| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3313290 | NA (NA) | 7 (0.090) | 5/164 | NT | NA | noncoding (39/77 nt) | REP242 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences | REP242 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences |
| ? | NC_000913 | = 3313328 | NA (NA) | noncoding (77/77 nt) | REP242 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences | REP242 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences | |||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
TTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCTTAACGCCGA > NC_000913/3313229‑3313427 | tttCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGG > 1:2222074‑M2/1‑100 (MQ=255)tttCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGG > 1:1366590‑M2/1‑100 (MQ=255)tttCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGG < 2:1252508‑M2/100‑1 (MQ=255) tCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGaa < 1:1680833/100‑1 (MQ=255) cAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAAc < 2:962602/100‑1 (MQ=255) ggTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAAccc > 1:2072562/1‑100 (MQ=255) ggTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAAccc < 1:968523/100‑1 (MQ=255) gTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAAcc < 1:311953/98‑1 (MQ=255) aaGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTaaaa > 1:298332/1‑100 (MQ=255) gggCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAAc > 1:1086319/1‑100 (MQ=255) gcggTTCACGTGGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGGCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCt < 2:1759252/97‑1 (MQ=255) ttCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAg < 2:965786/100‑1 (MQ=255) ttCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAg > 1:1807245/1‑100 (MQ=255) ttCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAg > 1:1748936/1‑100 (MQ=255) ttCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAg < 2:2033547/100‑1 (MQ=255) tCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAg < 2:1419613/99‑1 (MQ=255) tCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGc < 2:1402739/100‑1 (MQ=255) tCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGCCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGc < 1:242556/100‑1 (MQ=255) cACGTTGACCGGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGAAATCCATGCCGGATGACCCGTAAACACCTTATGCCACATGGTACCCTAAAAACCTTAAg > 2:2168942/1‑98 (MQ=37) cGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAAt < 2:49171/100‑1 (MQ=255) ttGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAATCGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATgg < 2:1217811/100‑1 (MQ=255) ttGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATgg < 1:686939/100‑1 (MQ=255) tGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGtt > 1:872362/1‑100 (MQ=255) gATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTCAGCAATGGTACGTTg > 2:2006384/1‑100 (MQ=255) gATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGtt > 1:633548/1‑99 (MQ=255) gATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTg > 1:1260930/1‑100 (MQ=255) gATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTg < 2:1553901/100‑1 (MQ=255) gATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTg > 2:154039/1‑100 (MQ=255) gACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCATAAAAACATTAAACAATGGTAAGTTAGAtat > 1:716494/1‑98 (MQ=38) aCGCGCCAGCGTAACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGAtctc < 1:976596/100‑1 (MQ=255) cgcgCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCg > 2:1031008/1‑100 (MQ=255) cgcgCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCg > 1:1587594/1‑100 (MQ=255) cgcCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCgat < 2:1173622/100‑1 (MQ=255) cgcCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCgat < 2:165849/100‑1 (MQ=255) cgcCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCga > 2:157203/1‑99 (MQ=255) gcCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCgatg < 1:831284/100‑1 (MQ=255) ccAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCgatga > 2:1032593/1‑100 (MQ=255) aGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCCATGGTACGTTGGATCTCGATGAtt > 1:1587964/1‑100 (MQ=255) cGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGAttac > 2:1355656/1‑98 (MQ=255) cGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTc > 1:862505/1‑100 (MQ=255) gTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCg > 1:1152898/1‑100 (MQ=255) gTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCg > 1:681084/1‑100 (MQ=255) tcttCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAAt < 1:962312/97‑1 (MQ=255) acaTCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAAt > 1:1647873/1‑100 (MQ=255) caTCAGGCAATTCATGCAGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAATCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTGGATGATTCCGAAtc > 2:1737708/1‑99 (MQ=38) caTCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATa > 1:350676/1‑100 (MQ=255) aTCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATAc > 1:1173051/1‑100 (MQ=255) tCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATaga > 2:962310/1‑98 (MQ=255) tCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACt < 1:1403124/100‑1 (MQ=255) cAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACtt > 2:1830857/1‑100 (MQ=255) aGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACtt > 1:319736/1‑99 (MQ=255) ggCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccac < 2:1832801‑M2/100‑57 (MQ=255) ggCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCg > 2:326371/1‑100 (MQ=255) gCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttcca < 1:182156‑M2/98‑56 (MQ=255) aaTCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATc < 2:581284/100‑1 (MQ=255) aaTCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATc < 2:1784231/100‑1 (MQ=255) tCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATcac > 1:2096228/1‑100 (MQ=255) tCCATGCCGGATGAAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGAAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATc > 2:1382682/1‑98 (MQ=255) cATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACAt > 1:772375/1‑100 (MQ=255) ccGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacctgaaattaat < 1:77999‑M2/100‑68 (MQ=255) ccGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGcc < 2:641623/100‑1 (MQ=255) cGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGcc < 1:749248/99‑1 (MQ=255) cGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATAATTCGATCACATCGcc < 2:648435/99‑1 (MQ=255) ggATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGcc < 2:1937497/98‑1 (MQ=255) tGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacctgaaattaattttaa < 1:808490‑M2/100‑73 (MQ=255) tGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGc < 2:1599056/100‑1 (MQ=255) gCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCg > 2:476188/1‑100 (MQ=255) cAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCgg < 1:1031010/100‑1 (MQ=255) aGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGa > 1:870007/1‑100 (MQ=255) aGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGa < 1:1139399/100‑1 (MQ=255) aGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGa < 1:1253531/100‑1 (MQ=255) gCGTAAACGCCTGATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGAc < 1:50090/100‑1 (MQ=255) cGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGAcg > 1:2099181/1‑100 (MQ=255) cGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGAcg < 2:1736519/100‑1 (MQ=255) gTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGAcg > 1:1889737/1‑99 (MQ=255) aaCGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGAcgtcgt > 1:1115233/1‑100 (MQ=255) aCGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGtt > 2:1314048/1‑100 (MQ=255) aCGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGtt > 2:1456871/1‑100 (MQ=255) cGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTg < 1:1983711/100‑1 (MQ=255) cGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTg > 2:404832/1‑100 (MQ=255) cGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTg < 2:2096585/100‑1 (MQ=255) ccTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTa > 1:1330081/1‑100 (MQ=255) ttATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAgn < 1:83051/100‑2 (MQ=255) ttATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGt < 1:1032595/100‑1 (MQ=255) cccGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCtt > 1:1494576/1‑100 (MQ=255) ccGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCTTa > 1:1541980/1‑100 (MQ=255) ccGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCTTa < 2:518767/100‑1 (MQ=255) ccGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCTTa < 2:793475/100‑1 (MQ=255) gCATGGattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacctgaaattaattttaaaaaggggctgttagcccctttt > 1:1454325‑M2/1‑6 (MQ=255) gCATGGattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacctgaaattaattttaaaaaggggctaacagcccctttt > 2:808490‑M2/1‑6 (MQ=255) gCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCTTAAc < 1:585590/100‑1 (MQ=255) cATGGattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacctgaaattaattttaaaaaggggctaacagccccttttt < 1:1145944‑M2/100‑96 (MQ=255) aTGGattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacctgaaattaattttaaaaaggggctaacagcccctttttt > 1:165849‑M2/1‑4 (MQ=255) ttgattgcctgatttgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacctgaaattaattttaaaaaggggctaacagccccttttttg > 1:358757‑M2/3‑3 (MQ=255) tGGattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacctgaaattaattttaaaaaggggctaacagccccttttttg > 2:606981‑M2/1‑3 (MQ=255) tGGattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacctgaaattaattttaaaaaggggctaacagccccttttttg > 1:1832813‑M2/1‑3 (MQ=255) tGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCTTAACGcc < 1:1970645/100‑1 (MQ=255) tGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCTTAACGcc < 1:815674/100‑1 (MQ=255) ggAACCCTCAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGTGGACTTCGTTGTAGTTCTTAACGCCg < 2:289370/100‑1 (MQ=255) gattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacctgaaattaattttaaaaaggggctaacagccccttttttgtc > 2:1853619‑M2/1‑1 (MQ=255) | TTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCTTAACGCCGA > NC_000913/3313229‑3313427 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |