Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ NC_000913 3762341–3764074 3765207–3764076 3–2867 34 [33] [32] 36 rhsA Rhs protein with putative toxin 55 domain; putative polysaccharide synthesis/export protein; putative neighboring cell growth inhibitor

TTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGT  >  NC_000913/3762241‑3762362
                                                                                                   |                      
ttCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCt                        <  1:300661/100‑1 (MQ=38)
 tCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTc                       >  2:391163/1‑100 (MQ=38)
  cAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCg                      >  2:1237494/1‑100 (MQ=38)
  cAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCg                      >  1:881314/1‑100 (MQ=38)
   aGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCgg                     >  1:835762/1‑100 (MQ=38)
    gggTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGt                    >  1:67469/1‑100 (MQ=38)
    gggTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGt                    >  1:64088/1‑100 (MQ=38)
     ggTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTg                   <  1:1855674/100‑1 (MQ=38)
     ggTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTg                   <  2:427761/100‑1 (MQ=38)
      gTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCTGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGc                  >  1:1485191/1‑100 (MQ=255)
      gTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGc                  >  1:1221495/1‑100 (MQ=38)
      gTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGc                  <  2:54913/100‑1 (MQ=38)
      gTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGc                  <  1:365982/100‑1 (MQ=38)
      gTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGc                  >  1:308111/1‑100 (MQ=38)
        tCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCaa                <  2:2038705/100‑1 (MQ=38)
         cAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCaaa               <  1:1296622/100‑1 (MQ=38)
         cAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCaaa               >  1:2243561/1‑100 (MQ=38)
         cAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCaaa               >  1:2084582/1‑100 (MQ=38)
          aGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCTGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAg              <  2:1485183/100‑1 (MQ=255)
          aGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAg              >  1:1674118/1‑100 (MQ=38)
           gCCGGGGTGCGCATTGGTGCCTCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAgg             <  2:95532/100‑1 (MQ=25)
           gCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAgg             <  2:1630451/100‑1 (MQ=38)
           gCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAgg             <  1:1432691/100‑1 (MQ=35)
           gCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCAGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAgg             <  1:576694/100‑1 (MQ=255)
            ccGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAg              <  2:2521185/98‑1 (MQ=35)
            ccGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGt            <  2:1527865/100‑1 (MQ=38)
             cGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTc           <  1:1214686/100‑1 (MQ=38)
              ggggTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTcc          <  2:776590/100‑1 (MQ=38)
                ggTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGCCGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCt         >  1:298974/1‑99 (MQ=38)
                 gTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTc       <  2:178796/100‑1 (MQ=35)
                  tGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTcc      <  2:1221490/100‑1 (MQ=35)
                    cgcATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCCGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCg    <  1:2246466/100‑1 (MQ=17)
                     gcATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCgg   >  2:2023455/1‑100 (MQ=31)
                      cATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGt  >  1:1082825/1‑100 (MQ=11)
                                                                                                   |                      
TTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGT  >  NC_000913/3762241‑3762362

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: