| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 228022 | NA (NA) | 21 (0.240) | 11/164 | NT | NA | noncoding (2264/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA of rrnH operon |
| ? | NC_000913 | = 228033 | NA (NA) | noncoding (2275/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA of rrnH operon | |||||
Only 100 of 150 total aligned reads displayed.
GCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/227917‑228022‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctcctccGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACCCACCAGACACTGTCCGCAACCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGG < NC_000913/228033‑227935 GCCTACCGTGATATACCCGCCTTTAATGTTTGATGTTGTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGCGTAGTTTGACTGGGGCGGTC < 2:167735/100‑1GCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTC < 1:327100/100‑1GCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTC > 2:1172399/1‑100GCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTC > 2:1238792/1‑100GCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTC < 1:75008/100‑1GCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTC < 2:1903994/100‑1GCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTC < 1:366457/100‑1GCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTC > 2:2578647/1‑100GCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTC > 1:2343738/1‑100GCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTC < 1:1368794/100‑1GCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTC > 2:277878/1‑100GCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTC < 1:2385578/100‑1 CCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATTTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCT < 2:60340/100‑1 CCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCT < 1:710044/100‑1 CCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCT < 1:2495733/100‑1 CCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCT > 1:2485639/1‑100 CGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTC > 2:166183/1‑100 CGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTC < 2:1502801/98‑1 GACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCTGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCC < 2:1445205/100‑1 GACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGTCAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCC < 1:1833213/100‑1 GACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCC < 1:91349/100‑1 GACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCC > 2:1940145/1‑100 GACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCC < 2:2381622/100‑1 GACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCC < 2:2598082/100‑1 GACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCC > 2:351313/1‑100 GACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCC > 1:1201487/1‑100 GACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCC > 1:1011711/1‑100 ACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCT < 2:893590/100‑1 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CCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGGGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTC > 1:1706798/1‑100 CCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGGTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGTTCTCCTC > 2:2114864/1‑100 CTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTTGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCC < 1:806376/100‑1 CTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCC < 1:2011210/100‑1 CTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCC < 1:1316313/100‑1 CTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCC < 2:2160492/100‑1 CTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCC < 1:781454/100‑1 CTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCC > 2:132399/1‑100 CTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCC < 1:860046/100‑1 CTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCC < 1:293767/100‑1 CTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCC > 2:409587/1‑100 CTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCC < 2:363336/100‑1 CTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCGCCTCC < 2:1859690/100‑1 TGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAATTTGACTGGGACGGTCTCCTCCaa > 1:843977/1‑98 ACCACCTTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCGTTACT < 2:351065/98‑1 CTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCCGTTACTCTTTAGGA < 2:4062/100‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |