Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 433,649 | 0 | T | G | 41.2% | 266.5 / 82.8 | 323 | G65G (GGT→GGG) | ribD | fused diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase and 5‑amino‑6‑(5‑phosphoribosylamino) uracil reductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (40/144); new base G (102/27); total (150/173) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.43e-24 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.46e-01 |
Only 100 of 323 total aligned reads displayed.
TTTCGAAGATATCAAAGAATTTGGCGAAGAGATCGCGCGCCTGGAGGACTAAGCCGTGCAGGACGAGTATTACATGGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAAC‑GAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAAGATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAACGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGC‑GGGTGAAAAAGCCAAA‑GGTGCGACCGCCTATGTCACACTCGAACCCTGTAGCCATCAT‑GGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCACGGCCTGATGATGAGTGAAGCCGAGCAATTGAATAAAGGCTTTCTCAAGCGGATGC > NC_000913/433400‑433881 | tttCGAAGATATCAAAGAATTTGGCGAAGAGATCGCGCGCCTGGAGGACTAAGCCGTGCAGGACGAGTATTACATGGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAAC‑GAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAAGATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAACGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGC‑GGGTGAAAAAGCCAAA‑GGTg < 1:3155312/251‑1 (MQ=255) 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aa‑GGTGCGACCGCCTATGTCACACTCGAACCCTGTAGCCATCAT‑GGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTc < 2:809020/74‑1 (MQ=255) | TTTCGAAGATATCAAAGAATTTGGCGAAGAGATCGCGCGCCTGGAGGACTAAGCCGTGCAGGACGAGTATTACATGGCGCGGGCGCTAAAGCTGGCGCAAC‑GAGGACGTTTTACCACGCATCCCAACCCGAATGTCGGGTGCGTCATTGTCAAAGATGGCGAAATTGTCGGTGAAGGTTACCACCAACGTGCGGGTGAACCACATGCCGAAGTACACGCGTTGCGTATGGC‑GGGTGAAAAAGCCAAA‑GGTGCGACCGCCTATGTCACACTCGAACCCTGTAGCCATCAT‑GGTCGTACGCCACCGTGCTGTGACGCACTCATCGCCGCTGGCGTAGCG‑CGCGTGGTTGCCTCGATGCAAGATCCTAACCCGCAGGTCGCTGGGCGTGGACTTTACCGTCTGCAACAGGCTGGCATTGACGTCAGCCACGGCCTGATGATGAGTGAAGCCGAGCAATTGAATAAAGGCTTTCTCAAGCGGATGC > NC_000913/433400‑433881 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 6 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |