New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | DH1 | = 1355505 | 241 (0.880) | 42 (0.180) | 25/260 | 19.1 | 20.6% | noncoding (54/348 nt) | repeat_region | repeat region |
? | DH1 | 3099693 = | 116 (0.490) | noncoding (58/76 nt) | ECDH1_RS15360 | tRNA‑Lys | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
CTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACGGGCC > DH1/3099543‑3099842 | cTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGAtt > 5:328807/1‑151 (MQ=255) ttGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTc > 5:836410/1‑151 (MQ=255) ttcGGGATTATGCTGCCTTAATCATGCAGCATCGCCGGTCGGGCAGGAGTACTCCACTTCGCCCCTCCGATCTTGCATTCTCTAACTCAACGTTATACATCAACAGCTCTACCAGTAAGCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGAtt < 1:1005012/147‑1 (MQ=255) tGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCg > 5:49563/1‑151 (MQ=255) gCGGGATTATTCTTCCTTAATCATTCCGGATGGTGGGTCTTGCATGATGACTCGACTTTGTCTCTCCCTTAGGGCCGTTGCTAATTCAACGTTATACTTAAACTTCTCTTCCAGTAAGCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCg < 2:286013/150‑1 (MQ=21) ggtgATTATGGTGCTTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGTCTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCTACGTTATCGTTCACGTTCTCTACGAGTAACCTCGTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGaa < 4:703854/148‑1 (MQ=25) cGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTTCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGaa < 8:49858/151‑1 (MQ=255) gATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCt > 2:1000316/1‑151 (MQ=255) aTTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCACGTCGGGCCGTTCCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTACTCTACCAGTAACCACCATTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGCTTCGTACCTg > 6:275801/1‑151 (MQ=25) aTTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCCTCTCGCCAGTCGGGCAGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCAACTTTTAATTGGTGGGTCGTGCAGGGTTCGAACCTg > 2:1078728/1‑151 (MQ=25) ttATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGc > 3:146943/1‑151 (MQ=255) cgacgctgcCTTAATTTTTCAGTATTGTGGGTCGCGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTGCTGGCCGTTGCTAACGCCTCGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAAGCTGCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGc < 8:75886/147‑1 (MQ=21) tgctgcCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGAGTTCGTCTCGCCCTTCGGGCATTTGCTAACGCAACGTTAAGCTTCACCGTCACGACCAGTAAACCCCTATAAATTGCTCGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGAc > 5:67964/1‑151 (MQ=21) gcCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAAt > 3:377762/1‑151 (MQ=255) gcCTTAATCATTCAGGATGGGGGGGCGTGCAGGATGACTCGACTTGGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCGAACGCAACTTTATCCTTAACCTTCTCTACCAGTAACCTCCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCa < 7:547996/149‑1 (MQ=25) gcCTTAATCATTCAGCCTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAAt < 3:1046446/151‑1 (MQ=255) ttAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTGCGTCTCGCCCGTCGGGCAGTTGCTACCGCAACCTTATCCTACCCCTTCTCTACCAGAAACCCCCGTGAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGCACCTGCGACCAAt > 7:118747/1‑148 (MQ=21) tAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGAt > 5:857786/1‑151 (MQ=255) tAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTATATAACAGTAAAAACATTTAAATTTGTGGGTAGTGCAGGATTAGAACCTGCGAAAAAGTGAt > 8:818515/1‑151 (MQ=18) aaTCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACGCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGAtt < 1:190091/151‑1 (MQ=255) cctgcaggtaggtcggtcGTGCAGGACGAGGCGACGTCCCCTCGCGCATCGGGCAGTGGCTCACGCAACGTTATACTAAACCTTCGCCACCAGTCCGCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTaaa < 1:442784/141‑1 (MQ=12) cATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTAAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAAATGATTaa > 5:666438/1‑150 (MQ=255) tCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCAGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCACTACCAGTAACAACATTTAAATTGGTTGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAgg > 4:436660/1‑150 (MQ=255) 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aTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTGCGGGCAGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACTTTCTCTTCCAGTTAGCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAAc < 8:775585/150‑1 (MQ=18) ggTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGGTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGCCCAATTGATTAAAAGTCAACttcggt > 3:748113/1‑145 (MQ=255) tGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAAACACCGTTAAAATGGTGGGTCGTGCAGGATTAGAACATTAGACCAATTGAGTAAAAGTCAACTgggcgacgaac > 4:1066095/1‑141 (MQ=18) cAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACATGCGAGCAATAGAGTAAGACTCACCTGCGCTACCGACtc > 5:988429/1‑150 (MQ=18) aTGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCt > 1:135757/1‑151 (MQ=255) ggACTCGACTTCGTCGCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGCTGGGGCGTCCAGGATTCCCACCTGAGACCACTTGATCAAATGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTa < 1:263690/150‑1 (MQ=18) gACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTTAGGAAGAGGCAACGGCTGTAcgccatgccctac > 7:905274/1‑139 (MQ=18) gACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTAACAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCCAACCTGCGAACAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTa > 4:192068/1‑150 (MQ=255) aCTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCCACTGAGCTAAc > 3:158360/1‑151 (MQ=255) cGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCAACGCCCAAGTGATTTAAAATAATGTGCTCGACCATGTGAGATAACGAc > 6:451805/1‑151 (MQ=18) gACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGATATCTAACAGTAAAAAAATTTAAATTGGTGGGTCGTGCATGATTCGAAACTGAGACCTAGGGATTATAAGTCAACTGCGGGACCAAATGatataaagaa > 6:655452/1‑141 (MQ=16) cTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGAcccc > 1:355235/1‑150 (MQ=255) tCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCa < 2:135851/149‑1 (MQ=255) tctcGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGGACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTGCACTGCTCTTCCAACTGCGCTAACGACCCATACgg > 7:119993/1‑151 (MQ=255) tctcGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCACAAAAAACTAAGCAAACGACGAATAca > 6:848172/1‑149 (MQ=18) 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cAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTc < 1:1000752/151‑1 (MQ=255) aggtcgcttatttAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCg < 7:69994/141‑1 (MQ=255) aaCCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGc < 6:49430/151‑1 (MQ=255) cgcttttttACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTg > 2:957661/7‑105 (MQ=255) ccaccTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTCCGTGCAGGATTTTTACGCGGGGCCAATCTTTTAGATTGGTGGGTCGTGCac > 7:610446/1‑150 (MQ=21) cttttttACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTAc > 1:73291/5‑115 (MQ=255) caccTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACGAATTGATTAAAAGTCAACAGCCCTACCACCTGAGCTAACGACGCATACGGGTGTTACCTGAACTATTTTTACTCGCGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAgg < 5:276285/151‑1 (MQ=25) ccatcacaTTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTTCTCTAACAACTTAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGAt < 8:270235/144‑1 (MQ=255) ccTTTAAATTGGTGGGTCGTTCACGAATCCAACCTGCTACCAATTGATTAAAACTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGTCCCATACGGTTGTTACCTGAAACATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGAt < 8:667739/151‑1 (MQ=25) tttACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTa < 2:815949/127‑1 (MQ=255) ttAATTTGGTGGGTCGGGCAGGATGGGAAGCTGCGACCAATTGATTACAAGGCACCTGCGCTCCCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGCTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGa < 5:108269/150‑1 (MQ=25) tttcttGGTTTGTCGTGCATTATTCGAACCTGCTACAAATTTATTAAAAGTCAACTGCTCTACAAACTTAGCTAACGACCCATACGTTTTTTACCTTATATTTTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGAc < 6:998015/146‑1 (MQ=21) aaaTTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACtc < 7:48406/151‑1 (MQ=255) ttGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACCGGTGTTAACATAAATAATTGTTAGAGGGGCCTATCTGTAAGATTGGTGCTTCGTGGAGGAtatcggt > 8:587414/1‑143 (MQ=14) tggtggGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTACGGTGGTTGAGTGAGGGATTTATACTCCGCGCCCCTCGTTATAATATGTGGGTCGTGGAGGATGagtagagt > 8:925784/1‑144 (MQ=2) tggtggGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATAc > 2:599920/1‑80 (MQ=33) tggtggGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATAc < 1:600677/80‑1 (MQ=33) tggtggGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTa < 3:598466/103‑1 (MQ=255) ggTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTtcgctc < 7:425526/151‑1 (MQ=255) gTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGccc > 8:730096/1‑151 (MQ=255) gCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGGGTTAGCGTGAAGATTTGAACTAGGGGCCAGTCTGTATGATTGTTCCTCCGTGCAGTATCCCTCGGGtcgctctcgct > 1:611519/1‑145 (MQ=9) cAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTAc < 1:770433/151‑1 (MQ=255) aGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACg < 5:350270/151‑1 (MQ=255) aTTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACACATACGAATATAAGCTTATAGATTATTACTCTGTTCCAATCTTTAAGAATGGTTGGTCGTCCTGGATGAATCTATTCGCTCGCCCTACGGGc > 4:535722/1‑151 (MQ=18) | CTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACGGGCC > DH1/3099543‑3099842 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |