| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 516,641 | (TGG)4→3 | coding (59‑61/780 nt) | fetB → | iron export ABC transporter permease; peroxide resistance protein |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 516632 | 516634 | 3 | 64 [0] | [1] 64 | fetB | iron export ABC transporter permease; peroxide resistance protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 516635 = | 1 (0.010) | 53 (0.780) | 42/180 | 0.8 | 99.2% | coding (53/780 nt) | fetB | iron export ABC transporter permease; peroxide resistance protein |
| ? | NC_000913 | = 516631 | 0 (0.000) | coding (49/780 nt) | fetB | iron export ABC transporter permease; peroxide resistance protein | |||||
CACATAGCCGACAATAATCAGCTGAATTATCGCTCGCCCGACGCTCCAGAGAATATCTTTCTCCAGCGCCAGTTTTTCTTTATGGCTAATTAAGATTGCCACCACCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/516741‑516635‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ccaccaccaGCATTAATGCCAGTGCTAATGATTCGTTAGTAATATTATGCGAGTTCATAGCGTGCTTCCTGCATTTCTCCGGCATGCGGTTGCAGTGTAATCACTTTA < NC_000913/516631‑516533 ctCATAGCCGACAATAATCAGCTGAATTATCGCTCGCCCGACGCTCCAGAGAATATCTTTCTCCAGCGCCAGTTTTTCTTTATGGCTAATTAAGATTGCC < 1:1100759/98‑1CACATAGCCGACAATAATCAGCTGAATTATCGCTCGCCCGACGCTCCAGAGAATATCTTTCTCCAGCGCCAGTTTTTCTTTATGGCTAATTAAGATTGCC < 2:573389/100‑1 ACATAGCCGACAATAATCAGCTGAATTATCGCTCGCCCGACGCTCCAGAGAATATCTTTCTCCAGCGCCAGTTTTTCTTTATGGCTAATTAAGATTGCCA < 1:957779/100‑1 TAGCCGACAATAATCAGCTGAATTATCGCTCGCCCGACGCTCCAGAGAATATCTTTCTCCAGCGCCAGTTTTTCTTTATGGCTAATTAAGATTGCCACCA > 1:400044/1‑100 TAGCCGACAATAATCAGCTGAATTATCGCTCGCCCGACGCTCCAGAGAATATCTTTCTCCAGCGCCAGTTTTTCTTTATGGCTAATTAAGATTGCCACCA < 1:1465740/100‑1 AGCCGACAATAATCAGCTGAATTATCGCTCGCCCGACGCTCCAGAGAATATCTTTCTCCAGCGCCAGTTTTTCTTTATGGCTAATTAAGATTGCCACCAC > 1:716685/1‑100 GCCGACAATAATCAGCTGAATTATCGCTCGCCCGACGCTCCAGAGAATATCTTTCTCCAGCGCCAGTTTTTCTTTATGGCTAATTAAGATTGCCACCACC > 2:1451251/1‑100 GCCGACAATAATCAGCTGAATTATCGCTCGCCCGACGCTCCAGAGAATATCTTTCTCCAGCGCCAGTTTTTCTTTATGGCTAATTAAGATTGCCACCAC > 2:1665459/1‑99 AATAATCAGCTGAATTATTGCTCGCCCGACGCTCCAGAGAATATCTTTCTCCAGCGCCAGTTTTTCTTTATGGCTAATTAAGATTGCCACCACCAGCATT < 1:10175/100‑1 AATAATCAGCTGAATTATCGCTCGCCCGACGCTCCAGAGAATATCTTTCTCCAGCGCCAGTTTTTCTTTATGGCTAATTAAGATTGCCACCACCAGCATT < 1:1610979/100‑1 ATAATCAGCTGAATTATCGCTCGCCCGACGCTCCAGAGAATATCTTTCTCCAGCGCCAGTTTTTCTTTATGGCTAATTAAGATTGCCACCACCAGCATTA < 1:370820/100‑1 ATAATCAGCTGAATTATCACTCGCCCGACGCTCCAGAGAATATCTTTCTCCAGCGCCAGTTTTTCTTTATGGCTAATTAAGATTGCCACAACCAGCATTA > 1:848875/1‑100 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TGAATTATCGCTCGCCCGTCGCTCCAGAGAATATCTTTCTCCAGCGCCAGTTTTTCTTTATGGCTAATTAAGATTGCCACCACCAGCATTAATGCC < 2:1304535/96‑1 TTATCGCTCGCCCGACGTTCCAGAGAATATCTTTCTCCAGCGCCAGTTTTTCTTTATGGCTATTTAAGATTGCCACCACCAGCATTAATGCCAGTGCTA < 1:807968/99‑1 TTATCGCTCGCCCGACGCTCCAGAGAATATCTTTCTCCAGCGCCAGTTTTTCTTTATGGCTAATTAAGATTGCCACCACCAGCATTAATGCCAGTGCTAA < 1:729988/100‑1 ATCGCTCGCCCGACGCTCCAGAGAATATCTTTCTCCAGCGCCAGTTTTTCTTTATGGCTAATTAAGATTGCCACCACCAGCATTAATGCCAGTGCTAATa < 2:1285122/100‑2 GCTCGCCCGACGCTCCAGAGAATATATTTCTCCAGCGCCAGTTTTTCTTTATGGCTAATTAAGATTGCCACCACCAGCATTAATACCAGTGCTAATGA > 1:656552/1‑98 CTCGCCCGACGCTCCAGAGAATATCTTTCTCCAGCGCCAGTTTTTCTTTATGGCTAATTAAGATTGCCACCACCAGCATTAATGCCAGTGCTAATGATTC < 1:1472767/100‑1 GCCCGACGCTCCAGAGAATATCTTTCTCCAGCGCCAGTTTTTCTTTATGGCTAATTAAGATTGCCACCACCAGCATTAATGCCAGTGCTAATGATTCGTT < 2:1714679/100‑1 GACGCTCCAGAGAATATCTTTCTCCAGCGCCAGTTTTTCTTTATGGCTAATTAAGATAGCCACCACCAGCATTAATGCCAGTGCTAATGATTCGTT < 1:1117111/96‑1 CGCTCCAGAGAATATCTTTCTCCAGCGCCAGTTTTTCTTTATGGCTAATTAAGATTGCCACCACCAGCATTAATGCCAGTGCTAATGATTCGTTAGTAAT < 2:779704/100‑1 CGCTCCAGAGAATATCTTTCTCCAGCGCCAGTTTTTCTTTATGGCTAATTAAGATTGCCACCACCAGCATTAATGCCAGTGCTAATGATTCGTTAGTAAT > 1:1238900/1‑100 CTCCAGAGAATATCTTTCTCCAGCGCCAGTTTTTCTTTATGGCTAATTAAGATTGCCACCACCAGCATTAATGCCAGTGCTAATGATTCGTTAGTAATAT < 1:477860/100‑1 CCAGAGAATATCTTTCTCCAGCGCCAGTTTTTCTTTATGGCTAATTAAGATTGCCACCACCAGCATTAATGCCAGTGCTAATGATTCGTTAGTAATATTA > 2:1778946/1‑100 CCAGAGAATATCTTTCTCCAGCGCCAGTTTTTCTTTATGGCTAATTAAGATTGCCACCACCAGCATTAATGCCAGTGCTAAGGATTCGTTAGTAATATTA > 2:1806890/1‑100 CAGAGAATATCTTTCTCCAGCGCCAGTTTTTCTTTATGGCTAATTAAGATTGCCACCACCAGCATTAATGCCAGTGCTAATGATTCGTTAGTAATATTgt > 1:1101370/1‑98 CAGAGAATATCTTTCTCCAGCGCCAGTTTTTCTTTATGGCTAATTAAGATTGCCACCACCAGCATTAATGCCAGTGCTAATGATTCGTTAGTAATATTAT > 2:227075/1‑100 AGAGAATATCTTTCTCCAGCGCCAGTTTTTCTTTATGGCTAATTAAGATTGCCACCACCAGCATTAATGCCAGTGCTAATGATTCGTTAGTAATATTAT > 2:1340778/1‑99 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GCCAGTTTTTCTTTATGGCTAATTAAGATTGCCACCACCAGCATTAATGCCAGTGCTAATGATTCGTTAGTAATATTATGCGAGTTCATAGCGTGCTTCC < 1:128422/100‑1 TTTATGGCTAATTAAGATTGCCACCACCAGCATTAATGCCAGTGCTAATGATTCGTTAGTAATATTATGCGAGTTCATAGCGTGCTTCCTGCATTTCTCC < 2:716689/100‑1 TTTATGGCTAATTAAGATTGCCACCACCAGCATTAATGCCAGTGCTAATGATTCGTTAGTAATATTATGCGAGTTCATAGCGTGCTTCCTGCATTTCTCC < 2:848881/100‑1 GGCTAATTAAGATTGCCACCACCAGCATTAATGCCAGTGCTAATGATTCGTTAGTAATATTATGCGAGTTCATAGCGTGCTTCCTGCATTTCTCCGGCAT > 1:1257052/1‑100 GCTAATTAAGATTGCCACCACCAGCATTAATGCCAGTGCTAATGATTCGTTAGTAATATTATGCGAGTTCATAGCGTGCTTCCTGCATTTCTCAGGCAT > 2:856619/1‑99 TAATTAAGATTGCCACCACCAGCATTAATGCCAGTGCTAATGATTCGTTAGTAATATTATGCGAGTTCATAGCGTGCTTCCTGCATTTCTCCGGCATGCG < 2:1308883/100‑1 TAATTAAGATTGCCACCACCAGCATTAATGCCAGTGCTAATGATTCGTTAGTAATATTATGCGAGTTCATAGCGTGCTTCCTGCATTTATCCGGCATGCG > 2:90612/1‑100 AATTAAGATTGCCACCACCAGCATTAATGCCAGTGCTAATGATTCGTTAGTAATATTATGCGAGTTCATAGCGTGCTTCCTGCATTTCTCCGGCATGCGG > 1:554650/1‑100 ATTAAGATTGCCACCACCAGCATTAATGCCAGTGCTAATGATTCGTTAGTAATATTATGCGAGTTCATAGCGTGCTTCCTGCATTTCTCCGGCATGCac > 1:882199/1‑97 TAAGATTGCCACCACCAGCATTAATGCCAGTGCTAATGATTCGTTAGTAATATTATGCGAGTTCATAGCGTGCTTCCTGCATTTCTCCGGCATGCGGTTG > 1:260710/1‑100 AAGATTGCCACCGCCAGCATTAATGCCAGTGCTAATGATTCGTTAGTAATATTATGCGAGTTCATAGCGTGCTTCCTGCATTTCTCCGGCATGCGGTTGC < 1:1680754/100‑1 GATTGCCACCACCAGCATTAATGCCAGTGCTAATGATTCGTTAGTAATATTATGCGAGTTCATAGCGTGCTTCCTGCATTTCTCCGGCATGCGGTTGCAG > 1:302146/1‑100 GATTGCCACCACCAGCATTAATGCCAGTGCTAATGATTCGTTAGTAATATTATGCGAGTTCATAGCGTGCTTCCTGCATTTCTCCGGCATGCGGTTGCAG < 2:820043/100‑1 GATTGCCACCACCAGCATTAATGCCAGTGCTAATGATTCGTTAGTAATATTATGCGAGTTCATAGCGTGCTTCCTGCATTTCTCCGGCATGCGGTTGCAG > 2:296584/1‑100 TTGCCACCACCAGCATTAATGCCAGTTCTAATGATTCGTTAGTAATATTATGCGAGTTCATAGCGTGCTTCCTGCATTTCTCCGGCATGCGGTTGCAG < 1:1548983/98‑1 TGCCACCACCAGCATTAATGCCAGTGCTAATGATTCGTTAGTAATATTATGCGAGTTCATAGCGTGCTTCCTGCATTTCTCCGGCATGCGGTTGCAGTGT < 2:490209/100‑1 GCCACCACCAGCATTAATGCCAGTGCTAATGATTCGTTAGTAATATTATGCGAGTTCATAGCGTGCTTCCTGCATTTCTCCGGCATGCGGTTGCAGTGTA < 1:1451240/100‑1 CCACCACCAGCATTAATGCCAGTGCTAATGATTCGTTAGTAATATTATGCGAATTCATAGCGTGCTTCCTGCATTTCTCCGGCATGCGGTTGCAGTGT < 1:608154/98‑1 CCACCAGCATTAATGCCAGTGCTAATGATTCGTTAGTAATATTATGCGAGTTCATAGCGTGCTTCCTGCATTTCTCCGGCATGCGGTTGCAGTGTAATCA > 1:105523/1‑100 CACCAGCATTAATGCCAGTGCTAATGATTCGTTAGTAATATTATGCGAGTTCATAGCGTGCTTCCTGCATTTCTCCGGCATGCGGTTGCAGTGTAATCAC > 1:1115323/1‑100 ACCAGCATTAATGCCAGTGCTAATGATTCGTTAGTAATATTATGCGAGTTCATAGCGTGCTTCCTGCATTTCTCCGGCATGCGGTTGCAGTGTAATCACT > 1:1487650/1‑100 ACCAGCATTAATGCCAGTGCTAATGATTCGTTAGTAATATTATGCGAGTTCATAGCGTGCTTCCTGCATTTCTCCGGCATGCGGTTGCAGTGTAATCACT < 2:1115333/100‑1 ACCAGCATTAATGCCAGTGCTAATGATTCGTTAGTAATATTATGCGAGTTCATAGCGTGCTTCCTGCATTTCTCCGGCATGCGGTTGCAGTGTAATCAC < 1:541309/99‑1 CAGCATTAATGCCAGTGCTAATGATTCGTTAGTAATATTATGCGAGTTCATAGCGTGCTTCCTGCATTTCTCCGGCATGCGGTTGCAGTGTAATCACTTT > 1:1524808/1‑100 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |