New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 226704 = | NA (NA) | 13 (0.150) | 6/170 | NT | NA | noncoding (946/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA of rrnH operon |
? | NC_000913 | 226730 = | NA (NA) | noncoding (972/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA of rrnH operon |
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
TCTGGGCCTTCCCACATCGTTTCCCACTTAACCATGACTTTGGGACCTTAGCTGGCGGTCTGGGTTGTTTCCCTCTTCACGACGGACGTTAGCACCCGCCGTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/226806‑226704 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgtgAAGAGGGAAACAACCCAGACCGCCAGCTAAGGTCCCAAAGTCATGGTTAAGTGGGAAACGATGTGGGAAGGCCCAGACAGCCAGGATGTTGGCTTAGAA > NC_000913/226730‑226828 TCTGGGCCTTCCCACATCGTTTCCCACTTAACCATGACTTTGGGACCTTAGCTGGCGGTCTGGGTTGTTTCCCTCTTCACGACGGACGTTAGCACCCGCC > 2:77483/1‑100 TCTGGGCCTTCCCACATCGTTTCCCACTTAACCATGACTTTGGGACCTTAGCTGGCGGTCTGGGTTGTTTCCCTCTTCACGACGGACGTTAGCACCCGCC < 2:401207/100‑1 CTGGGCCTTCCCACATCGTTTCCCACTTAACCATGACTTTGGGACCTTAGCTGGCGGTCTGTGTTGTTTCCCTCTTCACGACGGACGTTAGCACCCGCC > 2:2389378/1‑99 CTGGGCCTTCCCACATCGTTTCCCACTTAACCATGACTTTGGGACCTTAGCTGGCGGTCTGGGTTGTTTCCCTCTTCACGACGGACGTTAGCACCCGCCG > 2:700606/1‑100 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |