| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 226704 = | NA (NA) | 5 (0.060) | 4/170 | NT | NA | noncoding (946/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA of rrnH operon |
| ? | NC_000913 | 226730 = | NA (NA) | noncoding (972/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA of rrnH operon | |||||
TCTGGGCCTTCCCACATCGTTTCCCACTTAACCATGACTTTGGGACCTTAGCTGGCGGTCTGGGTTGTTTCCCTCTTCACGACGGACGTTAGCACCCGCCGTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/226806‑226704‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgtgAAGAGGGAAACAACCCAGACCGCCAGCTAAGGTCCCAAAGTCATGGTTAAGTGGGAAACGATGTGGGAAGGCCCAGACAGCCAGGATGTTGGCTTAGAA > NC_000913/226730‑226828 TCTGGGCCTTCCCACATCGTTTCCCACTTAACCATGACTTTGGGACCTTAGCTGGCGGTCTGGGTTGTTTCCCTCTTCACGACGGACGTTAGCACCCGCC > 2:84688/1‑100TCTGGGCCTTCCCACATCGTTTCCCACTTAACCATGACTTTGGGACCTTAGCTGGCGGTCTGGGTTGTTTCCCTCTTCACGACGGACGTTAGCACCCGCC < 1:1174712/100‑1 cgatctCTTCCCACATCGTTTCCCACTTAACCATGACTTTGGGACCTTAGCTGGCGGTCTGGGTTGTTTCCCTCTTCACGACGGACGTTAGCACCCGCCG < 2:130978/94‑1 CTGGGCCTTCCCACATCGTTTCCCACTTAACCATGACTTTGGGACCTTAGCTGGCGGTCTGGGTTGTTTCCCTCTTCACGACGGACGTTAGCACCCGCCG > 1:1041500/1‑100 CTGGGCCTTCCCACATCGTTTCCCACTTAACCATGACTTTGGGACCTTAGCTGGCGGTCTGGGTTGTTTCCCTCTTCACGACGGACGTTAGCACCCGCCG < 2:641237/100‑1 CTGGGCCTTCCCACATCGTTTCCCACTTAACCATGACTTTGGGACCTTAGCTGGCGGTCTGGGTTGTTTCCCTCTTCACGACGGACGTTAGCACCCGCCG < 1:796361/100‑1 CTGGGCCTTCCCACATCGTTTCCCACTTAACCATGACTTTGGGACCTTAGCTGGCGGTCTGGGTTGTTTCCCTCTTCACGACGGACGTTAGCACCCGCCG > 1:1870816/1‑100 CTGGGCCTTCCCACATCGTTTCCCACTTAACCATGACTTTGGGACCTTAGCTGGCGGTCTGGGTTGTTTCCCTCTTCACGACGGACGTTAGCACCCGCCG > 1:1697287/1‑100 CTGGGCCTTCCCACATCGTTTCCCACTTAACCATGACTTTGGGACCTTAGCTGGCGGTCTGGGTTGTTTCCCTCTTCACGACGGACGTTAGCACCCGCCG > 1:16768/1‑100 CTGGGCCTTCCCACATCGTTTCCCACTTAACCATGACTTTGGGACCTTAGCTGGCGGTCTGGGTTGTTTCCCTCTTCACGACGGACGGTAGCACCCGCCG > 1:2077490/1‑100 nGGGCCTTCCCACATCGTTTCCCACTTAACCATGACTTTGGGACCTTAGCTGGCGGTCTGGGTTGTTTCCCTCTTCACGACGGACGTTAGCACCCGCCGT > 1:1321148/2‑100 TGGGCCTTCCCACATCGTTTCCCACTTAACCATGACTTTGGGACCTTAGCTGGCGGTCTGGGTTGTTTCCCTCTTCACGACGGACGTTAGCCCCCGCCGT > 2:563933/1‑100 TGGGCCTTCCCACATCGTTTCCCACTTAACCATGACTTTGGGACCTTAGCTGGCGGTCTGGGTTGTTTCCCTCTTCACGACGGACGTTAGCACCCGCCGT > 1:1477312/1‑100 TGGGCCTTCCCACATCGTTTCCCACTTAACCATGACTTTGGGACCTTAGCTGGCGGTCTGGGTTGTTTCCCTCTTCACGACGGACGTTAGCACCCGCCGT > 1:711083/1‑100 TGGGCCTTCCCACATCGTTTCCCACTTAACCATGACTTTGGGACCTTAGCTGGCGGTCTGGGTTGTTTCCCTCTTCACGACGGACGTTAGCACCCGCCGT > 1:2137972/1‑100 TGGGCCTTCCCACATCGTTTCCCACTTAACCATGACTTTGGGACCTTAGCTGGCGGTCTGGGTTGTTTCCCTCTTCACGACGGACGTTAGCACCCGCCGT > 1:2101997/1‑100 TGGGCCTTCCCACATCGTTTCCCACTTAACCATGACTTTGGGACCTTAGCTGGCGGTCTGGGTTGTTTCCCTCTTCACGACGGACGTTAGCACCCGCCGT > 2:813050/1‑100 TGGGCCTTCCCACATCGTTTCCCACTTAACCATGACTTTGGGACCTTAGCTGGCGGTCTGGGTTGTTTCCCTCTTCACGACGGACGTTAGCACCCGCCGT > 2:1499660/1‑100 TGGGCCTTCCCACATCGTTTCCCACTTAACCATGACTTTGGGACCTTAGCTGGCGGTCTGGGTTGTTTCCCTCTTCACGACGGACGTTAGCACCCGCCGT > 1:1362358/1‑100 TGGGCCTTCCCACATCGTTTCCCACTTAACCATGACTTTGGGACCTTAGCTGGCGGTCTGGGTTGTTTCCCTCTTCACGACGGACGTTAGCACCCGCCGT > 1:1644986/1‑100 TGGGCCTTCCCACATCGTTTCCCACTTAACCATGACTTTGGGACCTTAGCTGGCGGTCTGGGTTGTTTCCCTCTTCACGACGGACGTTAGCACCCGCCGT > 1:1644971/1‑100 TGGGCCTTCCCACATCGTTTCCCACTTAACCATGACTTTGGGACCTTAGCTGGCGGTCTGGGTTGTTTCCCTCTTCACGACGGACGTTAGCACCCGCCGT > 2:1915969/1‑100 TGGGCCTTCCCACATCGTTTCCCACTTAACCATGACTTTGGGACCTTAGCTGGCGGTCTGGGTTGTTTCCCTCTTCACGACGGACGTTAGCACCCGCCGT < 2:2241243/100‑1 TGGGCCTTCCCACATCGTTTCCCACTTAACCATGACTTTGGGACCTTAGCTGGCGGTCTGGGTTGTTTCCCTCTTCACGACGGACGTTAGCACCCGCCGT > 2:2051153/1‑100 tGGCCTTCCCACATCGTTTCCCTCTTAACCATGACTTTGGGACCTTATCTGGCGGTCTGTGTTGTTTCCCTCTTCACGACGGACGTTAGCACCCGCCGTG < 1:464132/99‑1 GGGCCTTCCCACATCGTTTCCCACTTAACCATGACTTTGGGACCTTAGCTGGCGGTCTGGGTTGTTTCCCTCTTCACGACGGACGTTAGCACCCGCCGTG > 2:1786800/1‑100 GGGCCTTCCCACATCGTTTCCCACTTAACCATGACTTTGGGACCTTAGCTGGCGGTCTGGGTTGTTTCCCTCTTCACGACGGACGTTAGCACCCGCCGTG < 2:1434331/100‑1 GGGCCTTCCCACATCGTTTCCCACTTAACCATGACTTTGGGACCTTAGCTGGCGGTCTGGGTTGTTTCCCTCTTCACGACGGACGTTAGCACCCGCCGTG < 2:124489/100‑1 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TCTTCACGACGGACGTTAGCACCCGCCGTGAAGAGGGAAACAACCCAGACCGCCAGCTAAGGTCCCAAAGTCATGGTTAAGTGGGAAACGATGTGGGAAG > 1:1119242/1‑100 TTCACGACGGACGTTAGCACCCGCCGTGAAGAGGGAAACCACCCAGACCGCCAGCTAAGGTCCCAAAGTCATGGATAAGTGGGAAACGATGTGGGAAGGC > 2:6022/1‑100 ggCGTGAAGAGGGAAACAACCCAGACCGCCAGCTAAGGTCCCGAAGTCATGGTTAAGTGGGAAACGATGTGGGAAGGCCCAGACAGCCAGGATGTTGGCT > 1:1614438/3‑100 tccgGAAGAGGGAAACAACCCAGTCCGCCAGCTAAGGTCCCAAACTCATGGTTAAGTGTGAAACGATGTGGGAAGGCCCAGACAGCCAGGATGTTGGCT < 2:1982169/95‑1 CGTGAAGAGGGAAACAACCCAGACCGCCAGCTAAGGTCCCAAAGTCATGGTTAAGTGGGAAACGATGTGGGAAGGCCCAGACAGCCAGGATGTTGGCTTA > 1:969758/1‑100 CGTGAAGAGGGAAACAACCCAGACCGCCAGCTAAGGTCCCAAAGTCATGGTTAAGTGGGAAACGATGTGGGAAGGCCCAGACAGCCAGGATGTTGGCTTA < 2:43030/100‑1 CGTGAAGAGGGAAACAACCCAGACCGCCAGCTAAGGTCCCAAAGTCATGGTTAAGTGGGAAACGATGTGGGAAGGCCCAGACAGCCAGGATGTTGGCTTA > 1:1931533/1‑100 CGTGAAGAGGGAAACAACCCAGACCGCCAGCTAAGGTCCCAAAGTCATGGTTAAGTGGGAAACGATGTGGGAAGGCCCAGACAGCCAGGATGTTGGCTTA > 1:171071/1‑100 CGTGAAGAGGGAAACAACCCAGACCGCCAGCTAAGGTCCCAAAGTCATGGTTAAGTGGGAAACGATGTGGGAAGGCCCAGACAGCCAGGATGTTGGCTTA < 2:1551575/100‑1 CGTGAAGAGGGAAACAACCCAGACCGCCAGCTAAGGTCCCAAAGTCATGGTTAAGTGGGAAACGATGTGGGAAGGCCCAGACAGCCAGGATGTTGGCTT < 1:265885/99‑1 GTGAAGAGGGAAACAACCCAGACCGCCAGCTAAGGTCCCAAAGTCATGGTTAAGTGGGAAACGATGTGGGAAGGCCCAGACAGCCAGGATGTTGGCTTAt < 2:1061897/100‑2 GTGAAGAGGGAAACAACCCAGACCGCCAGCTAAGGTCCCAAAGTCATGGTTAAGTGGGAAACGATGTGGGAAGGCCCAGACAGCCAGGATGTTGGCTTAG > 1:1739227/1‑100 GTGAAGAGGGAAACAACCCAGACCGCCAGCTAAGGTCCCAAAGTCATGGTTAAGTGGGAAACGATGTGGGAAGGCCCAGACAGCCAGGATGTTGGCTTAG < 1:1006757/100‑1 GTGAAGAGGGAAACAACCCAGACCGCCAGCTAAGGTCCCAAAGTCATGGTTAAGTGGGAAACGATGTGGGAAGGCCCAGACAGCCAGGATGTTGGCTTAG < 2:507308/100‑1 GTGAAGAGGGAAACAACCCAGACCGCCAGCTAAGGTCCCAAAGTCATGGTTAAGTGGGAAACGATGGGGGAAGGCCCAGACAGCCAGGATGTTGGCTTAG > 1:896580/1‑100 TGAAGAGGGAAACAACGCAGACCGCCAGCTAAGGGCCCAAAGTCATGGTTAAGTGGGAAAGGATGTGGGAAGGCCCAGACAGCCAGGATGTTGGCTTA < 2:2053573/98‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |