| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,679,503 | G→A | F1081F (TTC→TTT) | yphG ← | DUF4380 domain‑containing TPR repeat protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,679,503 | 0 | G | A | 96.7% | 289.6 / ‑1.4 | 90 | F1081F (TTC→TTT) | yphG | DUF4380 domain‑containing TPR repeat protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/1); new base A (46/41); total (48/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTCAATTCAGCGCGAGCAGACTCATATTGCGCAACCTCCCCGAGTCCCGCGGACGCCAG > NC_000913/2679407‑2679598 | tAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAaat > 1:940579/1‑100 (MQ=255)tAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACACGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAaat > 2:110724/1‑100 (MQ=255) aaTTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAaata < 2:693275/100‑1 (MQ=255) ctgtaatatttgaGCGGCA‑CGCGCTGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATg > 2:1741464/11‑100 (MQ=25) attTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAATTAATAAGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGc > 1:1042218/1‑100 (MQ=255) ttttGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGcc < 2:1594255/100‑1 (MQ=255) ttttGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCAGCTCAAATATTACAGTTAAGAGGGTTTAGTGAAAGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGc < 1:1347885/99‑1 (MQ=255) tttGTTATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCg < 2:197171/100‑1 (MQ=255) ttGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGATGAATAATGCCGc > 2:10862/1‑100 (MQ=255) tgatgaGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCttt > 2:881585/1‑100 (MQ=255) tgatgaGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCttt > 2:172108/1‑100 (MQ=255) tgatgaGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCttt > 1:1574292/1‑100 (MQ=255) tgatgaGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCtt > 2:488894/1‑99 (MQ=255) tttgaGCGGCA‑CGCGCTGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTc > 2:470070/3‑100 (MQ=255) gatgaGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTc < 2:1495379/100‑1 (MQ=255) ttgaGCGGCA‑CGCGCTGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCg > 2:1027393/2‑100 (MQ=255) attaGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCg > 1:336389/4‑100 (MQ=255) tgactggCAGCGCG‑TTCTGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGTACTCAGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCg < 1:445598/94‑1 (MQ=255) tgaGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCgg < 1:913497/100‑1 (MQ=255) gCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCa < 2:390984/100‑1 (MQ=255) gCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCa > 1:1409500/1‑100 (MQ=255) gCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCa > 2:875065/1‑100 (MQ=255) gCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCa > 2:621240/1‑100 (MQ=255) cGGCAGCGCG‑TGCTGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCa < 2:1510128/99‑1 (MQ=255) cGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGTTAAATAATGCCGCTTTCGGc < 1:376351/97‑1 (MQ=255) ggCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCaa > 1:244437/1‑99 (MQ=255) ggCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAg < 2:787029/100‑1 (MQ=255) gtaGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACTCGGTTAAAAATAAAAGGCTTCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGcc < 1:522424/94‑1 (MQ=255) gCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAg < 1:1779032/99‑1 (MQ=255) aGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCa < 1:212743/95‑1 (MQ=255) gcgcG‑TGCCGCTCAAATATTACAGATAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAATCCgg > 1:422253/1‑100 (MQ=255) cg‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGAtt > 2:1747021/1‑100 (MQ=255) cg‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGAtt > 2:1613062/1‑100 (MQ=255) g‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGAtt < 1:881579/99‑1 (MQ=255) tGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTaa > 2:1507505/1‑100 (MQ=255) tcgttCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATc < 1:1149409/96‑1 (MQ=255) ccGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATc > 1:184844/1‑100 (MQ=255) cAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGt < 2:1317074/100‑1 (MQ=255) cAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGt > 1:1816846/1‑100 (MQ=255) cAAATATGACAGTTAATAGGGTTTTGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTTGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCg < 1:1603341/96‑1 (MQ=255) aaaTATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTc < 2:1504881/100‑1 (MQ=255) aaaTATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGC‑TTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTc < 1:518305/99‑1 (MQ=255) aaTATTAAAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTc < 1:260449/99‑1 (MQ=255) ttACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCACAGTCAAt > 2:1141343/1‑98 (MQ=255) tACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTCAATTCa > 2:1665230/1‑100 (MQ=255) aCAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTCAATTCAg < 2:505980/100‑1 (MQ=255) cgattAATAGGGTTTAGTTAACTCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTCAATTCAgc < 1:943010/97‑1 (MQ=255) aGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTCAATTCAgcg > 1:782780/1‑100 (MQ=255) aGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTCAATTCAgcg > 1:355559/1‑100 (MQ=255) gTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTCAATTCAgcgc > 2:858379/1‑100 (MQ=255) gTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTCAATTCAgcgc > 2:72581/1‑100 (MQ=255) gTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGATAAAAATAAAAGGCAGCACGGTGGTAAATAATGCCGTTTTCGGCCAAGCCGGAATAATCTCAGTCGATTCAgcg > 1:1307028/1‑99 (MQ=255) ttAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTCAATTCAGcgcg < 2:1299813/100‑1 (MQ=255) tAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATACCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCGGTCAATTCAGCGCGa > 1:322024/1‑100 (MQ=255) tAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTCAATTCAGCGCGAGc < 1:725048/99‑1 (MQ=255) tAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTCAATTCAGCGCGAGCa > 2:809464/1‑100 (MQ=255) gTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCTTTATGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTCAATTCAGCGCGAGCAGACt < 2:38817/100‑1 (MQ=255) gTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTCAATTCAGCGCGAGCAGACt < 1:1417600/100‑1 (MQ=255) gTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTCAATTCAGCGCGAGCAGACt > 1:1252628/1‑100 (MQ=255) gTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTCAATTCAGCGCGAGCAGACt > 1:1671234/1‑100 (MQ=255) tttAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGCTTAATCGCCGTCAATTCAGCGCGAGCAGAcac > 2:703124/1‑98 (MQ=255) tttAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTCAATTCAGCGCGAGCAGACTc < 2:1090706/100‑1 (MQ=255) tttAGTGAACGCCGTTAAAAATAAACGGCATCGCGCTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAACCCGTATTAATCGCCGTTAATTCAGCGCGAGCAGAATc < 1:752645/100‑1 (MQ=255) tttAGCGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCAGATTAATCGCCGTCAATTCAGCGCGAGCAGACTc < 1:1507494/100‑1 (MQ=255) tAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTCAATTCAGCGCGAGCAGACTCat > 1:126025/1‑100 (MQ=255) aGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTCAATTCAGCGCGAGCAGACTCata > 1:39466/1‑100 (MQ=255) aaCGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTCAATTCAGCGCGAGCAGACTCATATTgc < 2:756646/100‑1 (MQ=255) cgcgGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTCAATTCAGCGCGAGCAGACTCATATTgcgc > 1:361355/1‑100 (MQ=255) cgcgGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGATTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTCAATTCAGCGCGAGCAGACTCATATTgcgc < 1:1271587/100‑1 (MQ=255) cgGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTCAATTCAGCGCGAGCAGACTCATATTGCGCaa > 2:724809/1‑100 (MQ=255) ggTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTCAATTCAGCGCGAGCAGACTCATATTGCGCAAc < 1:675475/100‑1 (MQ=255) gTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTCAATTCAGCGCGAGCAGACTCATATTGCGCAAcc < 2:1353027/100‑1 (MQ=255) ttAAAAATAAAAGGCTTCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTCAATTCAGCTCGAGCAGACTCATATTGCGCa < 1:1540669/96‑1 (MQ=255) ttAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTATATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGTATTAATCTCCTTCAATTTAGTTTTTGTAGACTCATATTGCGaaa < 1:448415/97‑1 (MQ=255) ttAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTCAATTCAGCGCGAGCAGACTCATATTGCGCAACCt < 2:1750565/100‑1 (MQ=255) tgaaaaaTAAAAGACATCACGGTGGTAAATAGTGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTCAATTCAGCGCGAGCAGACTCATATTGCGCAACCt > 2:1227026/3‑100 (MQ=255) tAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTCAATTCAGCGCGAGCAGACTCATATTGCGCAACCTc > 1:477806/1‑100 (MQ=255) tAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTCAATTCAGCGCGAGCAGACTCATATTGCGCAACCTc > 2:1332838/1‑100 (MQ=255) aaaaTAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTCAATTCAGCGCGAGCAGACTCATATTGCGCAACCTccc > 2:139039/1‑100 (MQ=255) aaaTAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTCAATTCAGCGCGAGCAGACTCATATTGCGCAACCTcccc < 2:1115260/100‑1 (MQ=255) aaaTAAAAGGCATCACGGTAGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTCAATTCAGCGCGAGCAGACTAATATTGCGCAACATcccc < 1:1420369/100‑1 (MQ=255) aaTAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTCAATTCAGCGCGAGCAGACTCATATTGCGCAACCTCCCCg > 1:1247907/1‑100 (MQ=255) tAAAAGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTCAATTCAGCGCGAGCAGACTCATATTGCGCAACCTCCCCGAg < 1:1775261/100‑1 (MQ=255) aaaaGGCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTCAATTCAGCGCGAGCAGACTCATATTGCGCAACCTCCCCGAGt < 1:1741451/100‑1 (MQ=255) ggCATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTCAATTCAGCGCGAGCAGACTCATATTGCGCAACCTCCCCGAGTCCcg > 2:725962/1‑100 (MQ=255) cATCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTCAATTCAGCGCGAGCAGACTCATATTGCGCAACCTCCCCGAGTCCcgcg > 2:1368315/1‑100 (MQ=255) tCACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTCAATTCAGCGCGAGCAGACTCATATTGCGCAACCTCCCCGAGTCCCGCGGa > 2:1400896/1‑100 (MQ=255) cACGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTCAATTCAGCGCGAGCAGACTCATATTGCGCAACCTCCCCGAGTCCCGCGGAc < 1:772900/100‑1 (MQ=255) cGGTGGTAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTCAATTCAGCGCGAGCAGACTCATATTGCGCAACCTCCCCGAGTCCCGCGGACGc > 2:720946/1‑100 (MQ=255) ggtggtAAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTCAATTCAGCGCGAGCAGACTCATATTGCGCAACCTCCCCGAGTCCCGCGGACGcc > 2:1396176/1‑100 (MQ=255) tggtaAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTCAATTCAGCGCGAGCAGACTCATATTGCGCAACCTCCCCGAGTCCCGCGGACGCCa < 1:101145/99‑1 (MQ=255) tggtaAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTCAATTCAGCGCGAGCAGACTCATATTGCGCAACCTCCCCGAGTCCCGCGGACGCCAg < 1:1027383/100‑1 (MQ=255) | TAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGGATTAATCGCCGTCAATTCAGCGCGAGCAGACTCATATTGCGCAACCTCCCCGAGTCCCGCGGACGCCAG > NC_000913/2679407‑2679598 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |