| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,646,847 | T→C | intergenic (+110/+327) | flxA → / ← intK | Qin prophage; uncharacterized protein/pseudogene, integrase fragment, Qin prophage;Phage or Prophage Related |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,646,847 | 0 | T | C | 99.3% | 487.6 / ‑4.8 | 138 | intergenic (+110/+327) | flxA/intK | Qin prophage; uncharacterized protein/pseudogene, integrase fragment, Qin prophage;Phage or Prophage Related |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (78/59); total (78/60) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.35e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.37e-01 | |||||||||||
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
TGTGGCCCTCATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTT > NC_000913/1646751‑1646942 | tgtgGCCCTCATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAAt < 1:2284540/100‑1 (MQ=255)tgtgGCCCTCATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAAt < 2:2108173/100‑1 (MQ=255) gtgGCCCTCATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATg > 1:2334735/1‑100 (MQ=255) gtgGCCCTCATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATg > 1:1498913/1‑100 (MQ=255) tgGCCCTCATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATgg < 1:1128136/100‑1 (MQ=255) ggCCCTCATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATTGa > 2:1825902/1‑100 (MQ=255) cccTCATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACg < 1:730012/100‑1 (MQ=255) ccTCATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGTTAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGc < 2:2016267/100‑1 (MQ=255) cTCATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCa > 2:1591184/1‑100 (MQ=255) cTCATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCa < 2:1583731/100‑1 (MQ=255) tCATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCa > 2:2541574/1‑99 (MQ=255) cATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACt > 2:2658029/1‑100 (MQ=255) aTCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTc > 2:481889/1‑100 (MQ=255) tCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTcc < 1:1789414/100‑1 (MQ=255) tCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTcc < 1:64184/100‑1 (MQ=255) tCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTcc > 1:544662/1‑100 (MQ=255) tCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTcc < 1:3027507/100‑1 (MQ=255) ccAGTTTTCGCCATCAGTCTTTTCTTTAATGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAAtt < 2:1842104/100‑1 (MQ=255) ccACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAAtt < 1:402496/100‑1 (MQ=255) ccACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAAtt > 1:1168504/1‑100 (MQ=255) cACGTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTGCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAAtt < 2:2644433/99‑1 (MQ=255) aCTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAg < 2:1286304/100‑1 (MQ=255) aCTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAg < 1:47139/100‑1 (MQ=255) aCTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAg < 1:2395651/100‑1 (MQ=255) cTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGt > 2:1767415/1‑100 (MQ=255) ttttCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTc < 2:912587/100‑1 (MQ=255) ttCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTa > 1:2754303/1‑100 (MQ=255) ttCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTa > 2:1324606/1‑100 (MQ=255) tCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAAAATTAAAAGATATAAGCAATGGACGAACTCCCAATTAGTCTAt > 2:2151026/1‑100 (MQ=255) gCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTAttt < 2:739620/100‑1 (MQ=255) aTCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTaaa > 2:1727225/1‑100 (MQ=255) aTCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTaaa > 1:1735257/1‑100 (MQ=255) aTCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGAGATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTaaa > 2:2060576/1‑100 (MQ=255) tCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAAt > 1:1642677/1‑100 (MQ=255) cAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATc < 1:2373397/100‑1 (MQ=255) cAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATc > 1:753677/1‑100 (MQ=255) cAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATc > 1:966102/1‑100 (MQ=255) aGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCg < 1:124832/100‑1 (MQ=255) gCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGc < 2:1460195/100‑1 (MQ=255) ttttCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCAc > 1:2784662/1‑100 (MQ=255) tacTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAAGCGCCACg < 1:1602933/97‑1 (MQ=255) tCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAg < 2:1494172/100‑1 (MQ=255) ttAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGttt > 1:525197/1‑100 (MQ=255) ttAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGttt < 2:438737/100‑1 (MQ=255) ttAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGttt > 1:1206704/1‑100 (MQ=255) tAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGATTa > 2:572039/1‑100 (MQ=255) aaaGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTaa > 1:96120/1‑100 (MQ=255) aaaGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTaa > 2:1224250/1‑100 (MQ=255) aaGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAAc > 2:1903908/1‑100 (MQ=255) aGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACt < 2:332763/100‑1 (MQ=255) aGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACt > 1:252698/1‑100 (MQ=255) gACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTg < 1:2132436/100‑1 (MQ=255) gACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTg < 2:3047560/100‑1 (MQ=255) cATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGAc > 2:1572296/1‑100 (MQ=255) atatTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACa < 2:763807/100‑1 (MQ=255) atatTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACa < 2:662821/100‑1 (MQ=255) atatTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACa > 1:2518835/1‑100 (MQ=255) tattatCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCGCTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACaa > 2:2958489/1‑100 (MQ=255) tattatCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACaa > 1:645936/1‑100 (MQ=255) attatCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAAc > 2:1361487/1‑100 (MQ=255) ttatCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATATGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAAcc < 2:2142739/100‑1 (MQ=255) ttatCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAAcc < 2:438872/100‑1 (MQ=255) tCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCAt > 1:1970758/1‑100 (MQ=255) cTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATg < 1:2829465/100‑1 (MQ=255) tATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCaa > 2:2339871/1‑100 (MQ=255) tCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAAtt < 2:1935409/100‑1 (MQ=255) tCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAAtt > 1:2181824/1‑100 (MQ=255) cATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTa > 2:951592/1‑100 (MQ=255) cATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTa < 2:822448/100‑1 (MQ=255) cATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTa < 2:96831/100‑1 (MQ=255) aTTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTAt > 1:1476667/1‑100 (MQ=255) aTTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTAt < 2:2800665/100‑1 (MQ=255) tGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAAtt < 2:587304/100‑1 (MQ=255) tGATAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAAtt > 1:2980983/1‑100 (MQ=255) aTAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGc > 1:1157243/1‑100 (MQ=255) aTAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGc < 2:2980942/100‑1 (MQ=255) tAGTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCa < 1:928700/100‑1 (MQ=255) gTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAAc > 1:777495/1‑100 (MQ=255) gTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAAc > 2:893786/1‑100 (MQ=255) gTTAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAAc > 1:2192184/1‑100 (MQ=255) ttAACATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACCCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACt < 1:242649/100‑1 (MQ=255) aaCATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTAt > 2:1752673/1‑100 (MQ=255) aCATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTAtt < 2:1206692/100‑1 (MQ=255) cATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTAttt > 1:1212345/1‑100 (MQ=255) cATTACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTAttt > 2:712113/1‑100 (MQ=255) ttACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCt > 2:2532635/1‑100 (MQ=255) tACAAGATATAAGCAATGGACGCACTGCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTg < 2:2029309/100‑1 (MQ=255) tACAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTg < 1:540964/100‑1 (MQ=255) aCAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGt < 1:1825924/100‑1 (MQ=255) aCAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGt > 2:1774843/1‑100 (MQ=255) aCAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGt < 2:617531/100‑1 (MQ=255) aCAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGt > 1:2866888/1‑100 (MQ=255) aCAAGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGt > 2:1381732/1‑100 (MQ=255) aaGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAg < 1:2670514/100‑1 (MQ=255) aaGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAg < 2:286634/100‑1 (MQ=255) aGATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGt > 2:1303434/1‑100 (MQ=255) gATATAAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTc > 1:2618443/1‑100 (MQ=255) tataAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCAc > 1:2125972/1‑100 (MQ=255) taAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACtt > 1:1959009/1‑100 (MQ=255) taAGCAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACtt > 1:1669684/1‑100 (MQ=255) | TGTGGCCCTCATCGGGCCACTTTTCGCCATCAGCCTTTTCTTTAAAGACATATTATCTTTGTATCATTTCTGATAGTTAACATTACAAGATATAAGTAATGGACGCACTCCCAATTAGTCTATTTAAATCGCCACGAGTTTAACTGACAACCCATGATCAATTATGAATTGCAACTATTTCTGTAGTCACTT > NC_000913/1646751‑1646942 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |