Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | DH1 | 1,971,027 | repeat_region (+) +4 bp :: Δ3 bp | coding (141‑144/144 nt) | yobF → | DUF2527 domain‑containing protein |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | DH1 | 1586746 = | NA (NA) | 325 (1.220) | 163/292 | 0.1 | 96.9% | noncoding (1/1198 nt) | repeat_region | repeat region |
? | DH1 | = 1971030 | 10 (0.040) | coding (144/144 nt) | yobF | DUF2527 domain‑containing protein | |||||
* | ? | DH1 | = 1776306 | NA (NA) | 312 (1.140) | 148/300 | 0.5 | 96.5% | noncoding (1200/1203 nt) | repeat_region | repeat region |
? | DH1 | 1971027 = | 11 (0.040) | coding (141/144 nt) | yobF | DUF2527 domain‑containing protein |
Only 100 of 300 total aligned reads displayed.
AAACTGGGGATAACGCCTTAAATGGCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAATTCCTAAAGAAAGTATCTATTCTGATACGGTTGTTGATTGGTGCGCAGGATCATTTATGCTGGTACGTTTTTCAGATTTTGTGCGTGTAAATGGCTTCGATCAAGGTTACTTTATGTACTGTGAAGATATTGACC > DH1/1776161‑1776456 | aaCTGGGGATAACGCCTTAAATGGCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGACTTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTtaat > 4:52708/1‑150 (MQ=14) aaCTGGGGATAACGCCTTAAATGGCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTtaata < 5:894085/151‑1 (MQ=31) cTGGGGATAACGCCTTAAATGGCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTtaataa > 4:1038597/1‑150 (MQ=32) tAACGCCTTAAATGGCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAATAAAACaaaa > 4:197021/1‑150 (MQ=38) aaCGCCTTAAATGGCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAAt > 1:748162/1‑151 (MQ=39) aCGCCTTAAATGGCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAAtt < 2:368528/151‑1 (MQ=39) cGCCTTAAATGGCGAAGAAACTGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAATTc < 6:727885/151‑1 (MQ=255) gCCTTAAATGGCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAATTcc < 2:814783/151‑1 (MQ=40) tAAATGGCGAAGAAACTGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAATTCCTaa < 4:900738/150‑1 (MQ=255) aaaTGGGGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAATTCCTaaag < 1:311652/151‑1 (MQ=255) aaaTGGCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAATTCCTaaac > 4:300411/1‑150 (MQ=255) aaaTGGCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAATTCCTaaa < 5:1085985/150‑1 (MQ=255) aaTGGCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAATTCCTaa > 5:420339/1‑148 (MQ=255) aTGGCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAATTCCTaaagaa < 3:69312/151‑1 (MQ=255) tGGCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAATTCCTaaagaa > 8:524169/1‑150 (MQ=255) tGGCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAATTCCTaaagaa > 2:891177/1‑150 (MQ=255) gCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAATTCCTAAAGAAAGt < 8:898736/151‑1 (MQ=255) gCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAATTCCTAAAGAAAGt < 6:769561/151‑1 (MQ=255) gCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAATTCCTAAAGAAAGt < 1:848675/151‑1 (MQ=255) gaagaaACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAATTCCTAAAGAAAGTAt < 3:609123/151‑1 (MQ=255) gaagaaACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAATTCCTAAAGAAAGGAt > 4:451131/1‑151 (MQ=255) agaaACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAATTCCTAAAGAAAGTATCt > 2:802156/1‑151 (MQ=255) gaaACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAATTCCTAATGAAAGTATCt > 5:297177/1‑150 (MQ=255) aaCGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAATTCCTAAAGAAAGTATCTAtt < 5:309686/151‑1 (MQ=255) cGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAATTCCTAAAGAAAGTATCTATTCt > 5:835903/1‑151 (MQ=255) cTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAATTCCTAAAGAAAGTATCTATTCTGAt > 6:4459/1‑150 (MQ=255) tAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAATTCCTAAAGAAAGTATCTATTCTGATAc > 3:360316/1‑151 (MQ=255) aaaTAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAATTCCTAAAGAAAGTATCTATTCTGAt < 3:249153/148‑1 (MQ=255) aTAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTAAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAATTCCTAAAGAAAGTATCTATTATGATACGgt > 1:374507/1‑151 (MQ=255) tAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAATTCCTAAAGAAAGTATCTATTCTGATACGgtt > 6:485655/1‑151 (MQ=255) aGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAATTCCTAAAGAAAGTATCTATTCTGATACGgttt > 5:563083/1‑150 (MQ=255) ggCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAATTCCTAAAGAAAGTATCTATTCTGATACGgttgt < 8:29483/151‑1 (MQ=255) gATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAATTCCTAAAGAAAGTATCTATTCTGATACGGTTGTTGAt < 1:561854/151‑1 (MQ=255) gATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAATTCCTAAAGAAAGTATCTATTCTGATACGGTTGTTGAt > 6:643896/1‑151 (MQ=255) 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aCGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAATTCCTAAAGAAAGTATCTATTCTGATACGGTTGTTGATTGGTGCGCAGGAt < 1:457979/150‑1 (MQ=255) agaAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAATTCCTAAAGAAAGTATCTATTCTGATACGGTTGTTGATTGGTGCGCAGGATCATTTa < 1:348746/151‑1 (MQ=255) gaAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAATTCCTAAAGAAAGTATCTATTCTGATACGGTTGTTGATTGGTGCGCAGGATCATTTAt > 8:408452/1‑151 (MQ=255) gaAAAAATCGGATCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCTCTTATTAGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAATTCCTAAAGAAAGTATCTATTCTGATACGGTTGTTGATTGTTGCGCAGGATCATTTAt < 1:380989/151‑1 (MQ=255) gCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAATTCCTAAAGAAAGTATCTATTCTGATACGGTTGTTGATTGGTGCGCAGGATCATTTATGCTGGTACGt > 8:1082172/1‑151 (MQ=255) 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agaaTTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAATTCCTAAAGAAAGTATCTATTCTGATACGGTTGTTGATTGGTGCGCAGGATCATTTATGCTGGTACGTTTTTCAGATTTTGTGCGTGTAAATGGCTTCGATCAAGGtt > 2:983711/1‑151 (MQ=255) aaTTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAATTCCTAAAGAAAGTATCTATTCTGATACGGTTGTTGATTGGTGCGCAGGATCATTTATGCTGGTACGTTTTTCAGATTTTGTGCGTGTAAATGGCTTCGATCAAGGTTAc > 3:1037490/1‑151 (MQ=255) ttCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAATTCCTAAAGAAAGTATCTATTCTGATACGGTTGTTGATTGGTGCGCAGGATCATTTATGCTGGTACGTTTTTCAGATTTTGTGCGTGTAAATGGCTTCGATCAAGGTTACttt > 3:523196/1‑151 (MQ=255) ttCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAATTCCTAAAGAAAGTATCTATTCTGATACGGTTGTTGATTGGTGCGCAGGATCATTTATGCTGGTACGTTTTTCAGATTTTGTGCGTGTAAATGGCTTCGATCAAGGTTACttt > 6:288258/1‑151 (MQ=255) ccccGCTTATTCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAATTCCTAAAGAAAGTATCTATTCTGATACGGTTGTTGATTGGTGCGCAGGATCATTTATGCTGGTACGTTTTTCAGATTTTGTGCGTGTAAATGGCTTCGATCAAGGTTACTTTAt < 7:280430/151‑1 (MQ=255) 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tATTCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAATTCCTAAAGAAAGTATCTATTCTGATACGGTTGTTGATTGGTGCGCAGGATCATTTATGCTGGTACGTTTTTCAGATTTTGTGCGTGTAAATGGCTTCGATCAAGGTTACTTTATGTACtgt > 1:285734/1‑151 (MQ=255) tATTCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAATTCCTAAAGAAAGTATCTATTCTGATACGGTTGTTGATTGGTGCGCAGGATCATTTATGCTGGTACGTTTTTCAGATTTTGTGCGTGTAAATGGCTTCGATCAAGGTTACTTTATGTACtgt > 5:775850/1‑151 (MQ=255) aTTCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAATTCCTAAAGAAAGTATCTATTCTGATACGGTTGTTGATTGGTGCGCAGGATCATTTATGCTGGTACGTTTTTCAGATTTTGTGCGTGTAAATGGCTTCGATCAAGGTTACTTTATTTACtgt < 6:562244/150‑1 (MQ=255) tCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAATTCCTAAAGAAAGTATCTATTCTGATACGGTTGTTGATTGGTGCGCAGGATCATTTATGCTGGTACGTTTTTCAGATTTTGTGCGTGTAAATGGCTTCGATCAAGGTTACTTTa < 6:946393/140‑1 (MQ=255) tCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAATTCCTAAAGAAAGTATCTATTCTGATACGGTTGTTGATTGGTGCGCAGGATCATTTATGCTGGTACGTTTTTCAGATTTTGTGCGTGTAAATGGCTTCGATCAAGGTTACTTTATGTACTGTGa < 1:909178/150‑1 (MQ=255) 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cttAATAAAACAAAAATTCCTAAAGAAAGTATCTATTCTGATACGGTTGTTGATTGGTGCGCAGGATCATTTATGCTGGTACGTTTTTCAGATTTTGTGCGTGTAAATGGCTTCGATCAAGGTTACTTTATGTACTGTGAAGATATTGAcc > 2:708437/1‑151 (MQ=255) | AAACTGGGGATAACGCCTTAAATGGCGAAGAAACGGTCTAAATAGGCTGATTCAAGGCATTTACGGGAGAAAAAATCGGCTCAAACATGAAGAAATGAAATGACTGAGTCAGCCGAGAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCTTAATAAAACAAAAATTCCTAAAGAAAGTATCTATTCTGATACGGTTGTTGATTGGTGCGCAGGATCATTTATGCTGGTACGTTTTTCAGATTTTGTGCGTGTAAATGGCTTCGATCAAGGTTACTTTATGTACTGTGAAGATATTGACC > DH1/1776161‑1776456 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |