| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,156,112 | T→C | A117A (GCT→GCC) | holB → | DNA polymerase III, delta prime subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,156,112 | 0 | T | C | 98.1% | 367.1 / ‑2.9 | 107 | A117A (GCT→GCC) | holB | DNA polymerase III, delta prime subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/2); new base C (49/56); total (49/58) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.23e-01 | |||||||||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
AAATACGCTGGGCGTTGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTACCCGCGAGCCTG > NC_000913/1156016‑1156206 | aaaTACGCTGGGCGTTGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATgccgcc > 1:1648371/1‑100 (MQ=255) aaTACGCTGGGCGTTGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCt < 1:1095557/100‑1 (MQ=255) aTACGCTGGGCGTTGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCtt < 1:2534766/100‑1 (MQ=255) tACGCTGGGCGTTGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTa < 2:32532/100‑1 (MQ=255) aCGCTGGGCGTTGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTAc < 2:1847823/100‑1 (MQ=255) aCGCTGGGCGTTGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTAc < 2:1541520/100‑1 (MQ=255) aCGCTGGGCGTTGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTAc < 2:793339/100‑1 (MQ=255) aCGCGGGGCGTTGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTATGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTAc < 2:284802/100‑1 (MQ=255) cGCTGGGCGTTGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACt < 2:2419627/100‑1 (MQ=255) gCTGGGCGTTGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTa < 2:2233056/100‑1 (MQ=255) gCTGGGCGTTGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTa > 2:1496639/1‑100 (MQ=255) cTGGGCGTTGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTaa > 2:2240835/1‑100 (MQ=255) tGGGCGTTGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAAc < 1:1579684/100‑1 (MQ=255) gggCGTTGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAAcc < 1:2303585/100‑1 (MQ=255) gggCGTTGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAAcc < 2:331897/100‑1 (MQ=255) ggCGTTGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCg < 2:736749/100‑1 (MQ=255) ggCGTTGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCg < 1:749865/100‑1 (MQ=255) cGTTGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGAc < 2:2395090/100‑1 (MQ=255) cGTTGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGAc > 2:2396725/1‑100 (MQ=255) ttGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGAcgc < 2:2581293/100‑1 (MQ=255) ttGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGAcg > 1:2914422/1‑99 (MQ=255) tGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGAcgc > 1:1642338/1‑99 (MQ=255) gATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGAcgccg > 1:1727081/1‑100 (MQ=255) gATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGAcgccg > 2:484648/1‑100 (MQ=255) gATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGAcgccg > 2:503474/1‑100 (MQ=255) tGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCcgcg < 1:924412/100‑1 (MQ=255) cGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGc > 2:1435214/1‑100 (MQ=255) cGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGc > 1:1901298/1‑100 (MQ=255) cGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGAGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGc > 2:1699687/1‑100 (MQ=255) cGGTACGCGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTAGTGTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCgg > 2:1603948/1‑99 (MQ=255) aCGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAAc > 2:595700/1‑100 (MQ=255) cGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACg > 2:2647771/1‑100 (MQ=255) cGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACg < 1:1496654/100‑1 (MQ=255) gTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCGCGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGc > 2:259964/1‑100 (MQ=255) gTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGc < 1:1699706/100‑1 (MQ=255) gAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCAt > 1:1303483/1‑100 (MQ=255) gAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCAt > 2:2187322/1‑100 (MQ=255) aGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCAtt < 1:2187351/100‑1 (MQ=255) tCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCt < 2:532915/100‑1 (MQ=255) ccGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGaa < 1:2396756/100‑1 (MQ=255) ccGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGaa > 2:512384/1‑100 (MQ=255) ccGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGaa > 1:2593222/1‑100 (MQ=255) aaGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGc < 1:1059337/100‑1 (MQ=255) aGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCt < 2:63751/100‑1 (MQ=255) aGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCt < 1:780613/100‑1 (MQ=255) gCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTNGTTTGGGTNACCGATGCCGCNTTANTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCtt < 1:473448/100‑1 (MQ=255) gCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCtt < 1:2610957/100‑1 (MQ=255) cTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTg < 1:1157707/100‑1 (MQ=255) tGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGa > 1:643407/1‑100 (MQ=255) gAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGaa < 2:1348920/100‑1 (MQ=255) gAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGaa < 1:1531607/100‑1 (MQ=255) aTGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAaga < 2:3004653/100‑1 (MQ=255) aTGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTGTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAaga < 2:556190/100‑1 (MQ=255) tGAGCACGCGCGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAagag < 2:423081/100‑1 (MQ=255) tGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAagag > 1:2483075/1‑100 (MQ=255) aGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGACAACGCTTGAAGAGcc > 1:3006400/1‑100 (MQ=255) aGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGcc > 1:2910158/1‑100 (MQ=255) gcacgcacGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGcca > 1:2740532/1‑100 (MQ=255) gcacgcacGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGcca < 2:3024527/100‑1 (MQ=255) cacgcacgCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAagag < 2:2623123/96‑1 (MQ=255) cgcacgcTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGccacca < 1:790680/100‑1 (MQ=255) cgcacgcTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGccacca > 2:450194/1‑100 (MQ=255) cgcacgcTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGccacca > 1:2626985/1‑100 (MQ=255) cgcacgcTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGccacca > 2:54279/1‑100 (MQ=255) cgcacgcTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGAGTAACCTATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGccac < 2:2148335/98‑1 (MQ=255) acgcTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACcagca < 2:2448467/100‑1 (MQ=255) acgcTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACcagca < 1:116954/100‑1 (MQ=255) cgcTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACcagcag < 1:1457272/100‑1 (MQ=255) cTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGaa > 1:1205260/1‑100 (MQ=255) ggtggtGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACtt > 1:1212746/1‑100 (MQ=255) ggtggtGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACtt < 1:1260474/100‑1 (MQ=255) gtggtgCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGACACTTg > 2:389003/1‑100 (MQ=255) gtggtgCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTg < 2:908413/100‑1 (MQ=255) tggtgCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAGGAGCCACCAGCAGAAACTTgg < 1:247775/100‑1 (MQ=255) ggtgCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGt > 1:1152078/1‑100 (MQ=255) ggtgCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGt < 1:237914/100‑1 (MQ=255) gtgCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTgg > 2:1972163/1‑98 (MQ=255) gtgCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGtt < 2:1727061/100‑1 (MQ=255) gCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGtttt > 1:2709243/1‑100 (MQ=255) aGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTg < 2:2166505/100‑1 (MQ=255) aGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTg < 2:1336915/100‑1 (MQ=255) aGTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTg > 2:1990068/1‑100 (MQ=255) gTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTgg < 2:2284255/100‑1 (MQ=255) gTCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTgg < 1:741438/100‑1 (MQ=255) tCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGc < 2:1307291/100‑1 (MQ=255) tCGTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGc < 2:1307225/100‑1 (MQ=255) gTTTGGGTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCTCGGCTAACGCATCGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTg > 2:1707667/1‑96 (MQ=255) gggTACCCGATGCCGCATTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGCACCTTGGTTTTTACTGGATACCcg > 1:1370634/1‑100 (MQ=255) gggTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTACCcg < 2:887066/100‑1 (MQ=255) ggTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTACCcg > 2:2030257/1‑99 (MQ=255) gcaagcGATGACGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTAAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTAcc < 2:2086201/91‑1 (MQ=255) gTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTACCcgcg > 1:1399810/1‑100 (MQ=255) gTAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTACCcgcg > 1:130879/1‑100 (MQ=255) tAACCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTACCCGCGa > 1:580636/1‑100 (MQ=255) aaCCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTACCCGCGAg < 1:595708/100‑1 (MQ=255) aaCCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTACCCGCGAg < 2:2593185/100‑1 (MQ=255) aaCCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTACCCGCGAg > 1:1926302/1‑100 (MQ=255) aCCGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTACCCGCGAGc > 1:1825779/1‑100 (MQ=255) ccGATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTACCCGCGAGcc < 1:1337163/100‑1 (MQ=255) gATGCCGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTACCCGCGAGCCTg < 2:1901277/100‑1 (MQ=255) | AAATACGCTGGGCGTTGATGCGGTACGTGAGGTCACCGAAAAGCTGAATGAGCACGCACGCTTAGGTGGTGCGAAAGTCGTTTGGGTAACCGATGCTGCCTTACTAACCGACGCCGCGGCTAACGCATTGCTGAAAACGCTTGAAGAGCCACCAGCAGAAACTTGGTTTTTCCTGGCTACCCGCGAGCCTG > NC_000913/1156016‑1156206 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |