| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,946,025 | (A)7→6 | intergenic (‑49/+90) | ruvA ← / ← yobI | component of RuvABC resolvasome, regulatory subunit/uncharacterized protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,946,019 | 0 | A | . | 93.8% | 519.9 / 26.0 | 130 | intergenic (‑43/+96) | ruvA/yobI | component of RuvABC resolvasome, regulatory subunit/uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/7); new base . (63/59); total (64/66) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.22e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
ATTAACACCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGG > NC_000913/1945921‑1946114 | aTTAACACCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATaa > 1:398152/1‑100 (MQ=255) acacCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATaaaaaa < 2:805986/100‑1 (MQ=255) cacCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATaaaaaat < 2:2789008/100‑2 (MQ=255) cacCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATaaaaaat > 1:2362515/1‑99 (MQ=255) ccAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATaaaaaatgc > 1:2633074/1‑97 (MQ=255) ccAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATaaaaaatgc > 2:1867491/1‑97 (MQ=255) ccAGCGGAGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCATAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATaaaaaatgc < 1:1558922/100‑4 (MQ=255) cAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATaaaaaatgct < 1:1177159/100‑5 (MQ=255) aGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTg < 1:270224/100‑1 (MQ=255) aGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTg < 1:1672529/100‑1 (MQ=255) aGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTg > 1:499264/1‑100 (MQ=255) aGCGAGGATTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGATAAAAAA‑AAAAAAATGCTg < 1:2059465/100‑1 (MQ=255) gCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTgg < 2:433964/100‑1 (MQ=255) gCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTgg > 1:2569118/1‑100 (MQ=255) gCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTgg < 1:883573/100‑1 (MQ=255) gCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTgg < 1:523577/100‑1 (MQ=255) ggggTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGgata > 2:2132325/1‑100 (MQ=255) ggggTTG‑TTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGgatag < 2:301901/100‑1 (MQ=255) gggTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGgatag < 2:257122/100‑1 (MQ=255) ggTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGgataga > 2:1206746/1‑100 (MQ=255) ggTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGgataga > 2:91711/1‑100 (MQ=255) gttgttTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCGGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGgataga < 1:1500998/99‑1 (MQ=255) tgttTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGAAAAAAAAAAAAAAAATGCTGgatatcta < 1:598432/100‑5 (MQ=255) tgttTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCAGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGgatagata < 1:1118075/99‑1 (MQ=255) gttTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATc > 2:2820850/1‑100 (MQ=255) tttttCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATcc < 2:1273522/100‑1 (MQ=255) ttttCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCa > 2:2585148/1‑100 (MQ=255) ttCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATATCTATCCAGc < 1:2638659/100‑1 (MQ=255) tCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCg < 1:1134675/100‑1 (MQ=255) tCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCg < 1:1330755/100‑1 (MQ=255) cAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGa > 1:137796/1‑100 (MQ=255) tgatgCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATATCTATCCAGcatttttta < 1:1935810/100‑9 (MQ=255) tgatgCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATg > 1:1069684/1‑100 (MQ=255) gatgCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATATCTATCCAGcatttttatc < 1:2080564/100‑10 (MQ=255) gatgCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATga < 2:1445161/100‑1 (MQ=255) gatgCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGACAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATg > 2:5401/1‑100 (MQ=255) gatgCCTCTGAGTCAGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATga < 1:1834480/100‑1 (MQ=255) atgCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATATCTATCCAGcattttttatc < 1:1821776/100‑11 (MQ=255) atgCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCAGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGA‑AAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATgaa < 1:2751253/100‑1 (MQ=255) tgCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATgaa < 2:2892768/100‑1 (MQ=255) tgCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATgaag > 2:1443419/1‑100 (MQ=255) ctctGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGaaa > 1:1451337/1‑100 (MQ=255) ctctGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGaaa > 1:1271336/1‑100 (MQ=255) tctGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGaaaa > 1:713365/1‑100 (MQ=255) tctGAGTATGCCTATCACATGACACTACTGCGTAATGAATCAAAGAAAAAAAAAAAAAA‑AAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGaaaa < 1:333197/100‑1 (MQ=255) ctGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAAc < 2:385249/100‑1 (MQ=255) tGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAATGATGAAGAAAACTTGCGAg > 2:2578055/1‑100 (MQ=255) tGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAg > 2:2083399/1‑100 (MQ=255) tGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAg < 2:1861452/100‑1 (MQ=255) ccTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCGGTATGAT‑AAAAAATGCTGGAGAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGgt > 2:1584690/1‑100 (MQ=255) cTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAgggg > 2:2284852/1‑98 (MQ=255) aTCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGtc > 2:2159952/1‑100 (MQ=255) aTCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGtc < 1:2526089/100‑1 (MQ=255) aTCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGtc > 1:2471930/1‑100 (MQ=255) aTCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGtc > 2:736560/1‑100 (MQ=255) acaTGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCg > 2:1501906/1‑100 (MQ=255) acaTGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCg > 2:1742164/1‑100 (MQ=255) acaTGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCg > 2:1742174/1‑100 (MQ=255) acaTGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCg < 1:2228003/100‑1 (MQ=255) acaTGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCg < 2:2713063/100‑1 (MQ=255) acaTGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGAAATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCg < 1:1786643/100‑1 (MQ=255) acaTGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTATATAAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCg < 1:1082018/100‑1 (MQ=255) caTGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGa > 2:455740/1‑100 (MQ=255) tGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCTAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATg > 1:1950305/1‑100 (MQ=255) tGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATg > 2:1482489/1‑100 (MQ=255) gACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGa > 2:2008583/1‑100 (MQ=255) cGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAAc < 2:1042109/100‑1 (MQ=255) cTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTg > 2:227696/1‑100 (MQ=255) tCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGa < 2:1271354/100‑1 (MQ=255) tGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGaaaa < 1:2168131/100‑1 (MQ=255) tGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGaaaa < 1:1099569/100‑1 (MQ=255) tAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATgg < 1:2444722/100‑1 (MQ=255) aaTGAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGc > 2:706151/1‑100 (MQ=255) gAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGcaca > 2:123423/1‑100 (MQ=255) gAATCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGcaca > 2:1291263/1‑100 (MQ=255) aTCAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGt < 1:1146447/100‑1 (MQ=255) cAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGtat > 2:2688039/1‑100 (MQ=255) cAAAGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGtat > 1:877235/1‑100 (MQ=255) aaaGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGtata > 2:1101885/1‑100 (MQ=255) aaaGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGtata > 2:2025027/1‑100 (MQ=255) aaaGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGtata < 2:1379536/100‑1 (MQ=255) aaGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATaa < 1:2159925/100‑1 (MQ=255) aGATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAAt > 1:2709852/1‑100 (MQ=255) gATAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAAATGAAAAATGGCACAGTATAAtt < 1:2577235/100‑1 (MQ=255) tAATGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTa < 2:1069698/100‑1 (MQ=255) tGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTc > 2:71313/1‑100 (MQ=255) tGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTc < 2:137799/100‑1 (MQ=255) tGCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTc < 1:617322/100‑1 (MQ=255) gCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCt < 2:713371/100‑1 (MQ=255) gCTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTAGAAtaaattat < 1:1482465/100‑8 (MQ=255) cTGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTa > 2:951535/1‑100 (MQ=255) tGTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTAc < 2:2362545/100‑1 (MQ=255) gTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACa > 2:52453/1‑100 (MQ=255) gTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACa > 2:2026056/1‑100 (MQ=255) gTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACa > 1:1842003/1‑100 (MQ=255) gTATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACa > 1:1841994/1‑100 (MQ=255) tATGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAg < 2:2569151/100‑1 (MQ=255) aTGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGATGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAgg > 2:2752214/1‑100 (MQ=255) aTGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAgg > 1:2470684/1‑100 (MQ=255) aTGAT‑AAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAgg < 2:2188062/100‑1 (MQ=255) | ATTAACACCAGCGGGGGTTGTTTTTCAATGATGATGCCTCTGAGTCTGCCTATCACATGACGCTCCTGCGTAATGAATCAAAGATAATGCTGTATGATAAAAAAATGCTGGATAGATATCCAGCGAAGGATGAAGAAAACTTGCGAGGTGTCTCGATGAACTGAAAAATGGCACAGTATAATTTATTCTACAGG > NC_000913/1945921‑1946114 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |