| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,304,221 | C→T | A106V (GCC→GTC) | eco → | ecotin, a serine protease inhibitor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,304,221 | 0 | C | T | 97.9% | 307.0 / NA | 95 | A106V (GCC→GTC) | eco | ecotin, a serine protease inhibitor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); major base T (48/44); minor base G (1/1); total (50/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TCGTCTCGGCGGGAAGCTGGAAAACAAAACGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCAAGCTGCCGATCGTGG > NC_000913/2304123‑2304313 | tCGTCTCGGCGGGAAGCTGGAAAACAAAACGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGcc < 1:1278624/100‑1 (MQ=255) tctcGGCGGGAAGCTGGAAAACAAAACGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTATTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGc < 2:2744225/100‑1 (MQ=255) ctcGGCGGGAAGCTGGAAAACAAAACGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGcc > 1:2042459/1‑100 (MQ=255) ctcGGCGGGAAGCTGGAAAACAAAACGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGcc > 1:201728/1‑100 (MQ=255) cggcggGAAGCTGGAAAACAAAACGCTGCAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGccc < 2:1580582/99‑1 (MQ=255) ggcggGAAGCTTGAAAACAAAACGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCg < 2:179488/99‑1 (MQ=255) ggcggGAAGCTGGAAAACAAAACGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCgg < 1:1058433/100‑1 (MQ=255) gcggGAAGCTGGAAAACAAAACGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGa > 1:442830/1‑100 (MQ=255) gcggGAAGCTGGAAAACAAAACGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGa < 1:950326/100‑1 (MQ=255) cggGAAGCTGGAAAACAAAACGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGAt < 1:1933141/100‑1 (MQ=255) ggAAGCTGGAAAACAAAACGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATgg < 1:333906/100‑1 (MQ=255) gAAGCTGGAAAACAAAACGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGc < 2:1797363/100‑1 (MQ=255) aaGCTGGAAAACAAAACGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGc < 1:2800277/99‑1 (MQ=255) aGCTGGAAAACAAAACGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGAATGGCa > 1:976435/1‑99 (MQ=255) cTGGAAAACAAAACGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCaaga > 1:1272594/1‑100 (MQ=255) cTGGAAAACAAAACGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCaaga > 2:1105604/1‑100 (MQ=255) tGGAAAACAAAACGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCaagaa > 2:2292417/1‑100 (MQ=255) ggAAAACAAAACGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCaagaaa > 1:3027298/1‑100 (MQ=255) ggAAAACAAAACGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCaagaaa > 2:2887659/1‑100 (MQ=255) ggAAAACAAAACGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCaagaa < 2:20159/99‑1 (MQ=255) gAAAACAAAACGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCaagaaag < 2:1749509/100‑1 (MQ=255) aaacaaaacGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAagag > 1:1208229/1‑100 (MQ=255) aaacaaaacGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAagag < 2:476693/100‑1 (MQ=255) aacaaaacGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTGTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAgaga < 2:624012/100‑1 (MQ=255) acaaaacGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGagaa > 1:2486468/1‑100 (MQ=255) acaaaacGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGagaa < 1:2572522/100‑1 (MQ=255) caaaacGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTAAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGagaag < 2:2741857/100‑1 (MQ=255) caaaacGCTGGAAGGCTGGGGCTATGAGTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGagaag < 1:1287241/100‑1 (MQ=255) aaaacGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGagaaga > 2:1840548/1‑100 (MQ=255) acGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAAt < 2:2041992/100‑1 (MQ=255) cGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAAtt < 1:749509/100‑1 (MQ=255) cTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTg < 2:2055118/100‑1 (MQ=255) cTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTg < 2:2314796/100‑1 (MQ=255) cTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTg < 1:1433365/100‑1 (MQ=255) cTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTg < 1:1046688/100‑1 (MQ=255) ggAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTc > 2:95496/1‑100 (MQ=255) ggCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACcg > 2:82385/1‑100 (MQ=255) ggCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACcg > 1:2100549/1‑100 (MQ=255) cTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACcgcg > 2:568970/1‑100 (MQ=255) tgaggCTATGATTATTATGTCTTTGATAAACTCACTTCCCCAGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAATAAATTTGTCACCGCGt < 2:2680634/97‑1 (MQ=255) tGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGt > 1:295623/1‑100 (MQ=255) gCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCt > 2:941767/1‑100 (MQ=255) gCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCt > 1:1586901/1‑100 (MQ=255) gCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCt > 1:291140/1‑100 (MQ=255) tctttattaTGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGc < 1:430642/97‑1 (MQ=255) tGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGc < 2:540776/100‑1 (MQ=255) gATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCg < 1:521701/100‑1 (MQ=255) gATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCAGGATGGCAAGAAAGAGAAGCAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCg > 2:3043913/1‑100 (MQ=255) ttattaTGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGcaga > 2:430635/1‑97 (MQ=255) ttattaTGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGAt > 1:1960130/1‑100 (MQ=255) tatGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTg > 2:2648508/1‑100 (MQ=255) atGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTgg < 1:1018536/100‑1 (MQ=255) atGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATATGGGCGATGCTgg < 2:2295060/100‑1 (MQ=255) tGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGa > 1:346994/1‑100 (MQ=255) gTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGaa > 2:1377908/1‑100 (MQ=255) gTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGaa > 1:1939891/1‑100 (MQ=255) tCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAAt > 2:1802311/1‑100 (MQ=255) cTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAAtg > 1:953589/1‑100 (MQ=255) cTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAAtg > 2:8059/1‑100 (MQ=255) cTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAAtg > 2:1547152/1‑100 (MQ=255) tttGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAAtgc < 2:1272582/100‑1 (MQ=255) tttGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAAtgc > 2:182104/1‑100 (MQ=255) tttGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGGCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCCCCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAAtgc < 2:596533/100‑1 (MQ=255) gATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAAtgctgc > 2:1109855/1‑100 (MQ=255) gATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAAtgctgc < 2:2199557/100‑1 (MQ=255) gATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAAtgctgc < 2:541033/100‑1 (MQ=255) aTAAAGTAAGTTTCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCg < 2:2828164/100‑1 (MQ=255) aaaGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGtt > 1:2672266/1‑100 (MQ=255) aaGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTa < 1:1106155/100‑1 (MQ=255) aGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTac < 1:1254503/100‑1 (MQ=255) gTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTaca < 2:1510192/100‑1 (MQ=255) cAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTacaac < 2:15050/100‑1 (MQ=255) cAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGGCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTacaa > 2:2875798/1‑99 (MQ=255) aGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTacaaca < 2:2083819/100‑1 (MQ=255) aGTTCCCCGGTTGCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTacaac < 1:1775344/99‑1 (MQ=255) gTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAg > 2:573723/1‑100 (MQ=255) ttCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGc > 1:2417343/1‑100 (MQ=255) tCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCa > 2:1015507/1‑100 (MQ=255) tCCCCGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATATGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCa < 2:1988449/100‑1 (MQ=255) ccccGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCaa > 1:1248328/1‑100 (MQ=255) ccccGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCa < 2:1208217/99‑1 (MQ=255) cccGGTTTCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCAAg > 2:2604274/1‑100 (MQ=255) tttCAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCAAGCTGcc > 2:1403455/1‑100 (MQ=255) tCAACGATGATGGTCTGCCCCGATGGCAAGAAAGAGAAAAAATTTGACACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCa < 2:2357277/91‑1 (MQ=255) cAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCAAGCTGCCg > 2:1845421/1‑98 (MQ=255) cAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCAAGCTGCCGAt > 2:1732900/1‑100 (MQ=255) cAACGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCAAGCTGCCGAt > 2:2289218/1‑100 (MQ=255) aCGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAATAAAGAGAAGAAATTTGTTACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGTGTTACCACAGCAAGCTGCCGAt > 2:2082815/1‑98 (MQ=255) aCGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCAAGCTGCCGATCg > 2:2844949/1‑100 (MQ=255) aCGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCAAGCTGCCGATCg > 2:2016075/1‑100 (MQ=255) ngatgatGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCAAGCTGCCGATCgt > 1:119/2‑100 (MQ=255) cGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCAAGCTGCCGATCgt < 1:249023/100‑1 (MQ=255) cGATGATGGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCAAGCTGCCGATCgt > 1:205436/1‑100 (MQ=255) atgatgGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCAAGCTGCCGATCgtgg > 1:37251/1‑100 (MQ=255) atgatgGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCAAGCTGCCGATCgtgg < 1:2887699/100‑1 (MQ=255) gatgGTCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCAAGCTGCCGATCgtgg < 2:2386905/98‑1 (MQ=255) | TCGTCTCGGCGGGAAGCTGGAAAACAAAACGCTGGAAGGCTGGGGCTATGATTATTATGTCTTTGATAAAGTCAGTTCCCCGGTTTCAACGATGATGGCCTGCCCGGATGGCAAGAAAGAGAAGAAATTTGTCACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCAAGCTGCCGATCGTGG > NC_000913/2304123‑2304313 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |