| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,946,025 | (A)7→6 | 100% | intergenic (‑49/+90) | ruvA ← / ← yobI | component of RuvABC resolvasome, regulatory subunit/uncharacterized protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,946,019 | 0 | A | . | 96.2% | 438.8 / 9.2 | 104 | intergenic (‑43/+96) | ruvA/yobI | component of RuvABC resolvasome, regulatory subunit/uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/3); new base . (44/56); total (45/59) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.32e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
ATTAACACCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGG > NC_000913/1945921‑1946114 | aTTAACACCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATaa > 1:3081912/1‑100 (MQ=255)aTTAACACCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATaa > 1:1536620/1‑100 (MQ=255) aaCACCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATaaaaa < 1:976277/100‑1 (MQ=255) aaCACCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATaaaaa > 1:1790588/1‑100 (MQ=255) acacCAGCGGGGTTTGTTTTACAATGAGGAGGCCTCTTTGTATGCATATCACATGACGCTCCGGCGTAATGAATCAAAGATAAGGCTGTATGATaaaaaa < 2:2485910/100‑1 (MQ=255) acacCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATaaaaaa > 2:406096/1‑100 (MQ=255) cacCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATaaaaaat < 2:3119335/100‑2 (MQ=255) cacCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATaaaaaat > 2:783123/1‑99 (MQ=255) cacCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATaaaaaat > 2:2970391/1‑99 (MQ=255) acCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATaaaaaatg > 1:1428053/1‑98 (MQ=255) cAGCGGTGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATaaaaaatgc < 2:2110429/99‑4 (MQ=255) aGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTg < 1:931817/100‑1 (MQ=255) gCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTgg < 1:1888698/100‑1 (MQ=255) cGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGga < 1:375116/100‑1 (MQ=255) gggggTTGTTTTTCAATGACGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGgat > 2:1621604/1‑100 (MQ=255) ggggTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGgata > 1:82060/1‑100 (MQ=255) ggTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGgataga > 2:1153723/1‑100 (MQ=255) ggTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGgataga < 1:427969/100‑1 (MQ=255) ggTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTATTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGgataga < 2:921001/100‑1 (MQ=255) gttgttTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGgatagat < 2:1137474/100‑1 (MQ=255) gttTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATc > 2:2826403/1‑100 (MQ=255) tttttCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATcc < 1:3549328/100‑1 (MQ=255) ttttCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCa < 2:2232836/100‑1 (MQ=255) ttttCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCa < 2:3614371/100‑1 (MQ=255) tCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCg > 2:1581670/1‑100 (MQ=255) cAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGa > 2:1886767/1‑100 (MQ=255) aaTGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGTTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGa < 2:802462/99‑1 (MQ=255) atgatgatgCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGCTAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATATCTATCCAGcattt < 2:3241750/100‑5 (MQ=255) tgatgatgCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATATCTATCCAGcatttt < 1:2136312/100‑6 (MQ=255) tgatgatgCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGa > 2:3179320/1‑97 (MQ=255) gatgatgCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAgg < 2:2529077/100‑1 (MQ=255) atgatgCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATATCTATCCAGcatttttt < 1:3616646/100‑8 (MQ=255) atgatgCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGAt > 2:2465344/1‑100 (MQ=255) atgatgCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGAt < 2:3308130/100‑1 (MQ=255) atgatgCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGAt > 2:1399050/1‑100 (MQ=255) gatgCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATTCTGTATGAT‑AAAAAACGCTGGATATCTATCCAGcattttttat < 1:3042102/100‑10 (MQ=37) gatgCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATga < 1:3245650/100‑1 (MQ=255) tgCCTCTGAGTTTGCCTATCACATTACGCTACTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATgaag < 2:1812005/100‑1 (MQ=255) tgCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATgaag < 2:805424/100‑1 (MQ=255) tgCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATgaag > 1:1291254/1‑100 (MQ=255) ccTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATgaagaa > 1:2190620/1‑100 (MQ=255) ccTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATgaagaa > 2:2997884/1‑100 (MQ=255) ctctGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGaaa < 2:3048957/100‑1 (MQ=255) ctctGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGaaa > 1:587875/1‑100 (MQ=255) cgctGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGGATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCATCGAAGGATGAAGaaa > 2:1704924/3‑100 (MQ=255) tctGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGaaaa > 1:3521620/1‑100 (MQ=255) ctGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAAc > 1:3730486/1‑100 (MQ=255) cTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGa < 2:1047136/100‑1 (MQ=255) gCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAgg < 2:3325158/100‑1 (MQ=255) gCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAgg > 2:3461319/1‑100 (MQ=255) ccTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGgt > 2:1463920/1‑100 (MQ=255) cTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGA‑AAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAg < 2:2002605/97‑1 (MQ=255) tATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGgtgt > 1:1186946/1‑100 (MQ=255) cacaTGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGtctc < 1:115466/100‑1 (MQ=255) acaTGACGCTCCTGCGTAATGAATCAACGCTAATGCTGTATGAT‑AAAACATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGgtgt > 2:1789525/1‑96 (MQ=255) acaTGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGtctc < 2:3787388/99‑1 (MQ=255) acaTGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCg > 2:2871310/1‑100 (MQ=255) acaTGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCg < 1:3584556/100‑1 (MQ=255) caTGACGCTCCTGCGTAATGAATTAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGa < 2:1237994/100‑1 (MQ=255) caTGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGa < 2:175974/100‑1 (MQ=255) caTGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGa < 1:2997906/100‑1 (MQ=255) aTGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGAt > 1:821285/1‑100 (MQ=255) tGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATg < 1:3727840/100‑1 (MQ=255) tGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATg < 1:1621614/100‑1 (MQ=255) tGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATg > 1:2541740/1‑100 (MQ=255) tGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGGATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGAt < 2:1273848/99‑1 (MQ=255) gACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGGTGAATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGa < 2:1102844/100‑1 (MQ=255) aCGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATACAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGaa > 2:3673056/1‑100 (MQ=255) cGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAAc < 2:412289/100‑1 (MQ=255) cGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAAc > 1:2231048/1‑100 (MQ=255) cGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAACGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGGTAGATTTCCAGCGAATGATGAAGAATACTTGCGAGGTGTCTCGATGAAc < 2:2446712/100‑1 (MQ=255) gCTCCTGGGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACt < 1:2272308/100‑1 (MQ=255) tCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGa > 2:715507/1‑100 (MQ=255) ccTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGaa > 1:3643523/1‑100 (MQ=255) ccTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGaa > 2:2899333/1‑100 (MQ=255) cTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGaaa < 1:1887864/100‑1 (MQ=255) tGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGaaaa > 1:1369767/1‑100 (MQ=255) gCGTCATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGaaaaa < 1:2742653/100‑1 (MQ=255) gTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATg < 1:2717570/100‑1 (MQ=255) tAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGAGAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACATGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATgg < 2:540534/100‑1 (MQ=255) aaTGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGc < 1:231741/100‑1 (MQ=255) aaTGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGc > 1:2537710/1‑100 (MQ=255) aaTGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCAAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGc > 2:1573045/1‑100 (MQ=255) aTGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGca > 2:721632/1‑100 (MQ=255) tGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGcac < 1:460826/100‑1 (MQ=255) gAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGcaca > 2:2928259/1‑100 (MQ=255) aaTCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAg > 2:3552704/1‑100 (MQ=255) aaaGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGtata > 2:960902/1‑100 (MQ=255) aaaGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCAAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGAAAAAAAAAAAAAAAAAATGGCACAGtata < 2:1402675/100‑1 (MQ=255) aGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATaa > 2:144307/1‑100 (MQ=255) gATAATGCTGTATAAT‑AACAAATGTTGGATAGATATCAAGAGAAGTATGAAGAAAACTTGTGAGTTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCAAAGTATAAtt < 2:1848220/100‑1 (MQ=255) aTGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTAtt < 2:1608861/100‑1 (MQ=255) aTGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTAtt > 2:1146149/1‑100 (MQ=255) aTGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTAtt < 1:3141905/100‑1 (MQ=255) tGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTc < 2:2368326/100‑1 (MQ=255) gCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAGACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCt < 2:1585194/100‑1 (MQ=255) cTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTa > 1:1987468/1‑100 (MQ=255) gTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACa > 2:2141164/1‑100 (MQ=255) gTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACa > 1:2497663/1‑100 (MQ=255) aTGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGCCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAgg < 1:2639422/100‑1 (MQ=255) | ATTAACACCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGG > NC_000913/1945921‑1946114 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |