Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | DH1 | 936,293 | 0 | T | . | 33.8% | 143.5 / 85.3 | 74 | intergenic (‑27/+7) | ECDH1_RS04620/ECDH1_RS04625 | tRNA‑Met/tRNA‑Met |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (41/4); new base . (23/0); total (66/8) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.92e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.27e-02 |
CTGCTTTTACTTCATCAAATTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACGGATT > DH1/936165‑936443 | cTGCTTTTACTTCATCAAATTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCCAGTAATGC‑GATAATTCATCAAATTATAtttccttgacgggtactt > 8:422928/1‑136 (MQ=14) cTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTTTCTTGATGAAATTTTTATTGGTTg > 5:1010950/1‑85 (MQ=14) cTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTg < 6:1009960/85‑1 (MQ=255) tATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCCGGTACTCC‑TATACTTCTACAAAATTTTATTCGTTGCGGCGGAGTGATTAGCACCTACGGCCTTCGGGTTATGAGCCCGCAGAGCAAACAGGCTGCTCCCCCCCGAGTcc > 7:690770/1‑151 (MQ=2) cgaGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATgcgcc > 7:427371/1‑150 (MQ=255) tACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCCGGTAGGGG‑GTGACTTCAGCAATGTTTTATTGGTTGCGGGGGGCTGTTATGAACCGCCGCCCTTCGGCTTGTGATCCCGCAGAGCTACCACGCTGATCCACCCCGCGTCCGTCGATggtccctatc > 3:598812/1‑142 (MQ=9) tACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACAGTAGTCG‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCACGGGCAGGATTAGAACCTCCGACCTTAGGGTTATGATCCAGACGAGCTACCAGGCTCCTCCAGACATAGTCAGTGGATGAGCCCtat > 2:724794/1‑150 (MQ=9) ctgctCCACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTCTACTCCGcg > 6:761506/1‑150 (MQ=255) gctCCACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTcg > 6:651746/1‑151 (MQ=255) tCCACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTcgcg > 5:614614/1‑151 (MQ=255) tCCACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTcgcg > 3:991399/1‑151 (MQ=255) tCCACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCACGCTGCACCACCACGAGTCAGTGGATGCGCACTATACTCCGCTcgcg > 4:1042523/1‑151 (MQ=255) tCCACCCCGCGTCACAGTACTGC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGACCGACGAGATACCAGGCTGCTCCACCCCGAGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTcgcg > 4:1037496/1‑151 (MQ=255) ccACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGt > 1:508438/1‑151 (MQ=255) cACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGtt > 6:297769/1‑151 (MQ=255) cACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGtt > 5:550609/1‑151 (MQ=255) cACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCAGCTCGCGtt > 2:905689/1‑151 (MQ=255) cccccGCGTCACCGTACTGC‑TTTACCTCAACAAAATTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGttt < 3:758078/150‑1 (MQ=255) aCCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGttt > 6:29935/1‑151 (MQ=255) ccccGCGTCACCGTACTGCTTTTACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGGGGATGCGCACTATACTCCg > 3:372518/1‑141 (MQ=11) ccccGCGTCACCGTACTGC‑TTTTATTTATTAAATTTTTATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCg < 4:372380/141‑1 (MQ=255) gctCACCGTACTGC‑TTTTCCTTAATAAAATTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGc < 3:916668/149‑1 (MQ=17) cgTCACCGTACTGCTTTTACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGAAGCGCACTATACTCCGCTAGCGTTTTccttc > 4:397668/1‑147 (MQ=14) cgTCACCGTACTGC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGCCCTTCGGGTTATGATCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGc > 3:932506/1‑151 (MQ=255) gTCACCGTACTGCTTTTACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGTAATCGAAGAATACTACGCTAGCGTTTTCATgg > 6:715815/1‑149 (MQ=11) gTCACCGTACTGC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGc > 2:887402/1‑150 (MQ=255) gTCACCGTACTGC‑TTTACTTAATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACAGCCGACCTTCGGGTTATTAGCCCGACGAGCTACAAGGCTGCTCCACCCCCCGTCCCAGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGc > 7:362056/1‑150 (MQ=18) cACCGTACTGCTTTTACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTACGCTAGCTTTTTCAttc > 4:916022/1‑146 (MQ=14) ccGTACTGC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCt > 5:467008/1‑151 (MQ=255) ccGTACTGC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCt > 2:789058/1‑151 (MQ=255) cGTACTGCTTTTACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCCGGGAAGCCAAGAATACTACGCTAGAGTTTTCATTCAACCtt > 6:860821/1‑151 (MQ=11) cGTACTGC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCtt > 7:601429/1‑151 (MQ=255) gTACTGCTTTTACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGGGGAGGCGGACTATACTCCGCTCGATTTTTCATGCACCCgtt > 7:451568/1‑151 (MQ=11) gTACTGCTTTTACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCCTGGATGCGCACTATAc > 1:964467/1‑125 (MQ=11) gTACTGCTTTTAATTAATAAAATTTT‑ATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATAc < 2:963916/125‑1 (MQ=14) gTACTGC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCttt > 5:1064386/1‑151 (MQ=255) gTACTGC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCttt > 5:860341/1‑151 (MQ=255) tACTGCTTTTACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGAGGATGCGAACTATACAACGCTCGCGTATTCATTCAACCttt > 6:336975/1‑150 (MQ=14) tACTGCTTTTACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACAGGATGCGGAATATACTGCGATAGATTTTTCATTCCACCtttt > 6:570750/1‑151 (MQ=11) tACTGCTTTTACTTCATCAAA‑TTTGATTCGTTGCGGCGCACGCATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGACCCCGACGAGCTACCAGCCTGCTCCACCCCGCGTCCCAGGAAGCCAAGTATACTACACTATAGAATTCATGCAAccgtac > 7:127707/1‑147 (MQ=9) aCTGC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGACCCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCACCCttttt > 6:9334/1‑151 (MQ=255) cTGC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCtttttt > 5:696954/1‑151 (MQ=255) agcgatgtACTTCAT‑AAAATTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCtttt < 1:939573/142‑1 (MQ=18) tgcttttACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGGTTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGGGAAATATACTCCGCTAGCTTTTTCATGCACCCtgttttt > 7:933001/5‑151 (MQ=14) tgcttttACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCAGTATACTACGATAGAGTTTTCATTCAACCttatttt > 2:175103/5‑151 (MQ=14) tgcttttACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGAGGATGCGCATTATACTCCGAGCGCGTATTGGTGCCACCtgagggt > 7:105711/5‑145 (MQ=11) gC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCtttttttt > 6:941764/1‑151 (MQ=255) gC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCACGACGACCTACAAGGATTCTCCACCCAGCGTACGTGGATGCGCACTATACTCAGCTCGCGTTTTCATGCAACCtttttttt > 8:899749/1‑151 (MQ=21) cttttACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGGAGTCTACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAAGCtttgtttt > 3:743284/3‑150 (MQ=17) cttttACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGGGGATTCGCACTATACTACGCTATCGTTTTCATGCAACCtttttttt > 6:976657/3‑150 (MQ=17) cttttACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCCTGGATGCCCACTATACAACGCTATAGTTTTCATTCAGCCttagttat > 2:784091/3‑144 (MQ=11) cttttACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCCGGGATGGGCACTATACTACGCTAGAGTTTTCATTCAGccgggtttatt > 6:600109/3‑142 (MQ=11) gctcaaccgatctAAATTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTa < 1:726910/142‑1 (MQ=18) tttATTTCATAAAATTTT‑ATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTAc < 8:451011/150‑1 (MQ=255) tttACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTAc > 7:297201/1‑151 (MQ=255) tttACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTAc > 2:1078194/1‑151 (MQ=255) tttACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCAGTATACTCCGCTGGCGTTTTGATGCAACCTGTTTTTTAc > 3:755277/1‑150 (MQ=17) aCTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTAcccc > 2:721922/1‑151 (MQ=255) aCTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGATTTCATGCAACCTTTTTTTTAcccc > 2:1009470/1‑151 (MQ=255) aCTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTACGCTAGAGTTTTCATTCAACCttttagataggaac > 2:939093/1‑141 (MQ=17) cTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCAACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCg > 2:397457/1‑151 (MQ=255) ttCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGGGGATGGGGAGTATACTGCGCTCGAGATTTCATTCAGccgtagtgttacca > 7:364965/1‑135 (MQ=11) ttCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACTGGATTCCAACAATACTCCGATCTATTTTTCATGCAACCTTTATTTTAACACGa > 8:731981/1‑150 (MQ=11) tcatcaAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGAt > 4:702793/1‑151 (MQ=255) atcaAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGAGGATGCGCTCTCTACTCCACTCGGCATTTCATGCAAGCTTTATTTTACCCAGATCAc > 1:642578/1‑151 (MQ=14) tcaAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCAc > 1:141871/1‑151 (MQ=255) tcaAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCAc > 8:586745/1‑151 (MQ=255) tcaAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCAc > 3:118048/1‑151 (MQ=255) tcaAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCCTGGATGCCGACAATACTCCCAACGATATTTCATTCAACGTGTCTTATACCCACATCAcc > 3:271638/1‑150 (MQ=2) caAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACg > 5:774676/1‑151 (MQ=255) aaaTTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGACCACgg > 4:79525/1‑151 (MQ=255) aaTTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACgg > 1:1020445/1‑150 (MQ=255) aaTTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACgg > 1:383050/1‑150 (MQ=255) aTTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACGGAt > 2:485128/1‑151 (MQ=255) ttttAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCCCCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCTTGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACGGAtt > 3:380870/1‑151 (MQ=255) ttttAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACGGAtt > 7:189235/1‑151 (MQ=255) | CTGCTTTTACTTCATCAAATTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACGGATT > DH1/936165‑936443 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |