Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,326,925:1 | (C)6→7 | 100% | coding (817/1185 nt) | atoB → | acetyl‑CoA acetyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,326,919 | 1 | . | C | 95.7% | 390.7 / 10.0 | 116 | coding (811/1185 nt) | atoB | acetyl‑CoA acetyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (4/1); new base C (51/60); total (55/61) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.88e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
AAGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑A‑C‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTAC > NC_000913/2326821‑2327012 | aaGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGCTGATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑A‑c > 2:3294481/1‑100 (MQ=255) aaGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑A‑c < 2:265287/100‑1 (MQ=255) cttccgatctgTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑A‑c‑c < 1:1967756/90‑1 (MQ=255) gCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑A‑c‑cc > 1:1432075/1‑100 (MQ=255) gCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑A‑c‑cc > 1:3754075/1‑100 (MQ=255) gCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑A‑c‑cc > 1:474321/1‑100 (MQ=255) aGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTCTGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑A‑c‑cc‑c > 2:1743370/1‑99 (MQ=255) aGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑A‑c‑cc‑cc > 2:181674/1‑100 (MQ=255) aGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑A‑c‑cc‑cc > 2:1682820/1‑100 (MQ=255) aGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑A‑c‑cc‑cc < 2:1462190/100‑1 (MQ=255) gAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑A‑c‑cc‑cc‑cc < 2:348297/100‑2 (MQ=255) gAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTAGTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑A‑c‑cc‑cc‑cc < 1:2440979/100‑2 (MQ=255) aaCAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGGCGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑A‑c‑cc‑cc‑cct < 2:447841/100‑3 (MQ=255) aCAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑A‑c‑cc‑cc‑cct < 2:447753/99‑3 (MQ=255) aCAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGGGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑A‑c‑cc‑cc‑cctg < 1:122706/100‑4 (MQ=255) aGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑A‑c‑cc‑cc‑cctggc > 2:3565376/1‑95 (MQ=255) gTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCt > 2:3260506/1‑100 (MQ=255) tCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTc < 2:2589785/100‑1 (MQ=255) cACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCg < 2:1216287/100‑1 (MQ=255) aCCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGc < 2:576776/100‑1 (MQ=255) ccGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCa < 2:1492003/100‑1 (MQ=255) cGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCAt > 2:554480/1‑100 (MQ=255) cGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCCGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCAt < 1:3421218/100‑1 (MQ=255) gCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCAtt < 2:953763/100‑1 (MQ=255) cTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTa < 2:206440/100‑1 (MQ=255) gggAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTaaa > 1:3041315/1‑100 (MQ=255) ggAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTaaaa > 1:1398758/1‑100 (MQ=255) ggAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTaaaa < 1:1603269/100‑1 (MQ=255) ggAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTaaaa > 1:2555271/1‑100 (MQ=255) aaCGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGt < 1:2481834/100‑1 (MQ=255) aCGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGtt < 1:3151196/100‑1 (MQ=255) cgcgTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTa < 1:2853740/100‑1 (MQ=255) cgTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATg < 1:2805707/100‑1 (MQ=255) cgTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATg > 1:3173253/1‑100 (MQ=255) cgTCTGGTATTAACGACAGTACTGACGCTCTGGTGATGATGGAAGACTCTGCGGCGCTGGCCGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTTGAATTAAAAGTTa > 2:73061/1‑98 (MQ=255) gTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGc > 2:2705919/1‑100 (MQ=255) tCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGcc > 1:1875247/1‑100 (MQ=255) gTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCg > 1:2599857/1‑100 (MQ=255) tATTAACGATGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCgg > 2:824346/1‑100 (MQ=255) tAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTgg < 1:3209760/100‑1 (MQ=255) tAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTgg < 1:1747896/100‑1 (MQ=255) aaCGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGc > 1:2183377/1‑100 (MQ=255) aaCGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGc > 2:3276325/1‑100 (MQ=255) acgacgGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCg > 1:2931694/1‑100 (MQ=255) acgacgGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCg < 2:1413023/100‑1 (MQ=255) cgacgGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGt > 2:3822516/1‑100 (MQ=255) acgGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGc < 2:1332238/100‑1 (MQ=255) ggggctgcCGCGCTGGGGATTATGGAAGAGTCTGCGGCGCTGGCAGTAGGCCTTGC‑C‑CC‑CC‑CTGGCGCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGc < 2:3320133/91‑1 (MQ=255) tgcCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGGGTGCCCCCCg < 2:1859870/99‑1 (MQ=255) tgcCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGc < 1:554486/100‑1 (MQ=255) tgcCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGc > 2:2856269/1‑100 (MQ=255) tgcCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGc > 2:2800464/1‑100 (MQ=255) cGCTCTGGCGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCAtt < 2:3661591/100‑1 (MQ=255) ctctGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGa < 1:2913155/100‑1 (MQ=255) ctctGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGa < 1:3462431/100‑1 (MQ=255) tctGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGAt > 1:890750/1‑100 (MQ=255) tctGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGAt < 1:2953003/100‑1 (MQ=255) ctGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATg < 1:59745/100‑1 (MQ=255) tGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATgg > 1:3718662/1‑100 (MQ=255) ggTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATggg > 1:2093732/1‑100 (MQ=255) ggTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATggg > 1:3769155/1‑100 (MQ=255) gTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGt < 1:915315/100‑1 (MQ=255) gTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGt > 2:1989255/1‑100 (MQ=255) aTTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑A‑CACC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATg > 2:2347588/1‑100 (MQ=255) aTGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGTATTAAAAGTTATGCCAGTGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATggg > 1:1006871/1‑99 (MQ=255) aTGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATgggg > 2:3654748/1‑100 (MQ=255) tGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGc > 2:1199096/1‑100 (MQ=255) tGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGc < 1:1212552/100‑1 (MQ=255) ggAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGcc < 1:1914877/100‑1 (MQ=255) 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cggcgCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCa < 2:1176703/100‑1 (MQ=255) ggcgCTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCAc < 2:2887746/100‑1 (MQ=255) cgcTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGc > 1:2492351/1‑100 (MQ=255) cgcTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGc > 2:3129322/1‑100 (MQ=255) cgcTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGc < 1:3265669/100‑1 (MQ=255) gcTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCa < 2:2801973/100‑1 (MQ=255) cTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCaa < 2:420162/100‑1 (MQ=255) cTGGCAGCAGGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCaa > 2:304065/1‑100 (MQ=255) cagcagGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAg > 2:1936805/1‑100 (MQ=255) cagcagGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAg > 2:2843830/1‑100 (MQ=255) cagcagGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAg > 2:308890/1‑100 (MQ=255) agcagGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGc < 1:2054341/100‑1 (MQ=255) gcagGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCg < 2:3077839/100‑1 (MQ=255) agGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGtt < 2:3724034/100‑1 (MQ=255) agGCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGtt < 1:567192/100‑1 (MQ=255) ggCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTa > 2:2919581/1‑100 (MQ=255) gCCTT‑ACC‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTAc < 1:3174037/100‑1 (MQ=255) | AAGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTT‑A‑C‑CC‑CC‑CTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTAC > NC_000913/2326821‑2327012 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |