Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,335,684 | G→A | 16.6% | intergenic (+226/‑147) | yciX → / → acnA | uncharacterized protein/aconitate hydratase 1; aconitase A |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,335,684 | 0 | G | A | 16.6% | 294.1 / 42.5 | 126 | intergenic (+226/‑147) | yciX/acnA | uncharacterized protein/aconitate hydratase 1; aconitase A |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (51/54); new base A (9/12); total (60/66) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.11e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.50e-01 |
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
ATGAAATATTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATT > NC_000913/1335587‑1335781 | atGAAATATTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTgcggc > 2:850194/1‑100 (MQ=255) gAAATATTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGcggcgg > 1:3029045/1‑100 (MQ=255) aaTATTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCgggg < 2:3252959/100‑1 (MQ=255) atTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCCGCAGCGGGGtca < 1:2354240/100‑3 (MQ=255) atTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCCGCAGCGGGGtc < 2:935035/99‑2 (MQ=255) tgggTCCTGGGTGGGCGCGTTTCCGCTGTCGATGCACTTCCGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGCCGGGGTTg < 2:2180018/97‑1 (MQ=255) tGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTc < 1:2683120/100‑1 (MQ=255) tGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTc > 2:553542/1‑100 (MQ=255) tGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCCGCAGCGGGGtcaag < 2:1438416/100‑5 (MQ=255) tGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTAACCCCGCCGCAGCGGGGtcaag < 2:327820/100‑5 (MQ=255) ggTCCTGGATTGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCCGCAGCGGGGtcaagg < 2:2518567/100‑6 (MQ=255) ggTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCa > 1:16939/1‑100 (MQ=255) ggTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCCCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCCGCAGCGGGGtcaac < 2:3624500/99‑5 (MQ=255) gTCCTGGATGGGGGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGACCCGCTCTGGATCATTACTAACTGATCCTTGACCCCGCCGCAGCGGGGtcaagga < 2:349491/100‑7 (MQ=255) gTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTATGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCAt > 1:2693195/1‑100 (MQ=255) tCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCAtt < 1:1089882/100‑1 (MQ=255) ccTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCAttt > 1:1711406/1‑100 (MQ=255) ggATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCAtttgct < 1:1426513/100‑1 (MQ=255) gATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCAtttgctt > 1:3298730/1‑100 (MQ=255) gATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCAtttgctt > 2:2813177/1‑100 (MQ=255) gggCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCAtttgctttgc < 1:2343176/100‑1 (MQ=255) gggCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCAtttgctttgc < 2:3553925/100‑1 (MQ=255) ggCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGcc > 1:1737094/1‑100 (MQ=255) ggCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGcc < 1:699194/100‑1 (MQ=255) gcgcGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCca < 2:231336/100‑1 (MQ=255) gcgcGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCca > 1:1471648/1‑100 (MQ=255) gcgTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCcaca < 1:819555/100‑1 (MQ=255) ttttCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAgg < 1:3767927/100‑1 (MQ=255) ttttCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAgg < 1:2183648/100‑1 (MQ=255) ttttCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAgg < 1:2043632/100‑1 (MQ=255) ttCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGATCTCCTCTGTATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGtt < 1:1364551/100‑1 (MQ=255) ctctGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTTCCACAAGGTTtc < 1:2516001/100‑1 (MQ=255) ctctGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTtc > 1:2760083/1‑100 (MQ=255) ctctGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTtc > 1:3548654/1‑100 (MQ=255) ctctGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCGGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTtc > 2:1242260/1‑100 (MQ=255) tctGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTtct < 1:1259553/100‑1 (MQ=255) tGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTctcc < 1:3371570/100‑1 (MQ=255) tGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTctcc < 1:130064/100‑1 (MQ=255) tGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTctcc < 2:62396/100‑1 (MQ=255) tGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTctcc > 1:3070703/1‑100 (MQ=255) gTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTctcct < 1:3817745/100‑1 (MQ=255) gATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCtt < 1:2500973/100‑1 (MQ=255) aTGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCttt < 1:2187083/100‑1 (MQ=255) tGCGCTTCTGGGCGGAGCTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCtttt < 2:1415482/100‑1 (MQ=255) gCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTa < 2:2992176/100‑1 (MQ=255) gCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTa < 1:3000631/100‑1 (MQ=255) ctgtgctGGGCCCAACTCCTCGGGGTAGTTACGCAGTGATCCTTGACCCCGCTGCGGGGGGGTTGTCATTTGCTTAGCCACAAGGTTTCTCCTCttt < 2:3078054/92‑1 (MQ=255) ctctTGTGGGCCGAACTCCTCTGGGTGAGTACTCACGGAGCCGTGACCCCCCTGCGGCGGTGTTGTCATGTGCTTTGCCACAAGGGTTCTCCTCtgttn < 2:2359969/99‑2 (MQ=255) ctctTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGTGGAGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTAt > 2:2685575/1‑100 (MQ=255) ctGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAAtt > 1:1930809/1‑100 (MQ=255) tGGGCCGAACTACTCTGGATCAGTACTCACTGATCCTTGAGCACGCTGCGGCGGGGGTGTCATTTACTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAAtt > 2:2378290/1‑99 (MQ=255) gggCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTg > 1:1499748/1‑100 (MQ=255) gggCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTg < 2:3061742/100‑1 (MQ=255) gggCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTg < 2:2184994/100‑1 (MQ=255) gCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTggg > 1:3630161/1‑100 (MQ=255) gCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTggg < 2:2653935/100‑1 (MQ=255) ccGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGgt < 2:544056/100‑1 (MQ=255) gAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGgttg < 2:3452658/100‑1 (MQ=255) aaCTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGgttgt < 1:684854/100‑1 (MQ=255) aaCTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCGGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTGCTCCTCGTTTATCAATTTGGgttgt < 2:1524797/100‑1 (MQ=255) ctcctcTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTa < 2:24442/100‑1 (MQ=255) ctctGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCa < 1:2458166/100‑1 (MQ=255) tctGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCaa > 1:1969728/1‑100 (MQ=255) tGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTACCAAAt > 2:1578767/1‑100 (MQ=255) ggATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGTTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATc < 2:2045024/100‑1 (MQ=255) gATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGATGTTATCAAATc > 2:3572409/1‑99 (MQ=255) aTCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGt > 1:1401907/1‑100 (MQ=255) aCTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTAcgcg < 2:2141329/100‑1 (MQ=255) cTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGTGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTAcgcg < 2:1175806/99‑1 (MQ=255) cTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCCTTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATGGTTAcgc > 2:1998006/1‑98 (MQ=255) cTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGa > 1:1280103/1‑100 (MQ=255) cTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGa > 1:3305917/1‑100 (MQ=255) tCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGAt < 2:2815054/100‑1 (MQ=255) cACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATg > 1:1560518/1‑100 (MQ=255) cACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATg > 2:3151478/1‑100 (MQ=255) cACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGAGATg > 2:1797908/1‑100 (MQ=255) cTGATCCTTGACCCCTCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGtt > 1:923065/1‑100 (MQ=255) cTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGtt > 1:854729/1‑100 (MQ=255) cTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGtt > 2:1764513/1‑100 (MQ=255) cTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGtt < 1:2540647/100‑1 (MQ=255) cTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGtt > 1:2478525/1‑100 (MQ=255) tGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGCTGttt > 2:2100805/1‑100 (MQ=255) gATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTtg < 2:3072162/100‑1 (MQ=255) aaatgacgACCCCGCCGCAGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTtg > 1:2010275/8‑100 (MQ=255) aaatgacaaCCCCGCCGCAGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTtg > 1:40168/9‑100 (MQ=38) aTCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTtgt > 2:3015129/1‑100 (MQ=255) tCCTTGACCCCGCTGTGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTtgtg < 1:3766870/100‑1 (MQ=255) tgacaaCCCCGCCGCAGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTgtgt > 2:3641722/6‑100 (MQ=255) cTTGACCCCACTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGtt > 2:2767397/1‑100 (MQ=255) acaaCCCCGCCGCAGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTa > 2:1329315/4‑100 (MQ=255) acaaCCCCGCCGCAGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTa > 2:1913832/4‑100 (MQ=255) caaCCCCGCCGCAGCGGGTTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGTGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATTTTTgtgt > 2:1684823/3‑97 (MQ=255) caaCCCCGCCGCAGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTAt > 1:3328372/3‑100 (MQ=255) aCCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCt > 2:563842/1‑100 (MQ=255) ccccGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCtt > 1:67059/1‑100 (MQ=255) ccccGCCGCAGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCtt > 1:2142804/1‑100 (MQ=255) cccGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCCAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCttt > 2:3491969/1‑100 (MQ=255) tgctgcGGCTTTGTCATTTGCTTTGCTACAAGTTTTCTCCTCTTTTATCTATTGTGGTTTTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAata < 2:1266123/99‑1 (MQ=255) tGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAatat < 2:1969717/100‑1 (MQ=255) gcggcgGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATAtt > 1:3478605/1‑100 (MQ=255) | ATGAAATATTGGTCCTGGATGGGCGCGTTTTCTCTGTCGATGCTCTTCTGGGCCGAACTCCTCTGGATCATTACTCACTGATCCTTGACCCCGCTGCGGCGGGGTTGTCATTTGCTTTGCCACAAGGTTTCTCCTCTTTTATCAATTTGGGTTGTTATCAAATCGTTACGCGATGTTTGTGTTATCTTTAATATT > NC_000913/1335587‑1335781 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |