New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 4636324 = | 74 (0.910) | 3 (0.040) | 3/164 | NT | 4.3% | coding (318/690 nt) | creB | response regulator in two‑component regulatory system with CreC |
? | NC_000913 | 4636375 = | 64 (0.850) | coding (369/690 nt) | creB | response regulator in two‑component regulatory system with CreC | |||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
TCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTG > NC_000913/4636225‑4636423 | gtcagcgctaatggcgtgtcaaaccagctgatctgcgccgcgggttcattcaattcaaaatgtccaatacggatgacgggagacggcgtcgagaacttct > 2:1763263‑M1/100‑100 (MQ=255) ccGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGttt < 2:2248814/99‑1 (MQ=255) ccgatctACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTc < 1:1704160/94‑1 (MQ=255) cagcgctaatggcgtgtcaaaccagctgatctgcgccgcgggttcattcacttcaaaacgtccaatacggatgacgggagccggcgtcgagaacttcttc < 2:1785582‑M1/3‑1 (MQ=255) cGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTc < 1:1164799/100‑1 (MQ=255) gcgctaatggcgtgtcaaaccagctgatctgcgccgcgggttcattcaattcaaaatgtccaatacggatgacgggagacggcgtcgagaacttcTTCAc > 1:31497‑M1/96‑100 (MQ=255) gcgctaatggcgtgtcaaaccagctgatctgcgccgcgggttcattcaattcaaaatgtccaatacggatgacgggagacggcgtcgagaacttcTTCAc < 2:1664595‑M1/5‑1 (MQ=255) gctaatggcgtgtcaaaccagctgatctgcgccgcgggttcattcaattcaaaatgtccaatacggatgacgggagacggcgtcgagaacttcTTCAccc > 2:1708185‑M1/94‑100 (MQ=255) gTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCAccc > 1:1195384/1‑100 (MQ=255) aCCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCagatgga > 2:1704149/1‑94 (MQ=255) ccTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCcgcg > 1:929099/1‑100 (MQ=255) cTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCAcccgacgc > 2:183756/1‑95 (MQ=255) cTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGa < 2:1467278/100‑1 (MQ=255) tACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAgt < 2:863287/100‑1 (MQ=255) aCTGTTCCTGTCGGCTCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAgtg < 2:1584757/100‑1 (MQ=255) cTGTTCCTGACGGCCTGAAATAAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGTGCTGGAAGTTGGTGCGGACGACTACGTTGATATACCGTTTTCACCCCGCGAAg < 2:1449064/97‑1 (MQ=255) cTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGGCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGGGCTGACGACGACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAgtgt > 1:1566588/1‑100 (MQ=255) tGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGtgtg < 2:1810743/100‑1 (MQ=255) gTTCCTGACTGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTgc < 1:95155/100‑1 (MQ=255) gTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTgc > 1:2053917/1‑100 (MQ=255) tCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCAACCTGCGAAgtgt > 2:1415796/1‑96 (MQ=255) ccTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGcc > 1:1785594/1‑100 (MQ=255) tGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAg > 1:1983202/1‑100 (MQ=255) gACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAgg > 1:2064673/1‑100 (MQ=255) gACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAgg > 1:2240984/1‑100 (MQ=255) gACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAgg > 1:1437787/1‑100 (MQ=255) aCGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAggg < 1:325570/100‑1 (MQ=255) cGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCa < 1:831897/100‑1 (MQ=255) cGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCa < 2:108139/100‑1 (MQ=255) cGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAAACGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCa > 1:2022231/1‑100 (MQ=255) gAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGTCGACTACGTGGCTGAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCAc < 2:1798354/100‑1 (MQ=255) gTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCtt > 1:1620900/1‑100 (MQ=255) gAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGCAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTAc > 1:94947/1‑100 (MQ=255) gagGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGc > 1:2027825/1‑100 (MQ=255) agGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCg > 1:665930/1‑100 (MQ=255) agGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCg > 2:19840/1‑100 (MQ=255) ggTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACTCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTACGCACCTTACTGCGt > 2:311490/1‑100 (MQ=255) ggTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGt > 1:987455/1‑100 (MQ=255) gTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTc > 1:321652/1‑100 (MQ=255) gTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTc < 1:484816/100‑1 (MQ=255) gTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTc > 1:992751/1‑100 (MQ=255) gTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTc < 1:2019008/100‑1 (MQ=255) gATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCggg < 2:1569975/100‑1 (MQ=255) aTCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCggg < 1:555996/99‑1 (MQ=255) tCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTg < 1:135155/100‑1 (MQ=255) tcaattcaaaatgtacaatacggttgacgggagacggcgtcgagaacttcTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTga > 1:225153‑M1/51‑100 (MQ=255) gCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCAGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTgaa > 2:1431923/1‑100 (MQ=255) caattcaaaatgtccaatacggatgacgggagacggcgtcgagaacttcTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTgaa > 2:2152053‑M1/50‑100 (MQ=255) aattcaaaatgtccaatacggatgacgggagacggcgtcgagaacttcTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTgaag > 1:1999400‑M1/49‑100 (MQ=255) tGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTgaagaa < 1:745816/100‑1 (MQ=255) cTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGt < 1:1634382/100‑1 (MQ=255) tGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTtc > 1:238509/1‑100 (MQ=255) tGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTtc > 1:1051424/1‑100 (MQ=255) ggCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTtctc > 1:329383/1‑100 (MQ=255) gCTGGAAATTGGTGATGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCACGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCg < 1:1113521/100‑1 (MQ=255) tGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGAc > 2:520424/1‑100 (MQ=255) tGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGAc > 2:520423/1‑100 (MQ=255) tGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGAc > 2:136112/1‑100 (MQ=255) ggAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCAACCCGCGAAGTGTGCGCCAGTGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACg < 2:915953/100‑1 (MQ=255) gAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGc > 2:1858393/1‑100 (MQ=255) aaaTTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGcc < 2:42083/100‑1 (MQ=255) aTTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGt < 2:1195380/100‑1 (MQ=255) aTTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGt < 2:238549/100‑1 (MQ=255) ttGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGtc > 2:1912985/1‑100 (MQ=255) tGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGtct > 1:825566/1‑100 (MQ=255) gCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCg < 2:2044483/100‑1 (MQ=255) gCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCg > 1:2161351/1‑100 (MQ=255) tGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTc > 1:1769930/1‑100 (MQ=255) cgacTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATc < 2:1462930/100‑1 (MQ=255) tACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTa < 1:91429/100‑1 (MQ=255) aCGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTAt > 2:1709618/1‑100 (MQ=255) aCGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTAt > 2:21920/1‑100 (MQ=255) aCGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGATCTCAACGACATCTCCCGTCAtaagta > 1:1731153/1‑94 (MQ=255) cGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTAtt > 1:687906/1‑100 (MQ=255) gTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTg < 1:687857/100‑1 (MQ=255) gTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTg < 2:929097/100‑1 (MQ=255) tGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTgg < 2:1887054/100‑1 (MQ=255) ggCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGa > 1:1363141/1‑100 (MQ=255) cTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACa > 1:1841559/1‑100 (MQ=255) cTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACa > 1:2022478/1‑100 (MQ=255) cTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACa > 1:2180797/1‑100 (MQ=255) tAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCCTCGGTATTGGACAt > 2:301465/1‑100 (MQ=255) aaaCCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACAtt > 1:733939/1‑100 (MQ=255) aaaCCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACAtt > 1:881921/1‑100 (MQ=255) aaCCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGAc > 2:228382/1‑96 (MQ=255) aaCCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACAttt > 1:138136/1‑100 (MQ=255) ccGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTttg < 1:235732/100‑1 (MQ=255) ccGTTTTCACCCCGCCAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTttg < 2:1543805/100‑1 (MQ=255) gTTTTCACCCGGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTttga < 2:763407/99‑1 (MQ=255) tttCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTttgaatt > 1:35653/1‑100 (MQ=255) TTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTttgaattg < 2:430913‑M1/100‑1 (MQ=255) TTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTttgaattg > 2:1437777‑M1/1‑100 (MQ=255) | TCCGGCGTTACCTGTACTGTTCCTGACGGCCCGAAGTGAAGAGGTCGATCGCCTGCTTGGGCTGGAAATTGGTGCTGACGACTACGTGGCTAAACCGTTTTCACCCCGCGAAGTGTGCGCCAGGGTGCGCACCTTACTGCGTCGGGTGAAGAAGTTCTCGACGCCGTCTCCCGTCATCCGTATTGGACATTTTGAATTG > NC_000913/4636225‑4636423 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |