| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,946,025 | (A)7→6 | intergenic (‑49/+90) | ruvA ← / ← yobI | component of RuvABC resolvasome, regulatory subunit/uncharacterized protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,946,019 | 0 | A | . | 94.0% | 471.6 / 23.2 | 117 | intergenic (‑43/+96) | ruvA/yobI | component of RuvABC resolvasome, regulatory subunit/uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/6); new base . (54/56); total (55/62) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.18e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.83e-01 | |||||||||||
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
AATTAACACCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGG > NC_000913/1945920‑1946114 | aTTAACACCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATaa < 2:2409672/100‑1 (MQ=255) aGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGGCTCGGAGTCTGCCTATCACATGGGGCGCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCGGTATGAT‑AAAAAATGCTg > 1:624054/1‑100 (MQ=255) aGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTg < 2:439753/100‑1 (MQ=255) aGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTg < 1:250061/100‑1 (MQ=255) aGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTg > 1:3163949/1‑100 (MQ=255) gCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGGTAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTg < 1:2238989/100‑1 (MQ=255) gCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTgg < 1:2986062/100‑1 (MQ=255) ggggTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGgata < 1:2731599/100‑1 (MQ=255) gggTTGTGTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGgatag < 1:876726/100‑1 (MQ=255) tgttTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGatat > 2:338516/1‑100 (MQ=255) tgttTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGatat > 1:746996/1‑100 (MQ=255) tttttCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGAAAAAAAAT‑AAAAAATGCTGgatatctatcc < 2:1225843/100‑8 (MQ=255) ttttCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCa > 1:3138842/1‑100 (MQ=255) ttttCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATACa > 2:314050/1‑100 (MQ=255) tttCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAg > 2:1519288/1‑100 (MQ=255) tttCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAg > 1:2920805/1‑100 (MQ=255) tttCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAg < 2:2307244/100‑1 (MQ=255) ttCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATATCTATCCAGc < 1:3327828/100‑1 (MQ=255) ttCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTATTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGc < 2:1553728/100‑1 (MQ=255) tCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCg > 2:2556544/1‑100 (MQ=255) tCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCg > 2:3285080/1‑100 (MQ=255) tCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCg > 2:3285826/1‑100 (MQ=255) tCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCg > 1:1236554/1‑100 (MQ=255) cAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCg > 1:630186/1‑99 (MQ=255) aaTGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGaa > 1:1389180/1‑100 (MQ=255) atgatgatgCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAg < 1:2039732/100‑1 (MQ=255) tgatgatgCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAgg > 1:1574024/1‑100 (MQ=255) tgatgatgCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAgg < 2:2879292/100‑1 (MQ=255) gatgatgCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGGCGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATATCTATCCAGcattttt < 2:693603/100‑7 (MQ=255) gatgatgCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATATCTATCCAGcattttt < 1:1162712/100‑7 (MQ=255) gatgatgCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATATCTATCCAGcattttt < 1:2645744/100‑7 (MQ=255) gatgatgCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATATCTATCCAGcattttt < 1:121752/100‑7 (MQ=255) gatgatgCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATATCTATCCAGcattttt < 1:2071456/100‑7 (MQ=255) gatgatgCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGa < 1:2833066/100‑1 (MQ=255) gatgatgCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGa < 1:1623380/100‑1 (MQ=255) atgatgCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAACATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATATCTATCCAGcatttttt < 2:3275391/100‑8 (MQ=255) tgatgCCTCTGAGTCTGCCTATCACCTGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATg > 1:1377419/1‑100 (MQ=255) tgatgCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATg > 1:2102010/1‑100 (MQ=255) gatgCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATATCTATCCAGcattttttat < 1:572952/100‑10 (MQ=255) atgCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATgaa < 1:1471151/100‑1 (MQ=255) atgCCACTAAGTCTACCTATAACAAGACGCTCATGCGTAATGAATCAAAGATAATAAAAAAAAA‑AAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATg < 2:906641/98‑1 (MQ=255) ccTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATgaagaa > 1:1298948/1‑100 (MQ=255) tctGAGTCTGCCTATCACATGACACTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGaaaa > 1:1948966/1‑100 (MQ=255) ctGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAAc > 2:3334673/1‑100 (MQ=255) tGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAAc < 2:1400485/100‑1 (MQ=255) tGAGTCTGCCTATCACATGACGCGCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATgaagaa < 2:1564581/96‑1 (MQ=255) gTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGc > 1:35622/1‑100 (MQ=255) gTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGc > 2:1456845/1‑100 (MQ=255) tCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAATATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGc < 2:2184198/99‑1 (MQ=255) tCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCg < 1:1517413/100‑1 (MQ=255) tCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCg < 2:1941716/100‑1 (MQ=255) tCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCg < 2:624053/100‑1 (MQ=255) cTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGa < 2:5705/100‑1 (MQ=255) tGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGGTAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAg < 2:2863172/100‑1 (MQ=255) tGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAg > 2:2767015/1‑100 (MQ=255) tGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAg < 1:377451/100‑1 (MQ=255) gCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAgg < 2:59901/100‑1 (MQ=255) gCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAgg < 2:3163931/100‑1 (MQ=255) gCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAgg > 1:934180/1‑100 (MQ=255) gCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAg > 2:457053/1‑99 (MQ=255) cTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGCTAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTAGCGCgg > 2:2568834/1‑98 (MQ=255) cTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGgtg > 1:1927117/1‑100 (MQ=255) tATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGgtgt > 2:1516491/1‑100 (MQ=255) aTCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGtc > 2:1229051/1‑100 (MQ=255) cacaTGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGtctc < 2:1725996/100‑1 (MQ=255) caTGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGa > 1:629637/1‑100 (MQ=255) tGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGAt < 2:447034/100‑1 (MQ=255) tGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATg < 2:499020/100‑1 (MQ=255) tGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATg < 2:2993548/100‑1 (MQ=255) gACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAAGGCGGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATg < 2:2681124/100‑1 (MQ=255) aCGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGaa > 1:1472143/1‑100 (MQ=255) gCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACt < 1:2556556/100‑1 (MQ=255) cTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTg > 1:394269/1‑100 (MQ=255) ccTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGCT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGaa > 2:3147837/1‑100 (MQ=255) ccTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGaa > 1:4491/1‑100 (MQ=255) cTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGTAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGaaa < 2:2012848/100‑1 (MQ=255) tGCGTAATGACTCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGTTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGaaaa < 2:2194192/100‑1 (MQ=255) gCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGaaaa < 1:1495451/99‑1 (MQ=255) tAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATgg > 1:3278944/1‑100 (MQ=255) tAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATg < 2:1892642/99‑1 (MQ=255) aaTGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGc > 1:3103351/1‑100 (MQ=255) attaaTCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGca < 2:1942402/97‑1 (MQ=255) tGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGcac < 2:1298944/100‑1 (MQ=255) gAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGcac < 1:1015896/100‑1 (MQ=255) gAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGcaca > 2:1953998/1‑100 (MQ=255) aaTCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAg < 1:3334691/100‑1 (MQ=255) aTCAAAGATAAGGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTTGATAGATATCCAGCGAAGGATAAAGAAAGCTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAg < 2:451039/99‑1 (MQ=255) tCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGta > 1:1776703/1‑100 (MQ=255) aaaGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGtata > 1:2411836/1‑100 (MQ=255) aaaGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGtata < 1:1229055/100‑1 (MQ=255) aaaGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCAAAAAAAAAAAAAAAATGGCACAGta < 2:1619482/98‑1 (MQ=255) gATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAAtt < 2:1927109/100‑1 (MQ=255) tGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTc < 2:2102001/100‑1 (MQ=255) tGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTc > 1:3275942/1‑100 (MQ=255) gCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCt < 1:1519292/100‑1 (MQ=255) cTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTa < 2:3103251/100‑1 (MQ=255) gaaTGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGAAAAAAAAAAAAAAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACa < 2:1776698/98‑1 (MQ=255) tATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAg < 1:2452289/100‑1 (MQ=255) tATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAg > 1:1410824/1‑100 (MQ=255) tGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTTTACAgg > 2:1242430/1‑100 (MQ=255) | AATTAACACCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGG > NC_000913/1945920‑1946114 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |