Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,326,925 | (C)6→7 | coding (817/1185 nt) | atoB → | acetyl‑CoA acetyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,326,919 | 1 | . | C | 98.7% | 554.8 / ‑0.5 | 154 | coding (811/1185 nt) | atoB | acetyl‑CoA acetyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/2); new base C (72/80); total (72/82) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
Only 100 of 171 total aligned reads displayed.
AAAGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTAC > NC_000913/2326820‑2327012 | aaGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGAAGGCCTTA‑‑c < 2:1204299/100‑1 (MQ=255) cAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑cccc > 2:3007286/1‑100 (MQ=255) aGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑cccc‑c < 1:1629971/100‑1 (MQ=255) ggAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCGGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑cccc‑cc > 1:991515/1‑100 (MQ=255) aCAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑cccc‑ccctg < 2:236952/100‑4 (MQ=255) aCAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑cccc‑ccctg < 2:549347/100‑4 (MQ=255) gTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCt > 1:2828250/1‑100 (MQ=255) gTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCt > 1:1060419/1‑100 (MQ=255) aCCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGc > 1:1521169/1‑100 (MQ=255) aCCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGc > 1:1966836/1‑100 (MQ=255) cGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCAt < 1:1387740/100‑1 (MQ=255) cGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCAt < 2:1847376/100‑1 (MQ=255) ggAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTaaaa > 1:383297/1‑100 (MQ=255) gAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAg > 1:1774970/1‑100 (MQ=255) gAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAg < 2:2527704/100‑1 (MQ=255) aCGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGtt < 1:584539/100‑1 (MQ=255) cgcgTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTa > 2:1867611/1‑100 (MQ=255) cgTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATg < 2:1447425/100‑1 (MQ=255) gTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGc > 1:966133/1‑100 (MQ=255) gTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGc > 2:2751686/1‑100 (MQ=255) tCTGGTATTAACGCCGGTGCTGCCCCTCTGGTGATTATGAAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATg < 2:1246218/98‑1 (MQ=255) tGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAg > 1:86078/1‑100 (MQ=255) ggTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGc > 1:1006669/1‑100 (MQ=255) ggTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCAGATGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTTGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGc > 2:2252989/1‑100 (MQ=255) tATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCgg > 1:3168368/1‑100 (MQ=255) tAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTgg < 2:1079475/100‑1 (MQ=255) tAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTgg > 1:770302/1‑100 (MQ=255) aaCGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGc > 1:555589/1‑100 (MQ=255) aaCGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGc < 2:3268288/100‑1 (MQ=255) aaCGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGc > 1:1863014/1‑100 (MQ=255) cgacgGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGt > 1:2442625/1‑100 (MQ=255) cgacgGTGCTGCCGCTCTGGGGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑CCCCGCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCg < 2:87583/99‑1 (MQ=255) gacgGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTg < 1:3058814/100‑1 (MQ=255) acgGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTgn < 2:477925/100‑2 (MQ=255) acgGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGc < 2:1655905/100‑1 (MQ=255) acgGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGc < 2:1080988/100‑1 (MQ=255) cgGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGcc > 2:3301391/1‑100 (MQ=255) cgGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGcc > 2:1176229/1‑100 (MQ=255) ggTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGccc > 2:2740781/1‑100 (MQ=255) ggTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGATGGCGTGccc > 2:2656451/1‑100 (MQ=255) gTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGcccc < 1:1932783/100‑1 (MQ=255) gctgcCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGcccccc > 1:2980170/1‑100 (MQ=255) gctgcCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGcccccc < 1:1625290/100‑1 (MQ=255) ctgcCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCg < 1:1660151/100‑1 (MQ=255) ctgcCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCg > 2:675469/1‑100 (MQ=255) tgcCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGc > 2:1589661/1‑100 (MQ=255) gcCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGc < 1:2078483/99‑1 (MQ=255) gcCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCa > 2:2834001/1‑100 (MQ=255) cGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGGAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCAt > 2:2066419/1‑99 (MQ=255) cGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCAtt < 1:1460916/100‑1 (MQ=255) cGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCAtt < 2:1523431/100‑1 (MQ=255) cGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCAtt > 1:1572796/1‑100 (MQ=255) cGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCAtt < 1:1460819/100‑1 (MQ=255) cGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCAtt < 1:129059/100‑1 (MQ=255) gCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTg < 2:2449505/100‑1 (MQ=255) tctGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCTGTGGCGTGCCCCCCGCATTGAt < 1:3185042/100‑1 (MQ=255) tctGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCTGTGGCGTGCCCCCCGCATTGAt < 1:3184636/100‑1 (MQ=255) tctGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGAt < 2:1142500/100‑1 (MQ=255) tctGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGAt < 2:3226188/100‑1 (MQ=255) tctGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGAt > 2:1736280/1‑100 (MQ=255) ctGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATg < 2:281968/100‑1 (MQ=255) ctGGTGATAATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGAAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATg < 2:2467137/100‑1 (MQ=255) ggTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCTGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATggg > 2:2575637/1‑100 (MQ=255) ggTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATggg > 1:2648466/1‑100 (MQ=255) tGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTa < 1:3327453/100‑1 (MQ=255) ttATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATgg > 1:2382545/1‑100 (MQ=255) tATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATggg < 2:2068567/100‑1 (MQ=255) aTGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATgggg > 1:2774154/1‑100 (MQ=255) aTGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATgggg > 2:2235492/1‑100 (MQ=255) 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cTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTg < 2:2717040/100‑1 (MQ=255) tGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGc < 2:962469/100‑1 (MQ=255) tGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGc < 1:3091728/100‑1 (MQ=255) ngcggcgCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGATGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGc > 2:2077981/2‑100 (MQ=255) gcggcgCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGcc < 1:217345/100‑1 (MQ=255) gcggcgCTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGcc < 1:1912590/100‑1 (MQ=255) gcgcTGGCAGCAGACCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACg < 1:2792674/100‑1 (MQ=255) gcgcTGGCAGCAGACCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACg < 1:67929/100‑1 (MQ=255) cgcTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGc < 1:739865/100‑1 (MQ=255) gcTGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCa < 1:2457684/100‑1 (MQ=255) ntGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCaa > 1:1747380/2‑100 (MQ=255) cTGGCAGCAGGCCTTACCCCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCa < 2:1950688/100‑1 (MQ=255) tGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCaaa > 1:925678/1‑100 (MQ=255) tGGCAGCAGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGGATGGGGCCAGTACCTGCCACGCaaa > 2:2139155/1‑100 (MQ=255) gcagcaGGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCaaaaa < 2:259589/100‑1 (MQ=255) cagcagGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAg > 2:2707055/1‑100 (MQ=255) gcagGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCg > 2:3063314/1‑100 (MQ=255) gcagGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCg < 2:445464/100‑1 (MQ=255) cagGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGt < 1:1046460/100‑1 (MQ=255) agGCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGtt > 2:773911/1‑100 (MQ=255) ggCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTa > 1:2163697/1‑100 (MQ=255) ggCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTa > 1:366331/1‑100 (MQ=255) ggCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTa < 2:1642468/100‑1 (MQ=255) gCCTTAC‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGCCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTTTGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTAc > 2:1452716/1‑100 (MQ=255) | AAAGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑‑CCCC‑CCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTAC > NC_000913/2326820‑2327012 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |