Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | DH1 | 3,184,585 | 0 | C | A | 27.9% | 159.3 / 24.3 | 81 | intergenic (+8/‑30) | ECDH1_RS15795/ECDH1_RS15800 | tRNA‑Gln/tRNA‑TERM |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (28/29); new base A (20/2); total (49/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.46e-04 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GAATCCCGTCGTAGCCACCAAATTCTGAATGTATCGAATATGTTCGGCAAATTCAAAACCAATTTGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTATTCAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTAATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTTGCTTTTCTGCGTTC > DH1/3184436‑3184734 | gAATCCCGTCGTAGCCACCAAATTCTGAATGTATCGAATATGTTCGGCAAATTCAAAACCAATTTGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTATTCa < 8:221631/151‑1 (MQ=255) aTCCCGTCGTAGCCACCAAATTCTGAATGTATCGAATATGTTCGGCAAATTCAAAACCAATTTGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTATTCAAg < 6:944359/151‑1 (MQ=255) cccGTCGTAGCCACCAAATTCTGAATGTATCGAATATGTTCGGCAAATTCAAAACCAATTTGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTATTCAAGa < 6:735000/150‑1 (MQ=255) cccGTCGTAGCCACCAAATTCTGAATGTATCGAATATGTTCGGCAAATTCAAAACCAATTTGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTATTCAAGAc < 8:14804/151‑1 (MQ=255) cgtAGCCACCAAATTCTGAATGTATCGAATATGTTCGGCAAATTCAAAACCAATTTGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTATAAAAGatccctt > 8:558305/1‑145 (MQ=21) cgtAGCCACCAAATTCTGAATGTATCGAATATGTTCGGCAAATTCAAAACCAATTTGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTCATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTAATAAAGaaccat > 8:56196/1‑145 (MQ=255) tAGCCACCAAATTCTGAATGTATCGAATATGTTCGGCAAATTCAAAACCAATTTGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAAATTATTCCAGAAGATTAc > 7:23965/1‑150 (MQ=255) ccaccaCATGATGAATGTATCCAATAGGAGCGGCACATTCAACCCCAATTTGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTATTCAAGACGCTTACCTTg < 3:933121/151‑1 (MQ=21) accaAATTCTGAATGTATCGAATATGTTCGGCAAATTCAAAACCAATTTGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTATTCAAGACGCTTACCTTGTa < 6:429021/151‑1 (MQ=255) acaAATTCTGAATGTATCGAATATGTTCGGCAAATTCAAAACCAATTTGTTGGTGTATCCCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTATTCAAGACGCTTACCTTGTaa < 3:942659/150‑1 (MQ=255) caAATTCTGAATGTATCGAATATGTTCGGCAAATTCAAAACCAATTTGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTATTCAAGACGCTTACCTTGTAAg < 3:879698/151‑1 (MQ=255) caAATTCTGAATGTATCGAATATGTTCGGCAAATTCAAAACCAATTTGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTATTCAAGACGCTTACCTTGTAAg < 3:874461/151‑1 (MQ=255) aaaTTCTGAATGTATCTAATATGTTCGGCAAATTCAAAACCAATTTGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTAGCGCAGGAGAGTTGTTGAAGAAGCTTCACTTGTaggg > 8:944066/1‑148 (MQ=21) ttCTGAATGTATCGAATATGTTCGGCAAATTCAAAACCAATTTGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAAATTATAAAAGATGGCTACGTTGtcatttat > 1:328008/1‑144 (MQ=18) gAATGTATCGAATATGTTCGGCAAATTCAAAACCAATTTGTTGGGGTATCGCCAAGCGGT‑AGGCACCGGATTCTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTATTCAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCAccc < 7:798579/149‑1 (MQ=255) aaTCTATCCAATATGTTCTGCAAATTCAAACCCAATTTGTTTGTGTATCTCCAAGCCGTAATGCACCTGATTCTGATTCCGGCATTCCTAGTTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTATTCAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAg < 2:57325/151‑1 (MQ=25) aaTATGTTCGGCAAATTCAAAACCAATTTGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTATTCAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTa < 6:66831/150‑1 (MQ=255) atatTTTCGGAAAATTAATATCTTCTTTGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTATTCAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATc < 4:173052/151‑1 (MQ=21) cGGCAATTTCAAATCGAATTTGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTATTCAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATCGCCAAg < 6:1056179/150‑1 (MQ=255) aaaaTTCAATACAAATTTGTTGGGTTATCGCAAAGCTGTAAGGCAACGGATTCTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTATTCAAGACGCTTACCTTTTAAGTGCACCGAGTTGGGGTATCGCCAAGCGGt < 6:92542/150‑1 (MQ=25) ataTTCAAAACCACTTTGTTTGTGTATCTCCAACCTTTAAGGAACATGATTCTGTTTCAGGCTTTACGAGGTTCGAATCCTCGTAACCCAGACAATTTATTAAAGACGCTTAAATTTTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTa < 4:616323/149‑1 (MQ=255) aTTCAAAACCAATTTGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCACCGTACCTGGTAAGTGTACCGATTGTGGGTACCTGCAAGGGGTa > 8:594459/1‑149 (MQ=11) tCAAAACCAATTTGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTATAAAAGAGGCGTACCTTGTTAGTGGAGCTATTTGGCGTTTCGCCAAGCGGTAAGGc > 7:929/1‑151 (MQ=18) cAAAACCAGTTTGTTTGGGTCTTTCAACGCTGTAAGGCACCTGATGCTGTTTCCGGCACGCATCGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTATTCAAGACGCTTAACTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGc < 5:722068/150‑1 (MQ=255) aCCAATTTGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTATTAAAGAAGCTTACCTTGTAAGTGCACCAAGTTTGGGTATCGCCAAGAGGTAAGGCAACgg > 3:177133/1‑151 (MQ=25) cccgtttATTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTATTCAAGACGCTTACCt < 4:814400/101‑1 (MQ=255) cccggttattgGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGTTTTTGATACCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAAGTTATTAAAGACGGTTACCt > 3:814749/9‑105 (MQ=11) aTTTGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTATTAAAGAGGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATCGCCAAGCTGTAAGGCACCGGATTc > 4:1070540/1‑151 (MQ=255) attgGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGTTTGTGATACCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTATTCAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTg > 2:1067031/2‑116 (MQ=255) attgGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTATTCAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTg < 1:1067424/115‑1 (MQ=255) ggggTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGTTTTTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTATTCAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATCg > 8:339805/1‑121 (MQ=255) ggggTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACTTTATTCAAGCCGCTTACCTTGTGAGTGCTCCCTGTTGGGGTATCGGCAAGCGGGAAGGCTCCggtgtctgcttgc > 7:548598/1‑140 (MQ=18) ggggTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTATTCAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATCg < 7:340160/121‑1 (MQ=255) aTCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGTTTGTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTATTCAAGACGCTTACCTTGTAAGt > 2:103779/1‑97 (MQ=255) aTCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGGTACGGAGTGCTTTATCCGAGTTGGCGTATCGCCAAGCGGTAAGGCGCCGGagacaatttactgcat > 5:907462/1‑136 (MQ=9) aTCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTATTCAAGACGCTTACCTTGTAAGt < 1:103841/97‑1 (MQ=255) gCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTATTAAAGCCCCTTACCTTGTAAGTGAACCGAGTTGGGGTATCGCCAAGCGCTAAGGCACCGGAGTCTAATTCCGGCCTTcc > 1:186456/1‑151 (MQ=25) aaGCGGTAAGGCACCGGTTTTTGATACCGGCATTCCCTGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTATTc > 3:27013/1‑71 (MQ=1) cgcaacccACCGGATGCTGATACCGGCATTCCGAGGGTCGAATCCTCGTACGCCAGACAATTTATTCAAGCCGCTTACCTTGTAACTGCACGGAGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTAATTCCGGCATTCCGAGGTTc < 1:554553/144‑1 (MQ=25) tgaagcctccGGACTCTGTTACCGGCATTCCGCGCTTCGAATCCTCCTACACCATCATATTTATTCAATACTCTTAACTTGTAAGTGCACCGAGTTGGGGTTTCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTTATTCCGGCATTCCGAgg < 6:603099/139‑1 (MQ=18) cacgcccccGGATGCGGATACCGGCACTCCGCGCTTCGAATCCTCGTACCCCAGACAATTTATTCAAGCCGCTTACCTTGTAATTGCAACCTGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTAATTCCGGCATTCCGAGGTTCGa < 5:659613/144‑1 (MQ=21) cctaaggATTCTGTGTCCGGCATTAATCGGGTCGAATCCTCGTAACCCTGCATATTTCTTATATTCTCGTCCCATGTAATTCCACTTTGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTAATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATcc < 3:1032659/146‑1 (MQ=2) cACCGGATTCTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTAATCAAGATCCGTACCTTGAAAGTGCACCGAGTTTGGGTATCTACAATGTCTAATGCTACGGATACTAATTGCGGCATTcaatgttgcgattccc > 7:460227/1‑136 (MQ=12) cACCGGATTCTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAAATTATAAAAGAAGCATACGTAGTAAGTTCACCCAGTGGGGGTATCGCGAATCGCTAAGGCTCAGGATTCTAATACGAGCATTCAGAGGttgcaaacc > 1:515030/1‑143 (MQ=16) aacaggATTGTGACTCAGGCATTACTAGCTTCGAAGCCTCGAAAGCCTGACACTTTATTCTATCCGCTTACATTGTAATTGCAATCTGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTAATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCt < 8:391440/147‑1 (MQ=9) aaccgATCCTGACACCGGCACTCCCACCTTCGAATCCTCGTACACCTTAAAATTTATTCTAGCCGCTTACCTTTTAACTGCACCGAGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTAATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTc < 6:559947/147‑1 (MQ=17) ccGGATTCTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTATTAAAGAGGCTTACCTTGTAAGTGAACCGAGTTGGGGTATAGACAAGCTGTAAGGCGCCGGTTTCTAGTTCCGTCATTCCGAGGTTCgtctccggg > 3:196238/1‑143 (MQ=25) tttttGATACCGGCATTCCCAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTATTCaa < 2:670387/52‑1 (MQ=17) cTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTAAAAAAGCAGCTTACGTGGTAAGTGCACCCATTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACGGGAGTCTAATTCCGGCATTCAGAGTATCGAAACCGCGTAccgcc > 7:460903/1‑148 (MQ=21) gATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAAATTAAAAAAGAACCGTACCTGGTGAGTGGACCCAGTTGGGGTAGCGGCAAGGGGTAATGCCACGTAGTCTACTTGCCTCATTCCGAGTATCGAGACCACGTCccccctc > 7:880091/1‑148 (MQ=9) ccGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTATTCAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTGATTACGGCATTCCGAGTTTCGAATCCTCGTACCCCAGCcac > 5:1039812/1‑150 (MQ=255) ccGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAAATTATAAAAGCAGCTTACCTTGTTAGTGATCCGAGTAGGGGTAAAGCCAATCTCTAAGGCACAGTTTTCTACTTAATTCATTCAGAGTCTCGACTCAAGGTCCCCCCGCAACATTaaaaa > 5:720375/1‑150 (MQ=255) cGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTATAAAAGAAGCTTTCCTTGTAAGTGCAGCGATTTGGGGTAGAGACAATCTCTAATGCGCGGGTTACTAATTGCGTCATTCAGAGTGTCGACTCCGCGTACCGCAGCCGCATTaaaaaat > 5:713859/1‑150 (MQ=255) cGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAAATTAATAAAGAAGCATACCTAGTAAGTGAACCAATTAGGGGTATATCCAAGCGCTAATGCAACGTATACTACTAAAATCATTCAGAGTATCCAATCCTCCTACCCCAGCGAAAATaaaaaac > 8:892711/1‑150 (MQ=255) gAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTATTAAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATAGACAAGCGGTAATGCACCGGATTCTACTTGCTGCATTCCGAGGATCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGc > 1:802592/1‑151 (MQ=255) aGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTATTCAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTAATTCCGGCATTCCGAGTTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCt > 3:122344/1‑151 (MQ=255) cGAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTATAAAAGACCCATACCTGGTACGTGCAGCCAGTTGGGGTATCGCCAATCGGTAAGGCACAGGAGTCTAATTCAGGCATTCCCAGTATCGAAGCCTCGTGCCCCAGCGACATTAAAAAACCTCGCtt > 5:712786/1‑151 (MQ=255) cGAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTAATAAAGAGGCTTACCTAGTAAGTTAACCAAGTTTGCGTATCTACAATCTGTAATGCACAGGATACTAATTAAATCATTCAGTGTATCAAATACTACTAAACCAGCAACATTAAAAAAGCTCTCtt > 8:155659/1‑151 (MQ=255) gAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTATTCAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCATCGTACCCCAGCCACATAAAAAAACCTCGCTTc > 4:188028/1‑151 (MQ=255) gAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTATTCAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTAATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTc > 2:994192/1‑151 (MQ=255) gAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTATTCAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATCGACAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTAATTCCGGCATTCCGAGGATCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTc > 3:95762/1‑151 (MQ=255) aagccccctACCCCCGCCAATTTATTTTATTATCTTAACTTGTAACAGCTAGCTGTTGTGGTATCTCCAATCTGTTAGGCAACTGATTCTTATTCCGTCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCg < 2:101182/143‑1 (MQ=9) aaTCCTCGTACCCCAGCCAATTTATACAAGCACCTTACCTTGTAAGTTAACCCAGTAGGCGTAACGACAAGCTGGAATGCACAGGATACTCATTCGGGCATTCAAAGGATCGAAGCAACGTGCCCCAGCGACAATAAAAAAGCTAGCTACg > 6:682269/1‑151 (MQ=255) ccTCGTACCGCAGCCAATATATTCAAGCCGCTTCCCTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTAATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGc < 3:429372/150‑1 (MQ=255) gTACCCCAGCCAATTTATTCAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTAATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGGTTCGGCGAGCt > 7:586410/1‑151 (MQ=255) tACCCCAGCCAATTTATTCAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTAATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCtt > 5:866935/1‑151 (MQ=255) tACCCCAGCCAATTTATTCAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTAATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCtt > 3:588962/1‑151 (MQ=255) tACACCAGCCAATTTATTCAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATCGCCAAGAGGTAAGGCACCGGATTCTAATTCCGTCATTCCTAGGTTCGAATCCTCTAACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCTAGCtt > 3:1055824/1‑151 (MQ=255) aCCCCAGCCAATTTATTCAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTAATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCttt > 7:720731/1‑151 (MQ=255) aCCCCAGCCAATTTATTCAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTAATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCttt > 5:450165/1‑151 (MQ=255) ccAGCCAATTTATTCAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTTg > 2:449305/1‑151 (MQ=255) ccAGCCAATTTATTCAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTAATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTTg > 5:609459/1‑151 (MQ=255) cAGCCAATTTATTCAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTAATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTTGc > 6:180180/1‑151 (MQ=255) aGCCAATTTATTCAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTAATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTTGCt > 8:392693/1‑151 (MQ=255) ccAATTTATTCAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTAATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTTGCttt > 3:462605/1‑151 (MQ=255) ctatcttCAAGCCGCGTCCCATGCAACAGCAACGAGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTAATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTTGCtttt < 3:125220/144‑1 (MQ=18) tttATTCAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACACAGTTGGGGTATCGACAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTAATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTTGCATTTCTg > 4:134960/1‑151 (MQ=255) ttATTCAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTAATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTTGCTTTTCTGc > 7:298912/1‑151 (MQ=255) tATTCAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTAATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTTGCTTTTCTGCg > 6:241204/1‑151 (MQ=255) tATTCAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTAATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTTGCTTTTCTGCg > 1:136996/1‑151 (MQ=255) tCAAGTCGGTTACCTTGTAATTGCACTCAGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTAATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTTGCTTTTCTGCGtt < 4:177118/150‑1 (MQ=255) tCAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTAATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTTGCTTTTCTGCGttc > 6:462688/1‑151 (MQ=255) cAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTAATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTTGCTTTTCTGCGttc > 3:456161/1‑150 (MQ=255) | GAATCCCGTCGTAGCCACCAAATTCTGAATGTATCGAATATGTTCGGCAAATTCAAAACCAATTTGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTATTCAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTAATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTTGCTTTTCTGCGTTC > DH1/3184436‑3184734 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |