aTTGGTTAAAACCAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCCCGAAAGCCTTATTCTACCTTGTCGGCTGTCTCTTCTCTCg < 2:1008474/98‑1 (MQ=255) ttGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTAc < 1:992912/100‑1 (MQ=255) tGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACt > 1:1886513/1‑100 (MQ=255) ggTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTg > 1:1122234/1‑100 (MQ=255) ggTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTg > 1:614328/1‑100 (MQ=255) gTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGt > 1:547216/1‑100 (MQ=255) aaaaaCAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTa < 1:37932/100‑1 (MQ=255) aaaaCAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTaa > 1:1644642/1‑100 (MQ=255) aaaCAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAg < 1:1827507/100‑1 (MQ=255) aacaacATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCTGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAg < 2:1905811/99‑1 (MQ=255) aacaacATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGt > 2:1302072/1‑100 (MQ=255) acaacaTCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTa < 1:9098/100‑1 (MQ=255) aacaTCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTAtt < 2:2002801/100‑1 (MQ=255) aacaTCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTAtt > 1:224870/1‑100 (MQ=255) aTCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGt > 1:587773/1‑100 (MQ=255) aTCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGt > 1:2333386/1‑100 (MQ=255) tCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGtt > 1:2110572/1‑100 (MQ=255) tCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGtt > 2:681232/1‑100 (MQ=255) cAGAAGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGtt > 2:1000951/1‑99 (MQ=38) cAGAAGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTc > 1:1106422/1‑100 (MQ=38) cAGAAGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTc > 2:1159447/1‑100 (MQ=38) cAGAAGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTc > 1:829477/1‑100 (MQ=38) cAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTc > 2:1078203/1‑100 (MQ=255) gAAGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCcg > 1:2297708/1‑100 (MQ=39) gAAGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCcg > 1:2244696/1‑100 (MQ=39) gAAGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCcg > 1:1336640/1‑100 (MQ=39) aaGTTGTCCATGCGC‑TGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCcg > 1:1208109/1‑99 (MQ=39) gTTGTCCA‑GCTCATGGACAGCTTCTGCCAGCTTCACGAATGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCgcgc < 2:1080459/100‑1 (MQ=255) gTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCgcgc > 2:906767/1‑100 (MQ=255) gTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTc > 1:2282804/1‑100 (MQ=255) gTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTc < 1:1302079/100‑1 (MQ=255) cA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAg > 1:2098918/1‑100 (MQ=255) cA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATGCTACCTTCTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGGATTTGTTCCGCTTTTCa < 2:888772/98‑1 (MQ=255) a‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGc < 1:977057/100‑1 (MQ=255) | CAGCTATGGCGTACTATGTGGAATGTCAGTGATGGGATTCAGTTTAGTGCTGCTACAAACGGCGGGAATTGGTTAAAAACAACATCAGAAGTTGTCCA‑GCGCATGGACAACTTCTGCCAGCTTCACGAAAGCCTTATTCTACCTTTTCGGCTGTCTCTTCTCTCGTACTGTTTAAGTATTTGTTCCGCGCTTCAAGC > NC_000913/3183248‑3183444 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |