| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,326,925 | (C)6→7 | coding (817/1185 nt) | atoB → | acetyl‑CoA acetyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,326,919 | 1 | . | C | 95.5% | 301.1 / 8.0 | 88 | coding (811/1185 nt) | atoB | acetyl‑CoA acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (3/1); new base C (41/43); total (44/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.16e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.73e-01 | |||||||||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
AAAGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑CC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACA > NC_000913/2326820‑2327013 | aaaGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTa < 2:2464932/100‑1 (MQ=255)aaaGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTa > 1:166464/1‑100 (MQ=255) aaGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑c > 2:2209776/1‑100 (MQ=255) aGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGTCCTTA‑cc < 2:1526464/100‑1 (MQ=255) aGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑cc > 1:1108579/1‑100 (MQ=255) aGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑cc < 1:745703/100‑1 (MQ=255) ggAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑cc‑cccc > 1:179837/1‑100 (MQ=255) gAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑cc‑ccccc > 1:148392/1‑99 (MQ=255) gAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑cc‑ccccc < 1:365190/100‑2 (MQ=255) aaCAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑cc‑ccccct < 2:1363442/100‑3 (MQ=255) aaCAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑cc‑ccccct < 2:709257/100‑3 (MQ=255) aaCAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑cc‑ccccct > 2:2571141/1‑98 (MQ=255) aCAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑cc‑ccccctg < 2:739718/100‑4 (MQ=255) aGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑cc‑ccccctggc > 2:1428267/1‑95 (MQ=255) aGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑cc‑ccccctggc > 2:1457186/1‑95 (MQ=255) cACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCg > 2:2264511/1‑100 (MQ=255) aCCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGc < 1:1293039/100‑1 (MQ=255) cGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTTCCC‑CCCCTGGCTCGCAt < 2:312819/100‑1 (MQ=255) cGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCAt < 2:1554093/100‑1 (MQ=255) cGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCAt < 1:304207/100‑1 (MQ=255) cGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑CC‑CCCCTGGCTCGCAtt < 2:1097965/100‑1 (MQ=255) gCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCAtt > 1:2118551/1‑100 (MQ=255) cTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTa > 2:2240671/1‑100 (MQ=255) gggAACGCGTCTGGTGTTAAAGACGGTGCTGACGCGCTGTTGATGATTGAAGAATCTGGGTCTCTGTCAGCAGGCCTTA‑CCGCCCCTGGTTCggtttga > 1:2422636/1‑93 (MQ=255) gggAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTaaa < 1:996080/100‑1 (MQ=255) ggAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTaaaa < 1:1739862/100‑1 (MQ=255) ggAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTaaaa < 2:2560512/100‑1 (MQ=255) ggAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTaaaa > 1:257432/1‑100 (MQ=255) gAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAg < 1:864072/100‑1 (MQ=255) aaCGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCTGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGt > 1:846774/1‑100 (MQ=255) aaCGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGt > 2:1900311/1‑100 (MQ=255) cgcgTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTa < 1:1575401/100‑1 (MQ=255) cgTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATg < 1:911871/100‑1 (MQ=255) cgTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATg < 1:2212179/100‑1 (MQ=255) gTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGc < 1:2240644/100‑1 (MQ=255) tCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGcc < 2:1632722/100‑1 (MQ=255) cTGGTATTAACGACTGTGCTGCCGCTCTGGAGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCa > 2:2896027/1‑100 (MQ=255) cTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCa > 1:32469/1‑100 (MQ=255) cTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCa > 1:1095056/1‑100 (MQ=255) ggTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTAGGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAATGTTGTGCCAGc < 1:1528133/100‑1 (MQ=255) gTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCg > 1:2848987/1‑100 (MQ=255) tATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCgg > 1:49161/1‑100 (MQ=255) tATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCgg < 1:1386978/100‑1 (MQ=255) naTTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCgg > 2:550556/2‑100 (MQ=255) tgaaCGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTg > 2:1966348/3‑100 (MQ=255) tAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTgg > 1:2521968/1‑100 (MQ=255) tAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTgg > 2:245785/1‑100 (MQ=255) tAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGAAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAACGTTATGCCAGCGGTgg > 2:1690902/1‑100 (MQ=255) aaCGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGc > 2:1984251/1‑100 (MQ=255) cgGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGcc > 1:1741580/1‑100 (MQ=255) ggTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGccc < 2:539686/100‑1 (MQ=255) gTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCACTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGcccc < 1:2063021/100‑1 (MQ=255) tgctgcCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCACTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGccccc > 2:2043324/1‑100 (MQ=255) ctgcCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGTCAGCGGTGGCGTGCCCCCCg < 1:601055/100‑1 (MQ=255) ctgcCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCg > 1:2481139/1‑100 (MQ=255) tgcCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGc > 2:2291106/1‑100 (MQ=255) gcCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑CC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCAt > 2:1602136/1‑100 (MQ=255) ccGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCAt < 2:2309186/100‑1 (MQ=255) ccGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCAt > 1:1548876/1‑100 (MQ=255) gCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTg > 2:1789079/1‑100 (MQ=255) ctGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATg < 2:2168073/100‑1 (MQ=255) ctGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATg < 2:166466/100‑1 (MQ=255) ctGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATg < 2:1179178/100‑1 (MQ=255) ctGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATg < 2:421274/100‑1 (MQ=255) ctGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCGCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATg < 1:344173/100‑1 (MQ=255) tGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATgg < 1:815693/100‑1 (MQ=255) tGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATgg < 2:2046659/100‑1 (MQ=255) ggTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATggg < 2:2282729/100‑1 (MQ=255) ggTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATG‑CAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGt < 1:349208/100‑1 (MQ=255) gTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGt < 2:1667817/100‑1 (MQ=255) tGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTa > 2:583567/1‑100 (MQ=255) aTTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATg > 2:688376/1‑100 (MQ=255) aTGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATgggg > 2:2673766/1‑100 (MQ=255) tGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGc > 1:246162/1‑100 (MQ=255) ggAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGcc > 2:827300/1‑100 (MQ=255) ggAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGcc < 1:630655/100‑1 (MQ=255) gaagaaTCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCa > 2:807336/1‑100 (MQ=255) gaagaaTCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCa < 1:2264484/100‑1 (MQ=255) gaagaaTCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCa > 1:770742/1‑100 (MQ=255) aagaaTCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAg < 2:148395/100‑1 (MQ=255) aagaaTCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAg < 1:1483733/100‑1 (MQ=255) aagaaTCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAg < 2:2379900/100‑1 (MQ=255) agaaTCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGt > 1:2638370/1‑100 (MQ=255) agaaTCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTG‑CCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTa < 1:1966320/100‑1 (MQ=255) aaTCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTAc < 1:1457163/100‑1 (MQ=255) cTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTg < 2:1384987/100‑1 (MQ=255) tGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGc > 1:1499343/1‑100 (MQ=255) tGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGc > 1:2302108/1‑100 (MQ=255) tGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGc > 2:516069/1‑100 (MQ=255) gcggcgCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGcc < 2:302851/100‑1 (MQ=255) gcggcgCTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGcc < 1:2261097/100‑1 (MQ=255) cgcTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGc < 1:126151/100‑1 (MQ=255) cgcTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGc > 1:893358/1‑100 (MQ=255) gcTGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCa < 1:2481823/100‑1 (MQ=255) tGGCAGCAGGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCaaa > 2:1053299/1‑100 (MQ=255) cagcagGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAg > 2:1133859/1‑100 (MQ=255) cagcagGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAg > 1:2810670/1‑100 (MQ=255) gcagGCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCg > 2:2418761/1‑100 (MQ=255) gCCTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTAc > 1:2657810/1‑100 (MQ=255) ccTTACCC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACa < 2:2118578/100‑1 (MQ=255) | AAAGCAGGAACAGTCACCGCTGGGAACGCGTCTGGTATTAACGACGGTGCTGCCGCTCTGGTGATTATGGAAGAATCTGCGGCGCTGGCAGCAGGCCTTA‑CC‑CCCCTGGCTCGCATTAAAAGTTATGCCAGCGGTGGCGTGCCCCCCGCATTGATGGGTATGGGGCCAGTACCTGCCACGCAAAAAGCGTTACA > NC_000913/2326820‑2327013 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |