New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2304591 = | NA (NA) | 18 (0.230) | 6/164 | NT | 28.5% | noncoding (175/655 nt) | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences |
? | NC_000913 | 2304609 = | 49 (0.570) | noncoding (193/655 nt) | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences |
GCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGAC > NC_000913/2304510‑2304708 | ttgggcgttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgca > 1:1219536‑M2/100‑100 (MQ=255) gCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGCGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTa < 1:1009147/100‑1 (MQ=17) tgggcgttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcAt > 1:266937‑M2/99‑100 (MQ=255) tgggcgttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcAt > 1:937319‑M2/99‑100 (MQ=255) tgggcgttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagcacttcacagcggagtaagcctgataagacgcgccagcgtcgcAt > 1:2143261‑M2/99‑100 (MQ=255) gggcgttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagcacttcacagcggtgtgggcctgataagacgcgccagcgtcgcAt < 2:2009537‑M2/2‑1 (MQ=255) gggcgttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcAt < 1:67614‑M2/2‑1 (MQ=255) gggcgttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccaacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcATc < 2:1414118‑M2/3‑1 (MQ=255) ggcgttagatgtcggatgcggcgtatccgccttatccggcctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcATCa < 2:1471343‑M2/4‑1 (MQ=255) ggcgttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcATCa < 1:379832‑M2/4‑1 (MQ=255) ggcgttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtagcatta > 1:2173402‑M2/97‑98 (MQ=255) ggcgttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgaccgacggggtggggcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcATCa < 1:1320814‑M2/4‑1 (MQ=255) gcgttggaggtcggatgcggggtaaccgccttatccgacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcATCAg < 1:720509‑M2/5‑1 (MQ=255) gcgttagctgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcATCAg > 1:1250247‑M2/96‑100 (MQ=255) gcgttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcATCAg > 1:1599815‑M2/96‑100 (MQ=255) cgttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcATCAgg > 1:85325‑M2/95‑100 (MQ=255) cgttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcATCAgg < 1:1311411‑M2/6‑1 (MQ=255) cgttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcATCAgg > 1:1796339‑M2/95‑100 (MQ=255) cgttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcATCAgg < 1:1228331‑M2/6‑1 (MQ=255) cgttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcATCAg < 2:128169‑M2/5‑1 (MQ=255) cgtcggccgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggtgcccttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcATCAgg < 2:1110205‑M2/6‑1 (MQ=255) gttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcATCAGGc < 1:767034‑M2/7‑1 (MQ=255) gttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcATCAGGc < 1:2107277‑M2/7‑1 (MQ=255) gttagatgtcggatgcggcggaaccgccttatccgacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcATCAGGc < 1:1635992‑M2/7‑1 (MQ=255) gctgcggcgttcccgccttatccgacctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcATCAgg < 2:1878534‑M2/6‑1 (MQ=255) cAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCt < 2:1844471/100‑1 (MQ=11) aGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTc > 1:1461479/1‑100 (MQ=31) aGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTc > 1:1208900/1‑100 (MQ=31) gACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTcc > 1:1945044/1‑100 (MQ=32) gACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTcc < 1:801275/100‑1 (MQ=32) aCAAGGAGATCACGCCGCATCCGACACCTACCGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTcc < 2:1782800/99‑1 (MQ=11) cAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAc > 1:1432788/1‑100 (MQ=35) aaGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAcc < 1:817889/100‑1 (MQ=35) aGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAccc < 1:1781405/100‑1 (MQ=38) aGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAccc > 2:1763799/1‑100 (MQ=38) aGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAccc < 2:939524/100‑1 (MQ=38) ggCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAcccc < 2:1220920/100‑1 (MQ=38) ggCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCAAccc > 2:633782/1‑99 (MQ=18) gTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTa < 2:478423/99‑1 (MQ=35) ttaCGCCGCATCCGACACCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAgg < 1:22555/98‑1 (MQ=11) aCGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGtt < 2:1865735/100‑2 (MQ=17) aCGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCAGTTTCCTAGTGCGACGCTTATGGAACTAATGAGGCCGACACTGGTTCTAAGTGCTCCACCCCGCAg > 2:1991628/1‑97 (MQ=2) cgccgcATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCg < 2:1688553/100‑1 (MQ=33) cgccgcATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCg < 2:360058/100‑1 (MQ=33) cgccgcATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCg > 1:572924/1‑100 (MQ=33) cgccgcATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACACGGTaag > 2:7344/1‑95 (MQ=255) ccgcATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTGCACCCCGTAGGTCGGa > 1:330356/1‑100 (MQ=17) ccgcATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGa < 2:1658027/100‑1 (MQ=33) ccgcATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGa < 2:2230982/100‑1 (MQ=33) ccgcATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGa < 2:1173809/100‑1 (MQ=32) ccgcATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGa < 2:98777/100‑1 (MQ=33) ctcttCCGATCTCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTa < 2:2144842/88‑1 (MQ=255) gcATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATa < 2:510048/100‑1 (MQ=33) cATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATaa < 2:572922/100‑1 (MQ=32) cATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATaa < 2:666271/100‑1 (MQ=33) ccGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGTGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGc > 1:2129979/1‑100 (MQ=18) ccGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGc > 1:1578872/1‑100 (MQ=33) ccGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGc < 2:1945028/100‑1 (MQ=32) ccGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGc < 1:186681/100‑1 (MQ=32) ccGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGc < 2:1496731/100‑1 (MQ=33) cGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCg > 2:414136/1‑100 (MQ=33) gACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCgg < 2:869633/100‑1 (MQ=33) gACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCgg < 1:1812919/100‑1 (MQ=32) gACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCgg < 2:987025/100‑1 (MQ=33) gACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCgg < 1:1815511/100‑1 (MQ=33) ggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGt > 1:71211‑M2/48‑100 (MQ=255) aCATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGTGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGt < 2:2129962/100‑1 (MQ=18) cacccAACGCCCGTGCCGGTTGCCTGATGGGACGCTGGCGCGGCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGt < 2:1738352/96‑1 (MQ=11) aTCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGGTa > 2:1113461/1‑100 (MQ=16) ccAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCgggcacg > 1:2144860/1‑95 (MQ=255) cAACGCCTGAGACGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGAGCGGCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgc > 2:1250240/1‑100 (MQ=11) cAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTCATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGtt < 2:1292132/96‑1 (MQ=17) cttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcATCAGGCCTCCACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCAcgcc > 1:1556033‑M2/42‑100 (MQ=255) aaCGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgcc < 1:1285337/100‑1 (MQ=33) cGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgccgc < 2:2115634/100‑1 (MQ=32) cGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgccg < 2:1020759/99‑1 (MQ=32) gtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACa > 1:148602‑M2/32‑100 (MQ=255) tgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACAt > 2:377794‑M2/31‑100 (MQ=255) aggcctgataagacgcgccagcgtcgcATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTa > 1:1094091‑M2/28‑100 (MQ=255) aggcctgataagacgcgccagcgtcgcATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTa > 2:1730485‑M2/28‑100 (MQ=255) ggcctgataagacgcgccagcgtcgcATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCCCCCCGTAGGTTGGATACGGCGGTTCCGCCGCATCCGACATc > 2:2010198‑M2/27‑97 (MQ=255) ggcctgataagacgcgccagcgtcgcATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGAcatccaa > 2:738179‑M2/27‑97 (MQ=255) ggcctgataagacgcgccagcgtcgcATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTaa > 2:589211‑M2/27‑100 (MQ=255) gcctgataagacgcgccagcgtcgcATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAAc > 2:1743434‑M2/26‑100 (MQ=255) gcctgataagacgcgccagcgtcgcATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATACAACATATaa > 2:2050697‑M2/26‑99 (MQ=255) gcctgataagacgcgccagcgtcgcATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCAGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACCACTAAc > 1:1292139‑M2/26‑100 (MQ=255) cctgataagacgcgccagcgtcgcATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACg > 1:1658328‑M2/25‑100 (MQ=255) cctgataagacgcgccagcgtcgcATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACg < 2:148601‑M2/76‑1 (MQ=255) tgataagacgcgcccgcgtcgcATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGTGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGcc > 1:1160788‑M2/23‑100 (MQ=255) gataagacgcgccagcgtcgcATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGccc > 2:1228580‑M2/22‑100 (MQ=255) aagacgcgccagcgtcgcATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACAtccaacgtccgag < 1:377796‑M2/82‑7 (MQ=255) cgccagcgtcgcATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGtt > 2:1711498‑M2/13‑100 (MQ=255) tcgcATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGAATAAGGCGGTTACGCCGCATCCTAAATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATg > 2:1900013‑M2/5‑100 (MQ=255) ctcATCCGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATg < 2:925589‑M2/96‑1 (MQ=255) ATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGAc > 2:1540477‑M2/1‑100 (MQ=255) | GCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGAC > NC_000913/2304510‑2304708 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |