| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,652,855 | (G)6→7 | coding (362/846 nt) | sseA → | 3‑mercaptopyruvate sulfurtransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,652,849 | 1 | . | G | 95.5% | 378.6 / 10.4 | 110 | coding (356/846 nt) | sseA | 3‑mercaptopyruvate sulfurtransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (4/1); new base G (48/57); total (52/58) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.87e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
AGGATAAGCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CT‑GG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGTTTAAT > NC_000913/2652750‑2652943 | aGGATAAGCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑Ct > 2:1540393/1‑100 (MQ=255) ggATAAGCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CT‑g > 1:2282046/1‑100 (MQ=255) gATAAGCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CT‑gg < 2:1382266/100‑1 (MQ=255) gATAAGCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CT‑gg < 2:333975/100‑1 (MQ=255) aCCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CT‑Gg‑ggg‑gggg > 2:2797490/1‑100 (MQ=255) cTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CT‑gg‑ggg‑ggtgga < 1:1029310/100‑6 (MQ=255) tGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CT‑gg‑ggg‑gggggac > 2:1086924/1‑94 (MQ=255) gATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACt > 1:32841/1‑100 (MQ=255) gATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACt < 2:1686593/100‑1 (MQ=255) gATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGACCATGGTGGATGCTGCGCAACTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACt > 2:804764/1‑100 (MQ=255) gTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCa < 1:1670040/100‑1 (MQ=255) gTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCa > 1:2811859/1‑100 (MQ=255) cTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAgg < 2:1849614/100‑1 (MQ=255) cTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAgg < 1:1229176/100‑1 (MQ=255) cTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CT‑GG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGc < 1:998110/100‑1 (MQ=255) tATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGc < 1:2111541/100‑1 (MQ=255) tATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGc > 2:821796/1‑100 (MQ=255) tATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCACCAAGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAgg < 2:130671/99‑1 (MQ=255) aTGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCt > 2:1164807/1‑100 (MQ=255) aTGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCt < 1:842561/100‑1 (MQ=255) aTGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCt < 1:552496/100‑1 (MQ=255) tGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTg < 1:2118146/100‑1 (MQ=255) tGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTg < 1:2118102/100‑1 (MQ=255) gACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTgg > 1:1919444/1‑100 (MQ=255) gACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTgg > 1:1406987/1‑100 (MQ=255) aCGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGc < 2:2481024/100‑1 (MQ=255) cGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCa > 1:427507/1‑100 (MQ=255) cGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCAGGGTGGATTCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CT‑GGCGGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCa > 1:2045787/1‑100 (MQ=255) aGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAgcg < 1:1238770/100‑1 (MQ=255) ggTAATATTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAgcg > 1:1691256/1‑99 (MQ=255) gTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGcgcg < 1:1525946/100‑1 (MQ=255) tAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGcgcg > 1:645553/1‑99 (MQ=255) tAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCga < 1:1086908/100‑1 (MQ=255) aTCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCgatg < 1:2311379/100‑1 (MQ=255) aTCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCgatg < 2:1735389/100‑1 (MQ=255) tCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCgatga > 2:1580524/1‑100 (MQ=255) nttttCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCgatgat > 1:450485/2‑100 (MQ=255) cTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCgatgat > 2:2407622/1‑100 (MQ=255) cTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCgatgat > 2:1534115/1‑100 (MQ=255) cTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCgatgat > 2:1534123/1‑100 (MQ=255) cTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGCATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGCGACAGTGTCGCTTCCG‑GG‑GGG‑GTGGACTTGCACGCTGGCAGCGCgatgat > 2:903428/1‑100 (MQ=255) tctcAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATctgc < 1:1237811/100‑1 (MQ=255) tcAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATctgctg < 1:35713/100‑1 (MQ=255) tcAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATctgctg > 2:456086/1‑100 (MQ=255) gCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGtt < 1:815750/99‑1 (MQ=255) gCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTa < 1:456081/100‑1 (MQ=255) gCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTa < 1:2766513/100‑1 (MQ=255) gCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTa < 2:865656/100‑1 (MQ=255) gCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTa > 2:2299786/1‑100 (MQ=255) gCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTa < 1:1540369/100‑1 (MQ=255) gCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTa < 2:555137/100‑1 (MQ=255) ccccACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTag < 1:1336440/100‑1 (MQ=255) ctcACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTaga < 1:1764893/98‑1 (MQ=255) cccACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTaga < 1:504489/100‑1 (MQ=255) ccACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTagaa < 2:2886532/100‑1 (MQ=255) cACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGAAT‑CTGGG‑GGG‑GAGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTagaag > 2:397397/1‑100 (MQ=255) cGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTAGGTGGAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGGAGCGCGATGATCTGCTGTTggaag > 1:1825951/1‑98 (MQ=255) gAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGaagaag < 2:838268/100‑1 (MQ=255) aGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAgg < 1:274300/100‑1 (MQ=255) aGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAgg > 1:683732/1‑100 (MQ=255) aGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAgg < 2:1407783/100‑1 (MQ=255) tggtggATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCa > 1:2472817/1‑100 (MQ=255) tggtggATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCa > 2:1921735/1‑100 (MQ=255) tggtggATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCa > 2:1431231/1‑100 (MQ=255) gtggATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGt < 1:621641/100‑1 (MQ=255) gtggATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGt < 2:1526100/100‑1 (MQ=255) gtggATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGt > 2:2860843/1‑100 (MQ=255) tggATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTa < 1:1536486/100‑1 (MQ=255) ngATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTag > 2:2247364/2‑100 (MQ=255) ggATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTag < 1:2726321/100‑1 (MQ=255) gATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTaga < 2:1013563/100‑1 (MQ=255) aTGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTagag < 1:872575/100‑1 (MQ=255) tgctgcGCACCTTTGGTGTAGAGTAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATTATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTag < 1:1002363/97‑1 (MQ=255) ctgcGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTg < 1:903420/100‑1 (MQ=255) tgcGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGc > 2:1946289/1‑100 (MQ=255) tgcGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGc > 2:2271920/1‑100 (MQ=255) tgcGCACATTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGc > 1:2788068/1‑100 (MQ=255) gcgcACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGcc < 1:877332/100‑1 (MQ=255) gcACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCgg < 1:1796151/100‑1 (MQ=255) cACCTTTGGTGTAGAGATAGTGGCGCTT‑CA‑GG‑GGGTTTGGACTTGCAGGCTGGCAGTGCGATGTTCAGACGTAAGAAAAAGGTGAAGTATAGCTGc > 1:1104840/1‑96 (MQ=255) ttGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGgag < 1:111243/100‑1 (MQ=255) ttGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGgag < 2:544945/100‑1 (MQ=255) ttGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGgag < 1:2075808/100‑1 (MQ=255) ttGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGgag < 1:2292203/100‑1 (MQ=255) gtgtAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGt < 1:1376065/100‑1 (MQ=255) tgtAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGtt > 1:1764024/1‑100 (MQ=255) tgtAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGATGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGtt > 2:141325/1‑100 (MQ=255) ttAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGttt < 2:2723197/99‑1 (MQ=255) gtAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGtt > 2:1094224/1‑99 (MQ=255) tAGAGAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTa > 1:2723161/1‑100 (MQ=255) agagAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTTCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTaa > 2:2473556/1‑100 (MQ=255) agagAAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTaa > 1:1040499/1‑100 (MQ=255) gagaAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAAc > 1:1656542/1‑100 (MQ=255) gagaAAGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAAc < 1:195614/100‑1 (MQ=255) aaaGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAAcgcc > 2:1696836/1‑100 (MQ=255) aaGTGTCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAAcgccg > 2:451193/1‑100 (MQ=255) gtgtCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCcgcg < 1:2860805/100‑1 (MQ=255) gtCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGtt > 2:2829954/1‑100 (MQ=255) tCGATT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGttt > 2:1600508/1‑100 (MQ=255) aTT‑CTGGG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGCTGAACGCCGCGTTTAAt > 2:2863400/1‑100 (MQ=255) | AGGATAAGCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATT‑CT‑GG‑GGG‑GTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGTTTAAT > NC_000913/2652750‑2652943 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |