Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 4,360,235 | G→T | intergenic (‑204/+161) | cadB ← / ← cadC | putative lysine/cadaverine transporter/cadBA operon transcriptional activator |
Read alignment evidence... | ||||||||||
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seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,360,235 | 0 | G→T | 100.0% | 168.8 | 45 | intergenic (‑204/+161) | cadB/cadC | putative lysine/cadaverine transporter/cadBA operon transcriptional activator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (17/28): ref base (0/0): total (17/28) |
CTTCTCCTAATTTCATTTTTGAATTTGGAGTCCGGGTCATGATGTATAACTATTTCCTGACCAGACCAAACTGGCGATAAGATTACTCACGAAAAAAGGATTAATCCTAAAGATTAGGTGAAATAACACAAAAGTTTCTGTAAGTGAGAACTTGAGGTTTTTTATTAACACATCAGGATCGCAAGTTGATATCATGAAAAGATAAACATTTAATGTTTACAATGGATTGCGTGACATTCTCTGGTTAAATTTATGTAATAAAAATTATGCGGCAAATAAATTGCCGCAACATATTATACCAACAGGAACATACAAAAACTCAACAACAAATATTTCCGAGCATAAATCAACCCGGAGTTACTTATTCTGAAGCAAGAAATTTGTCGAGATAAGGTACAACATAAGG > NC_000913/4360035‑4360440 | cttctCCTAATTTCATTTTTGAATTTGGAGTCCGGGTCATGATGTATAACTATTTCCTGACCAGACCAAACTGGCGATAAGATTACTCACGAAAAAAGGATTAATCCTAAAGATTAGGTGAAATAACACAAAAGTTTCTGTAAGTGAGAACTTGAGGTTTTTTATTAACACATCAGGATCGCAAGTTGATATCATGAAAATATAAACAtt < 1:197596/210‑1 (MQ=255) tttCATTTTTGAATTTGGAGTCCGGGTCATGATGTATAACTATTTCCTGACCAGACCAAACTGGCGATAAGATTACTCACGAAAAAAGGATTAATCCTAAAGATTAGGTGAAATAACACAAAAGTTTCTGTAAGTGAGAACTTGAGGTTTTTTATTAACACATCAGGATCGCAAGTTGATATCATGAAAATATAAACATTTAATGTTTAc > 1:251978/1‑210 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |