| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,157,636 | G→C | 16.0% | intergenic (+62/‑233) | ycfH → / → ptsG | putative DNase/fused glucose‑specific PTS enzymes: IIB component/IIC component |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,157,636 | 0 | G | C | 16.0% | 253.2 / 39.5 | 94 | intergenic (+62/‑233) | ycfH/ptsG | putative DNase/fused glucose‑specific PTS enzymes: IIB component/IIC component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (45/33); new base C (9/6); total (54/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.97e-01 | |||||||||||
TTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACA > NC_000913/1157537‑1157735 | ttCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATTCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCACCGAAAATTg < 2:1533036/100‑1 (MQ=255)ttCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTg > 1:2086622/1‑100 (MQ=255)ttCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTg < 2:581108/100‑1 (MQ=255) tCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTgg < 2:368980/100‑1 (MQ=255) acaTCGACGCTTCCCGTCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGc < 2:2526078/100‑1 (MQ=255) caTCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCg > 2:2417714/1‑100 (MQ=255) caTCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCg > 1:1669192/1‑100 (MQ=255) aTCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCgg > 2:1568154/1‑100 (MQ=255) aTCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCgg > 2:756262/1‑100 (MQ=255) tCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGt < 1:27363/100‑1 (MQ=255) cGACTCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATTAGATTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAATTTCACCGCCCAATTTTCGGCGGTg < 2:981597/100‑1 (MQ=255) cGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTg < 1:1995300/100‑1 (MQ=255) cGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCCAATTTTCGGCGGTg < 2:501632/100‑1 (MQ=255) gACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCCAATTTTCGGCGGTGa < 1:2236749/100‑1 (MQ=255) aCGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGaa < 2:1306544/100‑1 (MQ=255) cGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAAt > 2:2369636/1‑100 (MQ=255) cGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCCAATTTTCGGCGGTGaac < 2:1994273/100‑2 (MQ=38) gCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATa > 1:577177/1‑100 (MQ=255) cTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTATTGTTTGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACGGCCGATAGTTGGGCGGTGAATaa > 2:1685415/1‑100 (MQ=255) cTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCCAATTTTCGGCGGTGaactt < 1:1313865/100‑4 (MQ=38) ttCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCCAATTTTCGGCGGTGaacttt < 1:1098501/100‑5 (MQ=37) cGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACg > 1:1809322/1‑100 (MQ=255) tCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGa > 2:2514693/1‑100 (MQ=255) cAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGaa < 1:1464175/100‑1 (MQ=255) aaTCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAGACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGaaa < 2:259978/100‑1 (MQ=255) aaTCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGaac < 2:802040/100‑2 (MQ=255) atccatcgGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAat > 1:1370780/1‑100 (MQ=255) atccatccGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAat < 1:1737137/100‑1 (MQ=255) ccatccGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACTTTTGAAatat < 2:1041431/100‑1 (MQ=255) ccatccGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAatat < 1:509671/100‑1 (MQ=255) catccGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATAtt > 1:56808/1‑100 (MQ=255) atccGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATtg < 1:297512/100‑1 (MQ=255) tccGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATtgt > 1:1197708/1‑100 (MQ=255) ccGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATtgtg > 1:359348/1‑100 (MQ=255) gTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATAtt > 2:2163347/1‑95 (MQ=255) gTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGAc < 1:2462428/100‑1 (MQ=255) gTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGAc > 2:1854488/1‑100 (MQ=255) gTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAATTCACCGCCGAAAATTGAGCGGAGAATAACCACGTTTGAAATAtt > 2:2163186/1‑95 (MQ=255) ttGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACa < 2:1234707/100‑1 (MQ=255) ttGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACa > 1:1402573/1‑100 (MQ=255) aaTGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACatat < 2:556848/100‑1 (MQ=255) aTGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATg > 2:458425/1‑100 (MQ=255) aTGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATg > 1:2530689/1‑100 (MQ=255) gAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGtt > 1:1920682/1‑100 (MQ=255) gAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGAGAAAACGAGTAAAGTACACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGtt < 1:604563/100‑1 (MQ=255) gttttttttAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTCAAGTTCACCGCCGAAAATTTGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGttt < 2:1422818/98‑1 (MQ=255) gTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTGAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTCGAAATATTGTGACATATGtttt > 2:1393856/1‑100 (MQ=255) tttttttAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTg > 1:891334/1‑100 (MQ=255) tttttAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTc < 2:1439070/100‑1 (MQ=255) aaaGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAAt > 1:491246/1‑100 (MQ=255) aaaGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAAt > 1:1117445/1‑100 (MQ=255) aaaGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAAt < 2:1402566/100‑1 (MQ=255) gCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAAtgtg > 2:985443/1‑100 (MQ=255) gCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTAGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAAtgtg > 1:1732484/1‑100 (MQ=255) gCTCGTAATTAATGGCGAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAAtgtg < 2:787328/100‑1 (MQ=255) tCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCa < 1:2514706/100‑1 (MQ=255) tCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCa > 1:758720/1‑100 (MQ=255) cGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGCAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCaa > 1:2306591/1‑100 (MQ=255) taattaatGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACt < 2:61545/100‑1 (MQ=255) attaatGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTtc < 1:38587/100‑1 (MQ=255) taatGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTtctc > 1:956861/1‑100 (MQ=255) aatGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTcc > 1:2371058/1‑100 (MQ=255) gCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATg > 2:1606866/1‑100 (MQ=255) aaaaCGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATc < 1:2148014/100‑1 (MQ=255) aaaaCGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATc < 1:1403129/100‑1 (MQ=255) aaaCGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCt > 1:197275/1‑100 (MQ=255) aaaCGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCt > 2:1788070/1‑100 (MQ=255) gAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAg > 2:1097826/1‑100 (MQ=255) atctaaGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAgn < 1:473550/96‑2 (MQ=255) gTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGtt > 1:806764/1‑100 (MQ=255) tAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTg < 2:2016092/100‑1 (MQ=255) gttattCACCGCCCAATTTTCGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGa > 2:688220/5‑100 (MQ=37) aaaGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGa < 1:872659/100‑1 (MQ=255) ntattCACCGCCCAATTTTCGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGaa > 2:530903/4‑100 (MQ=38) naGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGtagat > 2:473546/2‑96 (MQ=255) aaGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGaa > 1:1022873/1‑100 (MQ=255) aaGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGaa < 1:756267/100‑1 (MQ=255) attCACCGCCCAATTTTCGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAAc > 2:1070220/2‑100 (MQ=38) attCACCGCCCAATTTTCGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAAc > 1:1375473/2‑100 (MQ=38) attCACCGCCCAATTTTCGGCGGTGAATAAACACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAAc > 1:216009/2‑100 (MQ=38) ttCACCGCCCAATTTTCGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACg > 1:249036/1‑100 (MQ=38) ntCACCGCCCAATTTTCGGCNGTGAATAACCACGTTNGAAATATTGTGANATATGTTTTGTCAAAATGTGCNANTTNTCCANTGNTCTGAAGTTNAAACg > 2:567304/2‑100 (MQ=255) tCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGt > 2:2392234/1‑100 (MQ=255) tCACCGCCCAATTTTCGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGt > 1:121012/1‑100 (MQ=255) cACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTg > 2:2176617/1‑100 (MQ=255) cACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTg < 1:675640/100‑1 (MQ=255) cACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTg < 1:675435/100‑1 (MQ=255) cACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTg > 1:1394268/1‑100 (MQ=255) cACCGCCCAATTTTCGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCAAATGATCTGAAGTTGAAACGTg > 2:2267564/1‑100 (MQ=255) ccgccgAGAATAGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGAt > 2:1363454/1‑100 (MQ=255) ccgccgAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGAt < 1:2225181/100‑1 (MQ=255) ccgccgAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGAt < 2:1547053/100‑1 (MQ=255) gccgAAAGTTGGGCGGTGACTAACCACGGTTGAAATATTGTGACATATGGTTTGTCAAAATGTGCAACATCCCCACTGATCTGAAGTTGAAACGTGATAg > 2:197227/1‑100 (MQ=255) gAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACTTATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTTTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAg > 2:1039174/1‑97 (MQ=255) aaaaTTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGccat > 2:2148939/1‑98 (MQ=255) aaTTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAACTGTGCAACTTCTCAAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCAGTca > 2:2493560/1‑100 (MQ=255) aaTTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTca < 2:294741/100‑1 (MQ=255) tGGGAGGTAAATAACCACGTTTGAAATATTGTGAAATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTTTCCAATGATTTGAATTTGAAACGTGATAGCCGTcaaa < 2:424110/99‑1 (MQ=255) gggCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTcaaaca > 1:1352029/1‑100 (MQ=255) | TTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACA > NC_000913/1157537‑1157735 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |