| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,303,658 | T→A | 15.6% | Y254N (TAT→AAT) | oppB → | oligopeptide ABC transporter permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,303,658 | 0 | T | A | 15.6% | 398.1 / 57.4 | 152 | Y254N (TAT→AAT) | oppB | oligopeptide ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (57/71); new base A (10/14); total (67/85) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.27e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.61e-01 | |||||||||||
Only 100 of 157 total aligned reads displayed.
TTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCATTGAACCGTGACTATTCCTTAGTGTTAAGCCTGACCATCCTGGTTGGTGCTTTAACCA > NC_000913/1303559‑1303757 | ttACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCAttt < 1:3772732/100‑1 (MQ=255) aCGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGttt > 2:793827/1‑100 (MQ=255) aCGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGttt > 1:2941258/1‑100 (MQ=255) cGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAATCATTTATGGttgg < 1:2594141/100‑3 (MQ=255) cGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTg > 1:2729193/1‑100 (MQ=255) gCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGc < 2:242746/100‑1 (MQ=255) cATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATAAATGGtttcga < 1:2312372/100‑4 (MQ=255) cATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATAAATGGtttcga < 1:1619174/100‑4 (MQ=255) cATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATAAATGGtttcga < 1:843770/100‑4 (MQ=255) aTTAAAACCTGCTCTGTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCg < 1:2485328/100‑1 (MQ=255) aTTAAAACCTGCTCTGTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATAAATGGtttcgat < 1:3620639/100‑5 (MQ=255) aTTAAAACCTGCTCTGTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATAAATGGtttcgat < 1:3504219/100‑5 (MQ=255) aTTAAAACCTGCTCTGTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTAACGGTTCTATGGTTATCGAAACCATAAATGGtttcgat < 2:2774922/100‑5 (MQ=255) ttAAAACCTGCTCTGTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCgg > 2:162519/1‑100 (MQ=255) ttAAAACCTGCTCTGTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATAAATGGtttcgata < 1:2193900/100‑6 (MQ=255) tAAAACCTGTTCTGTTACTCGTTGTCTCTTATGTATGCCGAGCATTTGTCGTCATTATTACCGGTTCTAGTGTTATCGAAACCATAAATGGtttcgata < 2:1259284/99‑6 (MQ=255) tAAAACCTGCTCTGTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCggg < 1:133706/100‑1 (MQ=255) aaaaCCTGCTCTGTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCgggg < 1:323862/100‑1 (MQ=255) aaaaCCTGCTCTGTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCgggg < 1:2815036/100‑1 (MQ=255) aaaaCCTGCTCTGTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCgggg < 2:682290/100‑1 (MQ=255) aaaCCTGCTCTGTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGa < 2:958961/100‑1 (MQ=255) aaaCCTGCTCTGTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGa > 1:638515/1‑100 (MQ=255) aaaCCTGCTCTGTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGa < 1:1506973/100‑1 (MQ=255) aaCCTGCTCTGTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATAAATGGtttcgataacca < 1:2771226/100‑10 (MQ=255) aCCTGCTCTGTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGAtt > 1:1471198/1‑100 (MQ=255) ccTGCTCTGTTACCCGTTCTCTCTCATATGGGCCCCGCCTTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGAt < 2:1499625/98‑1 (MQ=255) ccTGCTCTGTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTg < 1:72701/100‑1 (MQ=255) cTGCTCTGTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTgg < 1:2098540/100‑1 (MQ=255) tGCTCTGTTACCCGTGTTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTgg < 2:2738038/99‑1 (MQ=255) tGCTCTGTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGa < 1:2029755/100‑1 (MQ=255) gCTCTGTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGAc < 1:951293/100‑1 (MQ=255) ctctGTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACa > 2:3003390/1‑100 (MQ=255) tGTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACt > 2:2521659/1‑100 (MQ=255) tGTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACt < 2:1748673/100‑1 (MQ=255) tGTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACt > 2:3346262/1‑100 (MQ=255) gTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTg < 2:1690837/100‑1 (MQ=255) ttACCCGTGCTCTTTGATATGGGCCTCGCAGTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAAc < 1:3328507/97‑1 (MQ=255) tACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGtt < 2:2783336/100‑1 (MQ=255) aCCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGtt < 2:1027749/99‑1 (MQ=255) cccGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCg < 2:3718888/100‑1 (MQ=255) cccGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCg < 1:3768766/100‑1 (MQ=255) cGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGtt < 1:1044483/100‑1 (MQ=255) cGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGtt > 1:467676/1‑100 (MQ=255) gCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAAt > 1:2441360/1‑100 (MQ=255) tctctTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATgg < 1:2311333/100‑1 (MQ=255) ctctTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGgc > 2:3195246/1‑100 (MQ=255) ctctTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGgc > 1:3392207/1‑100 (MQ=255) ttATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCa < 1:3195270/100‑1 (MQ=255) tataTGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCAt < 1:3139846/100‑1 (MQ=255) tataTGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCAt > 2:721419/1‑100 (MQ=255) atGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCATTGa < 1:2411927/100‑1 (MQ=255) tGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCATTGaa > 2:273895/1‑100 (MQ=255) ggCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCATTGAAcc > 2:2209513/1‑100 (MQ=255) ggCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCATTGAAcc < 1:740032/100‑1 (MQ=255) ccccGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCATTGAACCGt > 2:1729573/1‑100 (MQ=255) ccGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCATTGAACCGTGa > 2:180294/1‑100 (MQ=255) ccGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCATTGAACCGTGa > 1:1776998/1‑100 (MQ=255) ccGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCATTGAACCGTGa < 1:1854322/100‑1 (MQ=255) tCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCATTGAACCGTGACTATTCCtt < 2:745423/100‑1 (MQ=255) gCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCATTGAACCGTGACTATTCCTTAgt > 2:114259/1‑100 (MQ=255) cATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCATTGAACCGTGACTATTCCTTAgtg > 1:2030844/1‑100 (MQ=255) ttattaCCGGTTCGATGGTCATCGAAACCATTTATGGTTTACCGGGGATTGGGCAATTGTTCGTTAATGGCGCATTGAACCGTGACTATTCCTTAgtgt < 2:3667950/99‑1 (MQ=255) tattaCCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCATTGAACCGTGACTATTCCTTAGTGTTa < 1:3601095/100‑1 (MQ=255) attaCCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCATTGAACCGTGACTATTCCTTAGTGTTaa > 1:1031055/1‑100 (MQ=255) attaCCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCATTGAACCGTGACTATTCCTTAGTGTTaa < 1:1924989/100‑1 (MQ=255) ttaCCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCATTGAACCGTGACTATTCCTTAGTGTTAAg < 1:3792960/100‑1 (MQ=255) ccGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCATTGAACCGTGACTATTCCTTAGTGTTAAGCCt > 1:2456851/1‑100 (MQ=255) cGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCATTGAACCGTGACTATTCCTTAGTGTTAAGCCTg > 2:3312910/1‑100 (MQ=255) ggTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCATTGAACCGTGACTATTCCTTAGTGTTAAGCCTGa > 2:881596/1‑100 (MQ=255) ggTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCATTGAACCGTGACTATTCCTTAGTGTTAAGCCTGa < 1:1731127/100‑1 (MQ=255) gTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCATTGAACCGTGACTATTCCTTAGTGTTAAGCCTGAc < 1:1272775/100‑1 (MQ=255) gTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCATTGAACCGTGACTATTCCTTAGTGTTAAGCCTGAc < 1:3382169/100‑1 (MQ=255) ttCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCATTGAACCGTGACTATTCCTTAGTGTTAAGCCTGAcc > 2:2384579/1‑100 (MQ=255) ttCTATGGTTATCGAAAACATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGATAACTGTTCGTGAATGGCGCATTGAACCGGGACTATTCCTTAGTGTTAAGCCTGAc < 1:531452/99‑1 (MQ=255) tCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCATTGAACCGTGACTATTCCTTAGTGTTAAGCCTGACCa < 1:1785130/100‑1 (MQ=255) tCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCATTGAACCGTGACTATTCCTTAGTGTTAAGCCTGACCa > 1:3291664/1‑100 (MQ=255) tGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCATTGAACCGTGACTATTCCTTAGTGTTAAGCCTTACCATCCt > 2:3735859/1‑100 (MQ=255) tGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCATTGAACCGTGACTATTCCTTAGTGTTAAGCCTGACCATCCt > 1:2390601/1‑100 (MQ=255) ggTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCATTGAACCGTGACTATTCCTTAGTGTTAAGCCTGACCATCCtg > 1:750936/1‑100 (MQ=255) ggTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCATTGAACCGTGACTATTCCTTAGTGTTAAGCCTGACCATCCtg > 2:1476385/1‑100 (MQ=255) ccccggcaaaCCATAAATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCATTGAACCGTGACTATTCCTTAGTGTTAAGCCTGACCATCCtgg > 1:97492/8‑100 (MQ=255) cccggcaaaCCATAAATGGTTTGCCGGGGATTGGACACCTGTTCGTTAACGGCGCATTGAACCGTGACTATTCCTTAGTGTTAAGCCTGACCATCCt > 2:1889591/7‑97 (MQ=255) ccggcaaaCCATAAATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCATTGAACCGTGACTATTCCTTAGTGTTAAGCCTGACCATCCtggtt > 2:3025913/6‑100 (MQ=255) cggcaaaCCATAAATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGTCGCATTGAACCGTGACTATTCCTTATTGTTAAGCCTGACCATc > 2:2430429/5‑93 (MQ=255) cggcaaaCCATAAATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCATTGAACCGTGACTATGCCTTAGTGTTAAGCCTGACCATCCtggttg > 2:3587018/5‑100 (MQ=255) aTCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCATTGAACCGTGACTATTCCTTAGTGTTAAGCCTGACCATCCtggttg > 1:2185625/1‑100 (MQ=255) gcaaaCCATAAATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCATTGAACCGTGACTATTCCTTAGTGTTAAGCCTGACCATCCtggttggt > 2:1840662/3‑100 (MQ=255) cGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCATTGAACCGTGACTATTCCTTAGTGTTAAGCCTGACCATCCtggttggt > 1:3528471/1‑100 (MQ=255) gAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCATTGAACCGTGACTATTCCTTAGTGTTAAGCCTGACCATCCTGGTTGGTg < 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ccATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCATTGAACCGTGACTATTCCTTAGTGTTAAGCCTGACCATCCTGGTTGGTGCttt > 1:2679991/1‑100 (MQ=255) aTTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCATTGAACCGTGACTATTCCTTAGTGTTAAGCCTGACCATCCTGGTTGGTGCTTTaa > 2:2164581/1‑100 (MQ=255) ttATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCATTGAACCGTGACTATTCCTTAGTGTTAAGCCTGACCATCCTGGTTGGTGCTTTAAcc < 2:759476/100‑1 (MQ=255) tATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCATTGAACCGTGACTATTCCTTAGTGTTAAGCCTGACCATCCTGGTTGGTGCTTTAACCa > 2:1977229/1‑100 (MQ=255) | TTACGTCACGCATTAAAACCTGCTCTGTTACCCGTGCTCTCTTATATGGGCCCCGCATTTGTCGGCATTATTACCGGTTCTATGGTTATCGAAACCATTTATGGTTTGCCGGGGATTGGACAACTGTTCGTTAATGGCGCATTGAACCGTGACTATTCCTTAGTGTTAAGCCTGACCATCCTGGTTGGTGCTTTAACCA > NC_000913/1303559‑1303757 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |