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Only 100 of 353 total aligned reads displayed.
TGCCGTTGACACATTCGGGCGGAATTCATATGATGCCGCCCGTCAACTCGACAAGCTTTACGTGACGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTTTGCACCCAGCAAACTTGGTACGTAAACGCATCGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTTCCAACCCTCGCTGCAAAGCGGGGGTTTTTTGTCTCTGC > DH1/1358675‑1358974 | tGCCGTTGACACATTCGGGCGGAATTCATATGATGCCGCCCGTCAACTCGACAAGCTTTACGTGACGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTTTGc < 5:164552/150‑1 (MQ=255) gCCGTTGACACATTCGGGCGGAATTCATATGATGCCGCCCGTCAACTCGACAAGCTTTACGTGACGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTTTGCAc > 7:374211/1‑151 (MQ=255) gCCGTTGACACATTCGGGCGGAATTCATATGATGCCGCCCGTCAACTCGACAAGCTTTACGTGACGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTTTGCAc < 1:182747/151‑1 (MQ=255) 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acacATTCGGGCGGAATTCATATGATGCCGCCCGTCAACTCGACAAGCTTTACGTGACGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTTTCCACCCacac > 1:1789096/1‑147 (MQ=255) acacATTCGGGCGGAATTCATATGATGCCGCCCGAAAAATAAAAAATCTTTACTAGACGTAGCTATATATAAGCTGGGAGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTTTCAACCCAGCa > 8:1823307/1‑150 (MQ=17) tcggtcggAATTCATATGATGCCGCCCGTCAACTCGACAAGCTTTACGTGACGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTTTGCACCCAGCAAACTTg < 5:813298/150‑1 (MQ=255) tCGGGCGGAATTCATATGATGCCGCCCGTCAACTCGACAAGCTTTACGTGACGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTTTGCACCCAGCAAACTTg < 8:1552388/150‑1 (MQ=255) tCGGGCGGAATTCATATGATGCCGCCCGTCAACTCGACAAGCTTTACGTGACGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTTTGCACCCAGCAAACTTg < 8:392071/150‑1 (MQ=255) 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tAGCTCCACCAAATTTTGCACCCAGCAAACTTGGTACGTAAACGCATCGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTTCCAACCCTCGCTGCAAAGCg > 8:1003064/1‑151 (MQ=255) cTCCACCAAATTTTGCACCCAGCAAACTTGGTACGTAAACGCATCGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTTCCAACCCTCGCTGCAAAGCgggg > 7:49921/1‑151 (MQ=255) tCCACCAAATTTTGCACCCAGCAAACTTGGTACGTAAACGCATCGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTTCCAACCCTCGCTGCAAAGCggggg > 4:441687/1‑151 (MQ=255) caAATTTTGCACCCAGCAAACTTGGTACGTAAACGCATCGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTTCCAACCCTCGCTGCAAAGCGGGGGttttt > 5:1368907/1‑151 (MQ=255) aaaTTTTGCACCCAGCAAACTTGGTACGTAAACGCATCGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTTCCAACCCTCGCTGCAAAGCGGGGGtttttt > 1:1338936/1‑151 (MQ=255) aaTTTTGCACCCAGCAAACTTGGTACGTAAACGCATCGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTTCCAACCCTCGCTGCAAAGCGGGGGTTTTTTg > 3:671989/1‑151 (MQ=255) ttttGCACCCAGCAAACTTGGTACGTAAACGCATCGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTTCCAACCCTCGCTGCAAAGCGGGGGTTTTTTGtg > 5:2995/1‑150 (MQ=255) tttGCACCCAGCAAACTTGGTACGTAAACGCATCGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTTCCAACCCTCGCTGCAAAGCGGGGGTTTTTTGtct > 4:1365325/1‑151 (MQ=255) tttGCACCCAGCAAACTTGGTACGTAAACGCATCGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTTCCAACCCTCGCTGCAAAGCGGGGGTTTTTTGtct > 8:2032513/1‑151 (MQ=255) tGCACCCAGCAAACTTGGTACGTAAACGCATCGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTTCCAACCCTCGCTGCAAAGCGGGGGTTTTTTGTctct > 4:704813/1‑151 (MQ=255) gCACCCAGGACACTTGGTACCTCAACGCCTCGGGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTTCCAACCCTCGCTGCAAAGCGGGGGTTTTTTGTCTCTg < 7:1095478/151‑1 (MQ=21) cACCCAGCAAACTTGGTACGTAAACGCATCGTGGGGCTATAGCTCACCTGGGAGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAGTTCAGCGGTTCGATCCCGCTAAGCTCCACCAAATTTCAAACCCACCCTGCAAAGCGGCGGTTTTTAGACTCTGc > 8:1885493/1‑151 (MQ=21) | TGCCGTTGACACATTCGGGCGGAATTCATATGATGCCGCCCGTCAACTCGACAAGCTTTACGTGACGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTTTGCACCCAGCAAACTTGGTACGTAAACGCATCGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCTTGCATGGCATGCAAGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTTCCAACCCTCGCTGCAAAGCGGGGGTTTTTTGTCTCTGC > DH1/1358675‑1358974 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |