| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 377335 = | NA (NA) | 7 (0.090) | 3/164 | NT | NA | noncoding (1/187 nt) | REP32 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 4 REP sequences | REP32 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 4 REP sequences |
| ? | NC_000913 | 377368 = | NA (NA) | noncoding (34/187 nt) | REP32 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 4 REP sequences | REP32 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 4 REP sequences | |||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
CGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCCA > NC_000913/377236‑377433 | cgcgcTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATg < 1:889673/100‑1 (MQ=255)cctgataatacgcgcaaagcgtcgcatcaggcatggcgcacgactgccggatgcggcgtgaacgccttatccggtctacacttcgcccataaaccgtagg > 1:742094‑M1/100‑100 (MQ=255)cctgataagacgcgcaaagcgtcgcatcaggcatggcgcacgactgccggatgcggcgtgaacgccttatccggtctacacttcgcccataaaccgtagg > 1:1884388‑M1/100‑100 (MQ=255)cctgataagacgcgcaaagcgtcgcatcaggcatggcgcacgactgccggatgcggcgtgaacgccttatccggtctacacttcgcccataaaccgtagg < 1:1467983‑M1/1‑1 (MQ=255) ctgataagacgcgcaaagcgtcgcatcaggcatggcgcacgactgccggatgcggcgtgaacgccttatccggtctacacttcgcccataaaccgtagg > 1:2126510‑M1/99‑99 (MQ=255) cgcTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGcc < 1:1111462/100‑1 (MQ=255) gcTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGcc > 2:1014241/1‑99 (MQ=255) gataagacgcgcaaagcgtcgcatcaggcatggcgcacgactgccggatgcggcgtgaacgccttatccggtctacacttcgcccataaaccgtagGCCt < 1:1875801‑M1/4‑1 (MQ=255) gataagacgcgcaaagcgtcgcatcaggcatggcgcacgactgccggatgcggcgtgaacgccttatccggtctacacttcgcccataaaccgtagGCCt < 1:1927754‑M1/4‑1 (MQ=255) gataagacgcgcaaagcgtcgcatcaggcatgcgcacgactgccggatgcggcgtgaacgccttatccggtctacacttcgcccataaaacgtagGCCTg < 2:2217137‑M1/5‑1 (MQ=255) cTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCt < 2:1357236/99‑1 (MQ=255) ataagacgcgcaaagcgtcgcatcaggcatgtcgcacgactgccggatgcggcgtgaacgccttatccggtctacacttcgcccataaaccgtagGCCt < 2:77780‑M1/4‑1 (MQ=255) aagacgcgcaaagcgtcgcatcaggcatggcgcacgactgccggatgcggcgtgaacgccttatccggtctacacttcgcccataaaccgtagGCCTGAt > 2:14927‑M1/94‑100 (MQ=255) aagacgcgcaaagcgtcgcatcaggcatggcgcacgactgccggatgcggcgtgaaagccttatccggtctacacttcgcccataaaccgtagGCCTGAt < 2:1437847‑M1/7‑1 (MQ=255) gcgcCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGc < 1:2157153/100‑1 (MQ=255) gcgcCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGc > 2:903102/1‑100 (MQ=255) cgcCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCg > 1:1420446/1‑100 (MQ=255) cgcCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCg < 2:203300/100‑1 (MQ=255) ccGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGAc > 1:2175371/1‑100 (MQ=255) cGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGAc > 1:1214921/1‑99 (MQ=255) gCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGAGGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGAAGATGCCTAATGCGACGCTAt > 2:2122609/1‑98 (MQ=255) cAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATgcg < 2:1728067/100‑1 (MQ=255) aGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATgcgc > 1:805414/1‑100 (MQ=255) ggATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATgcgc > 2:2106362/1‑99 (MQ=255) ggATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGcgcg > 2:125308/1‑100 (MQ=255) ggATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGcgcg < 1:781693/100‑1 (MQ=255) ggATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGcgcg > 2:423681/1‑100 (MQ=255) gATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGt > 1:1761943/1‑100 (MQ=255) gATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGt > 1:1557859/1‑100 (MQ=255) aTGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTc < 1:1010367/100‑1 (MQ=255) tGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCt > 1:178114/1‑100 (MQ=255) aaGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTa > 1:1293680/1‑100 (MQ=255) aGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGCGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTAt > 1:928729/1‑100 (MQ=255) gacgacCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATc > 2:159056/1‑100 (MQ=255) gcatggcgcacgactgccggatgcggcgtgaacgccttatccggtctacacttcgcccataaaccgtagGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAg > 1:55064‑M1/70‑100 (MQ=255) cgacCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAg < 1:1918878/100‑1 (MQ=255) cgacCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAg < 1:1999992/100‑1 (MQ=255) cgacCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAg > 2:1450732/1‑100 (MQ=255) gacCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAgg > 1:394287/1‑100 (MQ=255) taatagcacgactgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacacttcgcccgtaagccgtagGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGc > 1:2190918‑M1/68‑100 (MQ=255) atggcgcacgactgccggatgcggcgtgaacgccttatccggtctacacttcgcccataaaccgtagGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGc > 1:1838943‑M1/68‑100 (MQ=255) atggcgcacgactgccggatgcggcgtgaacgccttatccggtctacacttcgcccataaaccgtagGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGc > 1:1586897‑M1/68‑100 (MQ=255) atggcgcacgactgccggatgcggcgtgaacgccttatccggtctacacttcgcccataaaccgtagGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGc > 2:762314‑M1/68‑100 (MQ=255) acCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGTAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAgg < 2:1522505/99‑1 (MQ=255) tggcgcacgactgccggatgcggcgtgaacgccttatccggtctacacttcgcccataaaccgtagGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGcc > 1:85937‑M1/67‑100 (MQ=255) tggcgcacgactgccggatgcggcgtgaacgccttatccggtctacacttcgcccataaaccgtagGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGcc > 1:380944‑M1/67‑100 (MQ=255) cccGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGcc > 1:1059610/1‑100 (MQ=255) cccGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGcc > 1:1330924/1‑100 (MQ=255) cGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTa > 2:1147461/1‑100 (MQ=255) cGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCACAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCt > 2:1811212/1‑99 (MQ=255) tGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACg > 1:163842/1‑98 (MQ=255) tGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGt > 2:110279/1‑100 (MQ=255) tGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGt > 2:1886024/1‑100 (MQ=255) gCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTTATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATTCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGtt < 2:751113/100‑1 (MQ=255) gCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACggat > 1:1433735/1‑98 (MQ=255) gCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGtt > 1:251473/1‑100 (MQ=255) ccGACTTCAAAGTGGCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGCTGCCTGATGCGCCGCTCTGCGCGTATTATAAGGCCTAAGGttt > 2:1568376/1‑100 (MQ=255) ccGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGttt < 1:1797395/100‑1 (MQ=255) cGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTa < 1:1860552/100‑1 (MQ=255) cGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTa > 1:1376974/1‑100 (MQ=255) cGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTa > 2:690011/1‑100 (MQ=255) gACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAt < 2:816431/100‑1 (MQ=255) aCTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGTGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATg < 2:429762/100‑1 (MQ=255) cTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATgg < 1:110279/100‑1 (MQ=255) cTTCAAAGTGCATGATGATTTGACGTGGTAAAAATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGAATTATg > 1:1902547/1‑99 (MQ=25) ttCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATggg < 1:1140293/100‑1 (MQ=255) tCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGc > 2:515891/1‑100 (MQ=255) aaaGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGa < 1:1605558/100‑1 (MQ=255) aaaGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGAGCGa > 1:1223231/1‑100 (MQ=255) aGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAg < 2:2175356/100‑1 (MQ=255) gTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAgt < 1:1935060/100‑1 (MQ=255) ccTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTa < 1:2067126/100‑1 (MQ=255) ccTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTa < 1:3924/100‑1 (MQ=255) ccTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTa > 2:1443735/1‑100 (MQ=255) tgatTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCg < 2:1786064/100‑1 (MQ=255) atTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGa > 1:1208369/1‑100 (MQ=255) tttGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGAt < 1:2116951/100‑1 (MQ=255) ttGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATa > 2:1337104/1‑100 (MQ=255) gATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAg < 1:426838/100‑1 (MQ=255) tgtgGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGc < 2:140116/100‑1 (MQ=255) gtgGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCg > 1:1180925/1‑100 (MQ=255) gtgGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCg > 1:59394/1‑100 (MQ=255) ggTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGAtgcggcgtg > 1:191418/1‑92 (MQ=255) ggTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATCAGGCGtt > 2:258267/1‑100 (MQ=255) ggTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGtt > 1:1445433/1‑100 (MQ=255) ggTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGtt > 1:63751/1‑100 (MQ=255) ggTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGtt > 1:2173009/1‑100 (MQ=255) gTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTc < 2:1553536/100‑1 (MQ=255) tAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCa > 2:1958397/1‑100 (MQ=255) cATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCAcgcc < 1:1590288/100‑1 (MQ=255) tggATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCAcgccgc > 1:1774897/3‑100 (MQ=255) aGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGAAGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCa < 2:325861/100‑1 (MQ=255) gATATGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGAAGCTATGCGCGTATTAGCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCAGATAAGGCGTTCACGCCGCa > 2:1105104/1‑99 (MQ=18) gTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGc < 1:1786638/100‑1 (MQ=255) cGTGCGCAGATGCGTGATGCGACGCTAGGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACTGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCa < 2:36539/99‑1 (MQ=17) cGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGACCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAg > 2:455917/1‑100 (MQ=255) cgcAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGt > 1:812541/1‑100 (MQ=255) gcAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTg < 1:205583/100‑1 (MQ=255) aGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTgcg < 2:178114/100‑1 (MQ=255) tGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCCa < 2:855588/100‑1 (MQ=255) | CGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCCA > NC_000913/377236‑377433 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |