Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 756,550 | C→T | A215V (GCC→GTC) | sdhA → | succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit |
Read alignment evidence... | ||||||||||
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* | NC_000913 | 756,550 | 0 | C→T | 100.0% | 192.9 | 52 | A215V (GCC→GTC) | sdhA | succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (26/26): ref base (0/0): total (26/26) |
TGCACACGCTTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGCCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGAACAAACATGGCGAACGTTTTATGGAGCGTTATGCGCCGAACGCCAAAGACC > NC_000913/756343‑756753 | tGCACACGCTTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGtcc > 1:134227/1‑210 (MQ=255) gCACACGCTTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGTCca < 1:494337/210‑1 (MQ=255) acacGCTTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGTCcaca < 1:570297/210‑1 (MQ=255) acacGCTTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGTCcaca < 2:416130/210‑1 (MQ=255) acGCTGTATCAGCAGAACCTGACAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGCTCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGGGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGTCCACAtt < 1:46230/210‑1 (MQ=255) cGCTTTATCAGCAGAACCTGAAAAACCACACCACCATTTTCTCCGAGTGGTATGCGCTGGATCTGGTGAAAAACCAGGATGGCGCGGTGGTGGGTTGTACCGCACTGTGCATCGAAACCGGTGAAGTGGTTTATTTCAAAGCCCGCGCTACCGTGCTGGCGACTGGCGGAGCAGGGCGTATTTATCAGTCCACCACCAACGTCCACATTa < 1:438958/210‑1 (MQ=255) 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ccaccaccaACGTCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGAACAAACATGGCGAACGTTTTATGGAGCGTTATGCGCCGAACGCCa > 1:526430/1‑210 (MQ=255) accaACGTCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGAACAAACATGGCGAACGTTTTATGGAGCGTTATGCGCCGAACGCCAAAGAc > 1:314898/1‑210 (MQ=255) ccaACGTCCACATTAACACCGGCGACGGTGTCGGCATGGCTATCCGTGCCGGCGTACCGGTGCAGGATATGGAAATGTGGCAGTTCCACCCGACCGGCATTGCCGGTGCGGGCGTACTGGTCACCGAAGGTTGCCGTGGTGAAGGCGGTTATCTGCTGAACAAACATGGCGAACGTTTTATGGAGCGTTATGCGCCGAACGCCAAAGAcc < 2:473231/210‑1 (MQ=255) | 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |