| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4607578 | 82 (0.960) | 6 (0.070) | 4/172 | NT | 6.8% | coding (123/1032 nt) | rsmC | 16S rRNA m(2)G1207 methyltransferase, SAM‑dependent |
| ? | NC_000913 | = 4607601 | 84 (1.010) | coding (100/1032 nt) | rsmC | 16S rRNA m(2)G1207 methyltransferase, SAM‑dependent | |||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
ACGTCATCCGCCGTGGCGACCAGACTGAAACGGGCGTTATCCCCCATCTGGCGGCTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGCAAACAGAATACGGCTTTGTTCGAAATCATCACTGTGACGCAGCAAGACTTCA > NC_000913/4607480‑4607677 | aCGTCATCCGCCGTGGCGACCAGACTGAAACGGGCGTTATCCCCCATCTGGCGGCTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTgg > 2:1539124/1‑100 (MQ=255)aCGTCATCCGACGTGGCGACCAGACTGAAACGGGCGTTAGCCCCCATCTGGCGGCTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTG < 2:182101‑M1/99‑1 (MQ=255) gTCATCCGCCGTGGCGACCAGACTGAAACGGGCGTTATCCCCCATCTGGCGGCTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGcc < 2:1976786/100‑1 (MQ=255) tCATCCGCCGTGGCGACCAGACTGAAACGGGCGTTATCCCCCATCTGGCGGCTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCcg < 2:2110386/100‑1 (MQ=255) cATCCGCCGTGGCGACCAGACTGAAACGGGCGTTATCCCCCATCTGGCGGCTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCcgc < 1:1585150/100‑1 (MQ=255) tCCGCCGTGGCGACCAGACTGAAACGGGCGTTATCCCCCATCTGGCGGCTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCgg > 2:718692/1‑100 (MQ=255) gccgTGGCGACCAGACTGAAACGGGCGTTATCCCCCATCTGGCGGCTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTAt > 2:1756443/1‑100 (MQ=255) ccgTGGCGACCAGACTGAAACGGGCGTTATCCCCCATCTGGCGGCTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATc < 1:1687337/100‑1 (MQ=255) gTGGCGACCAGACTGAAACGGGCGTTATCCCCCATCTGGCGGCTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTa > 1:1660839/1‑100 (MQ=255) ggCGACCAGACTGAAACGGGCGTTATCCCCCATCTGGCGGCTTAATCCCTGCCAGTGGTGGCATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTa > 2:1068913/1‑94 (MQ=255) ggCGACCAGACTGAAACGGGCGTTATCCCCCATCTGGCGGCTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTaaa > 1:772428/1‑100 (MQ=255) ggCGACCAGACTGAAACGGGCGTTATCCCCCATCTGGCGGCTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTaaa > 2:2184115/1‑100 (MQ=255) cGACCAGACTGAAACGGGCGTTATCCCCCATCTGGCGGCTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAAcg < 2:104915/100‑1 (MQ=255) cGACCAGACTGAAACGGGCGTTATCCCCCATCTGGCGGCTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAAcg < 2:937728/100‑1 (MQ=255) cGACCAGACTGAAACGGGCGTTATCCCCCATCTGGCGGCTTAATACCTGCCAGTGGGGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAAcg < 2:2242604/100‑1 (MQ=255) ccAGACTGAAACGGGCGTTATCCCCCATCTGGCGGCTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAAcgcgc < 1:440088/100‑1 (MQ=255) aGACTGAAACGGGCGTTATCCCCCATCTGGCGGCTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCgg < 1:2343060/100‑1 (MQ=255) gACTGAAACGGGCGTTATCCCCCATCTGGCGGCTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCggg < 1:1149047/100‑1 (MQ=255) gACTGAAACGGGCGTTATCCCCCATCTGGCGGCTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCggg < 1:2352701/100‑1 (MQ=255) aCTGAAACGGGCGTTATCCCCCATCTGGCGGCTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGc > 1:1475980‑M2/1‑99 (MQ=255) aCTGAAACGGGCGTTATCCCCCATCTGGCGGCTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGc < 2:2069060‑M2/100‑2 (MQ=255) cTGAAACGGGCGTTATCCCCCATCTGGCGGCTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTTTCTAAACGCGCGGGc < 2:2245565‑M2/99‑2 (MQ=255) cTGAAACGGGCGTTATCCCCCATCTGGCGGCTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGca > 1:2084063‑M2/1‑98 (MQ=255) tGAAACGGGCGTTATCCCCCATCTGGCGGCTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGcccgcgcgtttagataccgcggccag < 1:939041‑M1/100‑27 (MQ=255) gAAACGGGCGTTATCCCCCATCTGGCGGCTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGcccgcgcgtttagataccgcggccagc < 2:880969‑M1/100‑28 (MQ=255) gAAACGGGCGTTATCCCCCATCTGGCGGCTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAgg > 1:1289462/1‑100 (MQ=255) gAAACGGGCGTTATCCCCCATCTGGCGGCTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAgg < 2:1816808/100‑1 (MQ=255) aaaCGGGCGTTATCCCCCATCTGGCGGCTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGcccgcgcgtttagataccgcggccagc < 2:1665226‑M1/99‑28 (MQ=255) aaCGGGCGTTATCCCCCATCTGGCGGCTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGcccgcgcgtttagataccgcggccagccg < 1:406663‑M1/100‑30 (MQ=255) aaCGGGCGTTATCCCCCATCTGGCGGCTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGcccgcgcgtttagataccgcggccagccg < 1:400677‑M1/100‑30 (MQ=255) aaCGGGCGTTATCCCCCATCTGGCGGCTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAggac > 1:734305/1‑98 (MQ=255) cGGGCGTTATCCCCCATCTGGCGGCTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCAt < 1:1756457/100‑1 (MQ=255) gggCGTTATCCCCCATCTGGCGGCTTAACACCTGCCAGTGGGGGAGTTGGTGGGTATGCGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGGAGGTCagc < 2:1263593/100‑3 (MQ=255) ggCGTTATCCCCCATCTGGCGGCTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATcc > 2:48824/1‑100 (MQ=255) ggCGTTATCCCCCATCTGGCGGCTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATcc < 1:154928/100‑1 (MQ=255) ggCGTTATCCCCCATCTGGCGGCTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATc > 1:456387/1‑99 (MQ=255) cGTTATCCCCCATCTGGCGGCTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTg < 2:1227093/100‑1 (MQ=255) cGTTATCCCCCATCTGGCGGCATAATACCAGCCAGTGGTGGAATTGCTGGTTATGAGCACGGCTGGCAGCGGTATCGAAACGCGCGGGCAGGTCATc > 2:285503/1‑97 (MQ=255) cGTTATCCCACATCTGGCGGCTTAATACCTGCCAGTGGTGAAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTg > 2:284082/1‑100 (MQ=255) tATCCCCCATCTGGCGGCTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTaa < 2:1583630/100‑1 (MQ=255) tCCCCCATCTGGCGGCTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGt > 2:422450/1‑100 (MQ=255) ccccTCTGGCGGCTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGACTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTACGtctc > 2:318820/1‑100 (MQ=255) aTCTGGCGGCTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGcccgcgcgtttagataccgcggccagccgtgctcatacccagcaat < 1:857135‑M1/100‑47 (MQ=255) tCTGGCGGCTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGc > 1:1081545/1‑100 (MQ=255) tCTGGCGGCTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGc < 2:1835267/100‑1 (MQ=255) ggcggcTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGCaaa > 2:815236/1‑100 (MQ=255) ggcggcTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGGCATCCTGTAAGTCTCCGGCaaa > 2:1550499/1‑100 (MQ=255) gcggcTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGTGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGCAAAc < 1:649805/100‑1 (MQ=255) gcggcTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGCAAAc > 1:1502928/1‑100 (MQ=255) gcggcTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGCAAAc > 1:2272573/1‑100 (MQ=255) ggcTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGCAAACAg < 2:2061321/100‑1 (MQ=255) cTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGCAAACAGaa > 2:1002679/1‑100 (MQ=255) ttAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGCAAACAGAAt < 2:619655/100‑1 (MQ=255) ttAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGCAAACAGAAt < 2:734303/100‑1 (MQ=255) tAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGCAAACAGAATa > 1:112789/1‑100 (MQ=255) aTACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGCAAACAGAATACg > 1:65188/1‑100 (MQ=255) aTACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGCAAACAGAATACg > 1:1974049/1‑100 (MQ=255) tACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGCAAACAGAATACgg > 2:543361/1‑100 (MQ=255) tACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGCAAACAGAATACgg > 1:2206433/1‑100 (MQ=255) aCCTGCGAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGCAAACAGAATACGGc > 1:2352734/1‑100 (MQ=255) aCCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGCAAACAGAATACGGc < 1:535870/100‑1 (MQ=255) cTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGCAAACAGAATACGGCtt > 2:1922879/1‑100 (MQ=255) tGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGCAAACAGAATACGGCttt > 1:112950/1‑100 (MQ=255) gCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGCAAACAGAATACGGCTTTg > 2:466241/1‑100 (MQ=255) cAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGCAAACAGAATACGGCTTTGtt > 1:2299928/1‑100 (MQ=255) aGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGCAAACAGAATACGGCTTTGTTc < 1:1029021/100‑1 (MQ=255) gtggAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGCAAACAGAATACGGCTTTGTTCGaaa > 1:2303709/1‑100 (MQ=255) gAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGCAAACAGAATACGGCTTTGTTCGAAatca < 2:1423251/100‑1 (MQ=255) aaTTGCTGGGTATGAGCACGGCTTGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAATTCTCCGGCAAACAGAATACGGCTTTGTTCGAAatca < 1:1113652/99‑1 (MQ=255) aaTTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGCAAACAGAATACGGCTTTGTTCGAAattat > 1:1124241/1‑100 (MQ=255) aaTTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGCAAACAGAATACGGCTTTGTTCGAAatcat > 1:2179558/1‑100 (MQ=255) aaTTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGCAAACAGAATACGGCTTTGTTCGAAatcat > 1:1693116/1‑100 (MQ=255) aTTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGcagccgtgctcatacccagcaattccaccactggcaggtattaagccgccagat < 1:857135‑M2/100‑55 (MQ=255) aTTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGCAAACAGAATACGGCTTTGTTCGAAatcatc < 1:1807333/100‑1 (MQ=255) gggTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGCAAACAGAATACGGCTTTGTTCGAAATCATCACtgtg < 2:1693103/100‑1 (MQ=255) gggTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGCAAACAGAATACGGCTTTGTTCGAAATCATCACtgtg > 2:2126983/1‑100 (MQ=255) ggTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGCAAACAGAATACGGCTTTGTTCGAAATCATCACTGTGa > 1:192736/1‑100 (MQ=255) ggTATGAGCAAGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGCAAACAGAATACGGCTTTGTTCGAAATCATCACTGTGa > 2:361787/1‑100 (MQ=255) gTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGCAAACAGAATACGGCTTTGTTCGAAATCATCACTGTGAc < 1:355775/100‑1 (MQ=255) gTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGCAAACAGAATACGGCTTTGTTCGAAATCATCACTGTGAc > 1:1721357/1‑100 (MQ=255) tATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGCAAACAGAATACGGCTTTGTTCGAAATCATCACTGTGACg > 1:800291/1‑100 (MQ=255) aTGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGCAAACAGAATACGGCTTTGTTCGAAATCATCACTGTGACgc < 2:800289/100‑1 (MQ=255) tGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGCAAACAGAATACGGCTTTGTTCGAAATCATCACTGTGACgca > 1:946854/1‑100 (MQ=255) tGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGCAAACAGAATACGGCTTTGTTCGAAATCATCACTGTGACgca > 1:1161871/1‑100 (MQ=255) tGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGCAAACAGAATACGGCTTTGTTCGAAATCATCACTGTGACgca > 1:1866845/1‑100 (MQ=255) gtaCGGCTGGCCGAGGTATCTAAACGCGCGGACAGGTCATCCAGTAAGTCTCCGGCAAACAGAATACGGCTTTGTTCGAAATCATCACTGTGACgcagca > 1:1612176/3‑100 (MQ=255) gCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGCAAACAGAATACGGCTTTGTTCGAAATCATCACTGTGACgcagca > 1:1336617/1‑100 (MQ=255) gCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGCAAACAGAATACGGCTTTGTTCGAAATCATCACTGTGACgcagca > 2:170255/1‑100 (MQ=255) cGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGcagccgtgctcatacccagcaattccaccactggcaggtattaagccgccagatgggggataacgcccgtt < 1:400677‑M2/100‑72 (MQ=255) cGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGcagccgtgctcatacccagcaattccaccactggcaggtattaagccgccagatgggggataacgcccgtt < 1:406663‑M2/100‑72 (MQ=255) ggCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGCAAACAGAATACGGCTTTGTTCGAAATCATCACTGTGACGCAGCAAGAc < 1:785956/100‑1 (MQ=255) gCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGcagccgtgctcatacccagcaattccaccactggcaggtattaagccgccagatgggggataacgcccgtttc < 2:880969‑M2/100‑74 (MQ=255) gCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGCAAACAGAATACGGCTTTGTTCGAAATCATCACTGTGACGCAGCAAGACt > 1:1078721/1‑100 (MQ=255) cTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGcagccgtgctcatacccagcaattccaccactggcaggtattaagccgccagatgggggataacgcccgtttca < 1:939041‑M2/100‑75 (MQ=255) tGcccgcgcgtttagataccgcggccagccgtgctcatacccagcaattccaccactggcaggtattaagccgccagatgggggataacgcccgtttcag > 1:2084063‑M1/1‑2 (MQ=255) tGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGCAAACAGAATACGGCTTTGTTCGAAATCATCACTGTGACGCAGCAAGACTTc > 1:85538/1‑100 (MQ=255) tGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTAATGATGTAAGTCTCCGGCAGACAGAATACGGCTTTGTTCGAAATCATCACTGTGACGCGGCCAGACTTc > 2:1563466/1‑100 (MQ=255) gcccgcgcgtttagataccgcggccagccgtgctcatacccagcaattccaccactggcaggtattaagccgccagatgggggataacgcccgtttcagt < 2:2069060‑M1/100‑100 (MQ=255) gcccgcgcgtttagataccgcggccagccgtgctcatacccagcaattccaccactggcaggtattaagccgccagatgggggataacgcccgtttcagt > 1:1475980‑M1/1‑1 (MQ=255) gcccgcgcgtttagaaaccgcggccagccgtgctcatacccagcaattccaccactggcaggtattaagccgccagatgggggataacgcccgtttcag < 2:2245565‑M1/99‑99 (MQ=255) | ACGTCATCCGCCGTGGCGACCAGACTGAAACGGGCGTTATCCCCCATCTGGCGGCTTAATACCTGCCAGTGGTGGAATTGCTGGGTATGAGCACGGCTGGCCGCGGTATCTAAACGCGCGGGCAGGTCATCCTGTAAGTCTCCGGCAAACAGAATACGGCTTTGTTCGAAATCATCACTGTGACGCAGCAAGACTTCA > NC_000913/4607480‑4607677 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |