New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 4235504 | NA (NA) | 5 (0.070) | 5/166 | NT | NA | intergenic (+97/‑402) | pgi/yjbE | glucosephosphate isomerase/extracellular polysaccharide production threonine‑rich protein |
? | NC_000913 | = 4235530 | NA (NA) | intergenic (+123/‑376) | pgi/yjbE | glucosephosphate isomerase/extracellular polysaccharide production threonine‑rich protein |
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
TAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACG > NC_000913/4235431‑4235629 | tAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCA > 1:780850‑M2/1‑100 (MQ=255) tAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCA < 1:1004872‑M2/100‑1 (MQ=255) ggCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAAtt < 2:1963929/100‑1 (MQ=255) ggCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAAtt > 2:1072000/1‑100 (MQ=255) ttCACGCCGCATCCTGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATa < 1:412349/100‑1 (MQ=255) ttCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATa < 1:1315441/100‑1 (MQ=255) ttCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATa < 1:1506216/100‑1 (MQ=255) ttCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATa < 1:1482569/100‑1 (MQ=255) tgaacgccttaTCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATa > 1:193727/11‑100 (MQ=255) tCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATAc < 1:2041735/100‑1 (MQ=255) ccgcgtcgcATCAGGCATCGGTTGCCGGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATAc > 2:1600732/7‑100 (MQ=25) cACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACa > 1:410067/1‑100 (MQ=255) aCGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACAt > 2:152594/1‑100 (MQ=255) aCGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACAt > 1:465941/1‑100 (MQ=255) aCGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACAt < 2:153007/100‑1 (MQ=255) aCGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACAt < 1:2089090/100‑1 (MQ=255) cgccgcATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCATGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATa < 2:1747079/100‑1 (MQ=255) cgccgcATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATa < 2:290640/100‑1 (MQ=255) gccgcATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAg < 1:1011447/100‑1 (MQ=255) cGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACgattg < 1:795596/100‑1 (MQ=255) ggCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACgattga > 2:1403074/1‑100 (MQ=255) ggCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACgattga < 2:2086896/100‑1 (MQ=255) gCAACCGATGCCTGATGCGAAGCGGTCGCGTCTTATCAGACCTACAGGTCGATGCCGATATGTACAACGTATGCGGCAATTAATACATAGAACgatt > 2:1904904/1‑97 (MQ=38) cAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACgattgatt > 1:2222407/1‑100 (MQ=255) aCCTATGCCTTATGCGACGCGTTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGTAATTAATACATAGCACgattg < 2:1507175/95‑1 (MQ=38) aCCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTaa > 1:1238909/1‑100 (MQ=255) cGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTaaa < 2:1327645/99‑1 (MQ=255) cGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAAt < 1:780135/100‑1 (MQ=255) gATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATa > 1:1986108/1‑100 (MQ=255) gATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATa > 1:1387452/1‑100 (MQ=255) gCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAAcc < 1:1952648/100‑1 (MQ=255) ccTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCt < 1:141143/100‑1 (MQ=255) ccTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCt < 2:2149156/100‑1 (MQ=255) ccTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCt > 1:774543/1‑100 (MQ=255) gATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTtaa < 1:1824719/100‑1 (MQ=255) tGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTtaata > 2:1603961/1‑100 (MQ=255) gACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAAc < 1:1415426/99‑1 (MQ=255) gACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACa > 2:1864100/1‑100 (MQ=255) aCGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACaa < 2:1985061/100‑1 (MQ=255) cgcgTTTTATCAGGCCTACAGGTTGTTGTCGTTATGTATATCGTATTCAGCAATTAATACATAGCACGATTGACTAAATAACCTTAATAACAATGCCGa < 2:448397/99‑1 (MQ=255) cgcgTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGAc > 2:1856853/1‑100 (MQ=255) cgcgTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGAc < 1:1453152/100‑1 (MQ=255) cTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACGTCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTAt > 1:2173182/1‑100 (MQ=255) tATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGt > 1:1939640/1‑100 (MQ=255) aTCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTc < 1:1287469/100‑1 (MQ=255) cAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCgg < 2:1939627/100‑1 (MQ=255) ggCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCa > 1:545810/1‑100 (MQ=255) ccTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCAt > 2:270219/1‑99 (MQ=255) cTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAtcgacctgtaggcctgataagacgcgaccgcgtcgcatcaggcatcggttgccggatgcggcg < 1:890478‑M2/100‑64 (MQ=255) tACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACATAACGTCGGCAttg < 1:1254397/99‑2 (MQ=255) aGGTCGATGCCGATATATACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCAtttttt > 1:422181/1‑99 (MQ=255) ggTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTa < 1:57115/100‑1 (MQ=255) ggTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTa > 1:1799470/1‑100 (MQ=255) cttCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTa < 1:677185/98‑1 (MQ=255) gTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAtcgacctgtaggcctgataagacgcgaccgcgtcgcatcaggcatcggttgccggatgcggcgtgaacg < 1:1116216‑M2/100‑70 (MQ=255) gTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTAt < 1:1708540/100‑1 (MQ=255) tCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGTCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATc < 2:179645/100‑1 (MQ=255) cGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAtcgacctgtaggcctgataagacgcgaccgcgtcgcatcaggcatcggttgccggatgcggcgtgaacgcc < 2:365304‑M2/100‑72 (MQ=255) cGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCa > 1:179645/1‑100 (MQ=255) gATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAtcgacctgtaggcctgataagacgcgaccgcgtcgcatcaggcatcggttgccggatgcggcgtgaacgcct < 2:905644‑M2/100‑73 (MQ=255) gATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGCCGTTATGTCGGCATTTTTTTATCa > 2:1954948/1‑99 (MQ=255) gATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCa < 2:2228762/99‑1 (MQ=255) gATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAg > 2:1362973/1‑100 (MQ=255) gATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAg > 1:2153509/1‑100 (MQ=255) gATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAg < 1:713703/100‑1 (MQ=255) aTGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAtcgacctgtaggcctgataagacgcgaccgcgtcgcatcaggcatcggttgccggatgcggcgtgaacgcctt > 1:365303‑M2/1‑27 (MQ=255) aTGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAg < 1:713644/99‑1 (MQ=255) aTGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGa > 1:923218/1‑100 (MQ=255) tGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGAt < 2:786575/100‑1 (MQ=255) gCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATa > 2:1887923/1‑100 (MQ=255) gCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATa > 2:757232/1‑100 (MQ=255) ccGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATaa > 2:874263/1‑100 (MQ=255) cGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAGCCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATaa < 1:186051/99‑1 (MQ=255) cGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATaaa > 1:1022584/1‑100 (MQ=255) cGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATa < 1:1264907/98‑1 (MQ=255) tatGTACATCGTATTAGGCAATTAATACATAGCTCGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTAAGTAGGAATTTTTTTATCAGATAAAccc > 2:1558348/1‑100 (MQ=255) tGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATc > 1:783798/1‑97 (MQ=255) gTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATACCAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCt < 2:970872/100‑1 (MQ=255) gTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCAGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCt < 2:970964/100‑1 (MQ=255) aCATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTg < 2:377932/100‑1 (MQ=255) gaccGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGt < 1:1653923/97‑1 (MQ=255) tCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCt > 2:1639182/1‑100 (MQ=255) tCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCt > 2:671021/1‑100 (MQ=255) cGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTc < 1:1206242/98‑1 (MQ=255) gTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGt > 1:424588/1‑100 (MQ=255) ttCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAAt < 1:899076/100‑1 (MQ=255) ttCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAAt < 2:652039/100‑1 (MQ=255) ttCGGCAATTAATACATAGCAAGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCACCTTGTCTGTAAt > 2:1001082/1‑100 (MQ=255) tCGGCAttgtcttgtaggcctgataagacgcgaccgcgtcgcatcaggcatcggttgtcggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacatatcgacg > 1:270218‑M2/1‑6 (MQ=255) tCGGCAtcgacctgtaggcctgataagacgcgaccgcgtcgcatcaggcatcggttgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacatatcgacg < 2:749940‑M2/99‑94 (MQ=255) cGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAAttt > 1:150199/1‑100 (MQ=255) cGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCACTTGTCTGTAAttt > 1:18370/1‑100 (MQ=255) cGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATAAGATAAATCCCCTTGTCTGTAAttt > 2:971256/1‑100 (MQ=255) ggCAtcgacctgtaggcctgataagacgcgaccgcgtcgcatcaggcatcggttgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacatatcgacgatg > 2:293397‑M2/1‑4 (MQ=255) ggCAtcgacctgtaggcctgataagacgcgaccgcgtcgcatcaggcatcggttgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacatatcgacgatg < 2:2156189‑M2/100‑97 (MQ=255) ggCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTa < 1:1600743/100‑1 (MQ=255) ggCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTa < 2:193727/100‑1 (MQ=255) cAtcgacctgtaggcctgataagacgcgaccgcgtcgcatcaggcatcggttgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacatatcgacgatgat > 1:551334‑M2/1‑2 (MQ=255) cAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATAAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTaa > 2:88385/1‑99 (MQ=255) aaTTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGTCGGTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACg < 2:5512/100‑1 (MQ=255) | TAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAACCGATGCCTGATGCGACGCGGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCGATGCCGATATGTACATCGTATTCGGCAATTAATACATAGCACGATTGATTAAATAACCTTAATAACAATGCCGACGTTATGTCGGCATTTTTTTATCAGATAAATCCCCTTGTCTGTAATTTAACG > NC_000913/4235431‑4235629 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |