| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3313290 | NA (NA) | 8 (0.090) | 6/164 | NT | NA | noncoding (39/77 nt) | REP242 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences | REP242 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences |
| ? | NC_000913 | = 3313328 | NA (NA) | noncoding (77/77 nt) | REP242 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences | REP242 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences | |||||
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
TTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCTTAACGCCGA > NC_000913/3313230‑3313427 | ttCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGa > 2:276955‑M2/1‑99 (MQ=255) cAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGaa > 1:2202291/1‑99 (MQ=255) gttGGAAGGGCTGTTCACGTGGAGCTGATAAGACGCGTCAGAGTCCAATCAGGCAACCGATTCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCTCGCATTGAAcc > 2:2419625/3‑99 (MQ=21) ggTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAAccc > 1:24026/1‑100 (MQ=255) ggTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAAccc < 2:1765003/100‑1 (MQ=255) ggTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAAccc < 1:1347477/100‑1 (MQ=255) ggCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAAcc < 2:2219563/100‑1 (MQ=255) cTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCtt < 2:363184/100‑1 (MQ=255) cTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCtt < 2:363424/100‑1 (MQ=255) tGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTa < 1:2546549/100‑1 (MQ=255) tGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTa < 1:452829/100‑1 (MQ=255) tCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGc < 2:83104/100‑1 (MQ=255) cACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCa > 1:295505/1‑100 (MQ=255) cGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAAt < 2:264119/100‑1 (MQ=255) gTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAACACCTTAAGCAATg < 2:1608492/100‑1 (MQ=255) gTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATg < 1:568952/100‑1 (MQ=255) ttGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATgg < 1:1662903/100‑1 (MQ=255) gACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTa > 1:1260607/1‑100 (MQ=255) aCCTGATAAGGCGCGCCAGCGTGACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCTTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTAc < 2:246649/100‑1 (MQ=255) ccTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACg > 1:2409583/1‑100 (MQ=255) ccTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACg < 2:295502/100‑1 (MQ=255) ccTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACg > 1:2409135/1‑100 (MQ=255) ccTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACg > 1:898871/1‑100 (MQ=255) ccTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACg > 1:2119316/1‑100 (MQ=255) tggtAAGACGCGCCAGCGTCACATCTGGCAATCCATGCCGCATGCAGCGTAACCGCCTTATCCCGCATGGACCCCTCAACACCCTATGTATTGGTTCgca < 2:477772/97‑3 (MQ=19) gATAAGACGCGCCCGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCACATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTg > 2:817535/1‑100 (MQ=255) aaGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGAt > 1:1279580/1‑100 (MQ=255) aGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGAtc < 2:1801581/100‑1 (MQ=255) aGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGAtc < 2:235016/100‑1 (MQ=255) aGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGAtc > 1:1923857/1‑100 (MQ=255) gACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGAtct > 1:1546505/1‑100 (MQ=255) cgcCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCgat < 2:2298172/100‑1 (MQ=255) gcCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCgatg > 1:1610724/1‑100 (MQ=255) gcCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCgatg < 1:1397816/100‑1 (MQ=255) cGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTc > 1:1794503/1‑100 (MQ=255) gTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCg > 2:1497140/1‑100 (MQ=255) tCACATCAGGCGATCCATGCCGGATGCATCTGAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGTATCTCGATGATTTCg < 2:1408184/99‑1 (MQ=255) cacaTCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGaa < 1:922856/100‑1 (MQ=255) cacaTCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGaa < 2:1354375/100‑1 (MQ=255) acaTCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAAt < 2:590642/100‑1 (MQ=255) acaTCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAAt < 1:1726745/100‑1 (MQ=255) acaTCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAAt < 1:523546/100‑1 (MQ=255) tCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTCCGTTGGATCTCGATGATTTCGactact > 2:566266/1‑100 (MQ=255) tCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACt > 2:746627/1‑100 (MQ=255) aGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTc < 2:688604/100‑1 (MQ=255) aGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTc < 2:941131/100‑1 (MQ=255) ggCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCg > 1:583747/1‑100 (MQ=255) ctatcCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacct > 1:1085795‑M2/3‑42 (MQ=255) cAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacct < 1:1651366‑M2/100‑59 (MQ=255) cAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacct < 1:1668252‑M2/100‑59 (MQ=255) cAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGa < 2:1970355/99‑1 (MQ=255) actccATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacctg < 1:2408657‑M2/98‑60 (MQ=255) aagccATGCCGTATTCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCGTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATc < 2:1242064/97‑1 (MQ=255) aaTCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATc > 1:1845832/1‑100 (MQ=255) aaTCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATc < 2:288884/100‑1 (MQ=255) aaTCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATc < 1:1472324/100‑1 (MQ=255) aTCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacctag < 2:1085790‑M2/100‑61 (MQ=255) tCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATcac > 1:1971432/1‑100 (MQ=255) 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> 1:23662/1‑100 (MQ=255) cAGCGTAAACGCCTTAGCCCGCATGTAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGAGTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCgg < 2:2302784/100‑1 (MQ=255) gCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGc > 2:1473568/1‑96 (MQ=255) tAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGAcgtc > 1:1927679/1‑100 (MQ=255) tAAACGCCTTATCCCGCATAGAATCCTAAAAACCTTAAGCAATAGTTCGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGAcg < 2:1616024/98‑1 (MQ=255) cGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTg < 1:1965435/100‑1 (MQ=255) cGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTg < 1:2334691/100‑1 (MQ=255) cTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAg < 1:2514026/100‑1 (MQ=255) ttATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGt > 1:193730/1‑100 (MQ=255) tATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGtt > 1:2477057/1‑100 (MQ=255) tATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGtt > 2:2100610/1‑100 (MQ=255) tATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGt > 2:779642/1‑99 (MQ=255) cccGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCtt > 2:185744/1‑100 (MQ=255) cccGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCtt > 1:166227/1‑100 (MQ=255) cGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCTTaa > 1:2443117/1‑100 (MQ=255) atcttGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCTTaa < 1:199505/96‑1 (MQ=255) gCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCTTAAc < 1:1889316/100‑1 (MQ=255) cATGGattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacctgaaattaattttaaaaaggggctaacagccccttttt > 2:1983221‑M2/1‑5 (MQ=255) aTGGattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacctgaaattaattttaaaaaggggctgttagccccttttta > 2:2001131‑M2/1‑4 (MQ=255) aTGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCTTAACGc < 2:1454112/100‑1 (MQ=255) tGGattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacctgaaattcattttaaaaaggggctgttagcccctttttaa > 1:2467531‑M2/1‑3 (MQ=255) tGGattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacctgaaattaattttaaaaaggggctaacagccccttttttg > 1:2038230‑M2/1‑3 (MQ=255) tGGattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacctgaaattaattttaaaaaggggctaacagccccttttttg < 1:143001‑M2/100‑98 (MQ=255) tGGattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacctgaaattaattttaaaaaggggctaacagccccttttttg > 1:847776‑M2/1‑3 (MQ=255) tGGattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacctgaaattaattttaaaaaggggctaacagccccttttttg > 2:866821‑M2/1‑3 (MQ=255) tGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCTTaaagat > 2:199503/1‑96 (MQ=255) tGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCTTAACGcc < 1:2144404/100‑1 (MQ=255) tGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCTTAACGcc > 1:244784/1‑100 (MQ=255) tGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTGCTTAACGcc < 2:122647/100‑1 (MQ=255) ggattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacctgaaattaattttaaaaaggggctaacagccccttttttgt > 1:179110‑M2/1‑2 (MQ=255) ggattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacctgaaattaattttaaaaaggggctaacagccccttttttgt < 1:1076322‑M2/100‑99 (MQ=255) ggattgactgatgtgacgcttgcgtgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacctgaaattaattttaaaaaggggctgttagccccttttta > 2:2203085‑M2/1‑2 (MQ=255) ggAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCTTAACGCCg > 1:1902176/1‑100 (MQ=255) gattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacctgaaattaattttaaaaaggggctgttagcccctttttaaaa > 1:745388‑M2/1‑1 (MQ=255) gAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCTTAACGCCGa > 1:1143810/1‑100 (MQ=255) | TTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCTTAACGCCGA > NC_000913/3313230‑3313427 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |