| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1843724 = | NA (NA) | 7 (0.090) | 6/164 | NT | NA | noncoding (1/93 nt) | REP131 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences | REP131 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences |
| ? | NC_000913 | 1843750 = | NA (NA) | noncoding (27/93 nt) | REP131 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences | REP131 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences | |||||
GGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAATTTCAGGCGTTTATGAGTATTTAACGGAT > NC_000913/1843651‑1843849 | gtgcgcGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGcc < 1:233227/98‑1 (MQ=255)aattttgccgggggcgctgcgcttgcccggcctacattagagcgtaactgcaatgaattgtgcccatttgtagGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGcc > 2:753607‑M1/74‑100 (MQ=255) attttgccgggggcgctgcgcttgcccggcctacattagagcgtaactgcaatgaattgtgcccatttgtagGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCt > 1:1394617‑M1/73‑100 (MQ=255) tttgccgggggcgctgcgcttgcccggcctacattagagcgtaactgcaatgaattgtgcccatttgtagGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTAc > 1:1614163‑M1/71‑100 (MQ=255) gAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACaaa > 1:1205815/1‑100 (MQ=255) cATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAAtcg < 1:1510856/100‑3 (MQ=255) ggggcgctgcgcttgcccggcctacattagagcgtaactgcaatgaattgtgcccatttgtagGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATggg > 1:370454‑M1/64‑100 (MQ=255) aTTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATggg < 1:2249749/100‑1 (MQ=255) aTTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATgg > 2:604150/1‑99 (MQ=255) aTTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCACGCCTACAAATggg < 1:1505558/100‑1 (MQ=255) ttGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGc > 2:702436/1‑100 (MQ=255) ttGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGc < 1:842150/100‑1 (MQ=255) ttGCCGGTTTTGTGAAGGTTACCGATGCGATGATGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTCCGCTTATCAGGCCTACAAATg > 2:824351/1‑97 (MQ=255) tGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGca > 2:2064346/1‑100 (MQ=255) tGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGca > 1:2189018/1‑100 (MQ=255) gCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGcac > 1:2199425/1‑100 (MQ=255) ccGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGcaca > 2:1258899/1‑100 (MQ=255) tgtgAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCAtt > 1:2203167/1‑100 (MQ=255) gtgATGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTg < 1:1754037/100‑1 (MQ=255) gtgAAGGTTGGCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGAGTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCAt > 2:1198242/1‑98 (MQ=255) gtgAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTg < 1:880424/100‑1 (MQ=255) tgAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGc < 1:2064360/100‑1 (MQ=255) tgAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGc < 1:250596/100‑1 (MQ=255) ggTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCATACAAATGGGCACAATTCATTGCAGtt > 2:2112545/1‑100 (MQ=255) cgatgcgatgCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGctc < 2:561287/100‑1 (MQ=255) cgatgcgatgCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGctc < 2:879802/100‑1 (MQ=255) gatgcgatgcTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGctct < 1:987434/100‑1 (MQ=255) gatgcgatgcTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGctct < 2:1101995/100‑1 (MQ=255) gcgatgcTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAAt < 2:1364131/100‑1 (MQ=255) cgatgcTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATg < 1:1783083/100‑1 (MQ=255) gcTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGTCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTatg > 1:614070/1‑98 (MQ=255) gCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGG > 1:543343‑M1/1‑100 (MQ=255) cTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGC > 1:97549‑M1/1‑100 (MQ=255) cTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGC > 1:959242‑M1/1‑100 (MQ=255) tGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCC > 2:1822195‑M1/1‑100 (MQ=255) ggCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCC > 2:929167‑M1/1‑99 (MQ=255) gggTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAag > 2:1552294/1‑100 (MQ=255) ggTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAagc < 2:1740562/100‑1 (MQ=255) gtgtGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAagcg > 1:721964/1‑100 (MQ=255) tgtgATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAagcgc < 1:608878/100‑1 (MQ=255) gATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAagcgcagc < 1:2046846/100‑1 (MQ=255) gATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAagcgcagc > 1:1694754/1‑100 (MQ=255) gATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAagcgcag < 1:360460/99‑1 (MQ=255) tAAGTTGTAAATGCTTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCc > 1:87510‑M2/1‑99 (MQ=255) tAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCc > 2:959240‑M2/1‑99 (MQ=255) tAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCc > 1:1594225‑M2/1‑99 (MQ=255) cccatttgtaggcctgataagcgtagcgccatcaggcCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGcccc > 1:370454‑M2/38‑100 (MQ=255) aGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCccc < 1:1830993‑M2/100‑4 (MQ=255) gTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCcccg < 2:269550‑M2/100‑5 (MQ=255) gTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCcccg < 2:138426‑M2/100‑5 (MQ=255) gTTGTAAATGCCAGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCcccg < 1:1477912‑M2/100‑5 (MQ=255) tGTAAATGCCTGATGGTGCTACGCTTATTAGTCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCAGGCAAGCGCAGCGCCcccggn > 2:1325108‑M2/1‑94 (MQ=255) tGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCcccggc < 2:1318813‑M2/100‑7 (MQ=255) gTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGggcgctgcgcttgcccggcc < 2:172169‑M1/100‑21 (MQ=255) tAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCaa < 2:895670/100‑1 (MQ=255) gtaggcctgataagcgtagcgccatcaggcCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCaaa > 1:1614163‑M2/31‑100 (MQ=255) aaaTGCCTGATGGAGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCaaa > 1:1523360/1‑100 (MQ=255) aggcctgataagcgtagcgccatcaggcCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAAt > 1:1394617‑M2/29‑100 (MQ=255) aTGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATGCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGggcgctgcgcttgcccggcctac < 1:371936‑M1/99‑24 (MQ=255) ggcctgataagcgtagcgccatcaggcCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAAtt > 2:753607‑M2/28‑100 (MQ=255) gcctgataagcgtagcgccatcaggcCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCCAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAAttt > 1:1641611‑M2/27‑100 (MQ=255) gcctgataagcgtagcgccatcaggcCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAAttt > 2:1088608‑M2/27‑100 (MQ=255) cctgataagcgtagcgccatcaggcCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAATTTc > 2:654894‑M2/26‑100 (MQ=255) CTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAATTTCa < 1:1622048‑M1/100‑1 (MQ=255) CTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAATTTCa > 1:291784‑M1/1‑100 (MQ=255) CTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGCAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAATTTCa > 1:1579125‑M1/1‑100 (MQ=255) GATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAATTTCAgg < 2:1076944‑M1/100‑1 (MQ=255) aTGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGggcgctgcgcttgcccggcctacattagagc < 1:1501967‑M1/100‑32 (MQ=255) cgcTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAATTTCAGGCGttt > 1:1545316/1‑100 (MQ=255) aCGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAATTTCAGGCGTTTATGa > 1:1301688/1‑100 (MQ=255) cGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAATTTCAGGCGTTTATGAg < 2:1830981/100‑1 (MQ=255) gCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAATTTCAGGCGTTTATGAGt > 1:1419333/1‑100 (MQ=255) gCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAATTTCAGGCGTTTATGAGt > 1:1870323/1‑100 (MQ=255) tATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAATTTCAGGCGTTTATGAGTAtt > 1:1027659/1‑100 (MQ=255) ggcCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAATTTCAGGCGTTTATGAGTATTTAACg > 2:1290453‑M2/4‑100 (MQ=255) cTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAATTTCAGGCGTTTATGAGTATTTAACGgat < 1:1076946/100‑1 (MQ=255) | GGGCGCGAACATTGCCGGTTTTGTGAAGGTTGCCGATGCGATGCTGGCGCAGGGTGTGATTTAAGTTGTAAATGCCTGATGGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAAATGGGCACAATTCATTGCAGTTACGCTCTAATGTAGGCCGGGCAAGCGCAGCGCCCCCGGCAAAATTTCAGGCGTTTATGAGTATTTAACGGAT > NC_000913/1843651‑1843849 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |