| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,652,855 | (G)6→7 | coding (362/846 nt) | sseA → | 3‑mercaptopyruvate sulfurtransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,652,849 | 1 | . | G | 97.9% | 339.5 / 0.1 | 96 | coding (356/846 nt) | sseA | 3‑mercaptopyruvate sulfurtransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/1); new base G (42/52); total (43/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 | |||||||||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
AGGATAAGCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑T‑G‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGTTTAA > NC_000913/2652750‑2652942 | aGGATAAGCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑t > 1:2504171/1‑100 (MQ=255)aGGATAAGCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑t > 2:1271345/1‑100 (MQ=255) tAAGCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑T‑g‑ggg < 1:3026689/100‑1 (MQ=255) aaGCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑T‑g‑gggg < 1:965144/100‑1 (MQ=255) aGCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑T‑g‑ggggg > 1:2308723/1‑100 (MQ=255) aGCACCTGATTATCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑T‑g‑ggggg > 2:2576668/1‑100 (MQ=255) gCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTGAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑T‑g‑gggggg < 2:614113/100‑2 (MQ=255) cACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑T‑g‑ggggggt > 1:605433/1‑98 (MQ=255) ccTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑T‑g‑ggggggtgg > 1:648296/1‑96 (MQ=255) ccTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑T‑g‑ggggggtgg > 1:648744/1‑96 (MQ=255) ccTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑T‑g‑ggggggtgg > 1:1917038/1‑96 (MQ=255) ccTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑T‑g‑ggggggtgg < 1:1638244/100‑5 (MQ=255) ccTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑T‑g‑ggggggtgg > 2:1592195/1‑96 (MQ=255) gATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACt > 1:2595720/1‑100 (MQ=255) gATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACt < 2:478688/100‑1 (MQ=255) ttGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTg < 2:259977/100‑1 (MQ=255) gTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCa < 1:478727/100‑1 (MQ=255) tATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGc < 2:1906832/100‑1 (MQ=255) aTGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCt > 1:1501738/1‑100 (MQ=255) aTGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCt > 2:1510127/1‑100 (MQ=255) tGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTg < 1:1599789/100‑1 (MQ=255) tGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTg > 1:1781658/1‑100 (MQ=255) gACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTgg > 2:2509237/1‑100 (MQ=255) gACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTgg > 1:2044784/1‑100 (MQ=255) gACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTgg > 2:141983/1‑100 (MQ=255) gACGAAGGTAATCGTGTCTCATCCCCACTAGCAGGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGGGTAGAGAAAGTGGCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTg < 2:2588891/99‑1 (MQ=255) aCGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGc < 1:1666620/100‑1 (MQ=255) cGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCa > 2:2875727/1‑100 (MQ=255) cGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCa < 1:529645/100‑1 (MQ=255) gAAGTTAATCTTTTCTCAGGCGCACGAGCATGGTGGATGCCGCGCACCTTCGGTGTAGAGAGAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTgg < 2:214256/97‑1 (MQ=255) ggTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAgcgc > 2:1788548/1‑100 (MQ=255) gTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTTGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAgcgc < 2:334701/99‑1 (MQ=255) tAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCga > 1:2606489/1‑100 (MQ=255) tAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCga > 1:1643355/1‑100 (MQ=255) aTCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCgatg < 2:2466185/100‑1 (MQ=255) aTCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCgatg < 2:2504137/100‑1 (MQ=255) cTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCgatgat > 1:2410212/1‑100 (MQ=255) cTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCgatgat > 1:1773340/1‑100 (MQ=255) ttttCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATc < 2:1685863/100‑1 (MQ=255) tttCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATct < 1:2644464/100‑1 (MQ=255) tctcAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATctgc < 2:311956/100‑1 (MQ=255) tctcAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATctgc > 2:1119450/1‑100 (MQ=255) aGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGtt < 1:1477252/100‑1 (MQ=255) aGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGtt > 1:1866913/1‑100 (MQ=255) gCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGTAGCGCGATGATCTGCTGTTa > 1:2798958/1‑100 (MQ=255) gCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTa < 1:880004/100‑1 (MQ=255) gCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTa > 1:2983878/1‑100 (MQ=255) gCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTa < 2:1643336/100‑1 (MQ=255) gCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTa < 2:1721256/100‑1 (MQ=255) gCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTa < 2:1723507/100‑1 (MQ=255) ccACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTagaa < 1:1732889/100‑1 (MQ=255) ccACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTagaa > 1:1584021/1‑100 (MQ=255) cACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTagaag > 1:856514/1‑100 (MQ=255) aCGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTagaaga < 2:866620/100‑1 (MQ=255) gAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGaagaag < 2:1501722/100‑1 (MQ=255) aGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAgg > 2:929265/1‑100 (MQ=255) aGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAgg < 2:1193049/100‑1 (MQ=255) aGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAgg < 2:648736/100‑1 (MQ=255) aGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAgg < 2:648288/100‑1 (MQ=255) aGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAgg < 2:197298/100‑1 (MQ=255) aGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAgg < 2:568063/100‑1 (MQ=255) aGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAgg > 2:503723/1‑100 (MQ=255) aGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAgg < 1:2457521/100‑1 (MQ=255) gCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTCAG‑G‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGt > 2:1700158/1‑100 (MQ=255) aTGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGc < 2:2595683/100‑1 (MQ=255) aTGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGc > 1:2345001/1‑100 (MQ=255) tggtggATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCa < 1:1495486/100‑1 (MQ=255) tggtggATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCa > 2:134029/1‑100 (MQ=255) aTGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTagag > 2:2767506/1‑100 (MQ=255) tgctgcGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGc < 2:2161878/100‑1 (MQ=255) ctgcGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTg < 1:1271357/100‑1 (MQ=255) ctgcGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTg < 1:2551739/100‑1 (MQ=255) gcgcACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGcc < 1:1668738/100‑1 (MQ=255) cgcACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCg < 2:221418/100‑1 (MQ=255) cACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGa > 2:1176718/1‑100 (MQ=255) cACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGa < 2:2980940/100‑1 (MQ=255) ccTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAg < 2:173874/100‑1 (MQ=255) cTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAgg < 1:2509271/100‑1 (MQ=255) cTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGACCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAgg > 1:1219219/1‑100 (MQ=255) tttGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGCTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGga < 2:1773320/100‑1 (MQ=255) ttGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGgag < 2:856504/100‑1 (MQ=255) ggTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGagag < 1:1196891/100‑1 (MQ=255) gtgtAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGt < 1:2161093/100‑1 (MQ=255) gtgtAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGt > 1:289668/1‑100 (MQ=255) tgtAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGtt > 2:1617354/1‑100 (MQ=255) gtAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGttt > 2:1278852/1‑100 (MQ=255) gtAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGttt < 1:1510143/100‑1 (MQ=255) tAGAGAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTa < 2:605425/100‑1 (MQ=255) agagAAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGGAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTaa > 2:3005130/1‑100 (MQ=255) gagaAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAAc < 1:296378/100‑1 (MQ=255) gagaAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAAc > 2:2460564/1‑100 (MQ=255) gagaAAGTGTCGATTC‑T‑GTGGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAAc < 2:2766217/100‑1 (MQ=255) gaAAGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAAcgc < 1:760870/100‑1 (MQ=255) aGTGTCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAAcgccgc > 1:2143136/1‑100 (MQ=255) tgtCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCGGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGGAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACgcggcg > 2:1710961/1‑99 (MQ=255) gtCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGtt > 2:283376/1‑100 (MQ=255) gtCGATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGtt > 1:424094/1‑100 (MQ=255) cGATTC‑TGG‑GGGGGGGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGCTGATCTGCTGTTAGAAGAAAGTGCAGTACAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACTCCGCGTTTa > 1:2512646/1‑100 (MQ=255) gATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGTTTaa > 1:158488/1‑100 (MQ=255) gATTC‑TGG‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGTTTaa > 2:1359284/1‑100 (MQ=255) | AGGATAAGCACCTGATTGTCTATGACGAAGGTAATCTTTTCTCAGCCCCACGAGCATGGTGGATGCTGCGCACCTTTGGTGTAGAGAAAGTGTCGATTC‑T‑G‑GGGGGTGGACTTGCAGGCTGGCAGCGCGATGATCTGCTGTTAGAAGAAGGTGCAGTAGAGCTGCCGGAAGGAGAGTTTAACGCCGCGTTTAA > NC_000913/2652750‑2652942 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |