| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | DH1 | = 2732077 | 361 (0.750) | 167 (0.350) | 118/292 | 9.5 | 31.6% | coding (12/1041 nt) | plsX | phosphate acyltransferase |
| ? | DH1 | = 3855990 | NA (NA) | noncoding (1346/1346 nt) | repeat_region | repeat region | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 464 total aligned reads displayed.
AGAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTGATCCCCGCCACTTTACAGGTGCTCGCATATCTTCAACGCACCCTATTTTTACCCAGGCCTGCCCACGGGCAGGCTTTTGGGGAGGTTAGCGGGTCAGGTCGTCAAAAAACTTCTTCACACCATCAAAGAAGCTCTTTGAGCGCGGGC > DH1/3855841‑3856140 | gagCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGTCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGt < 6:11313/151‑1 (MQ=14) gagCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGt < 3:385311/151‑1 (MQ=31) gCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTg > 7:1374264/1‑150 (MQ=31) gCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTGa < 1:351348/151‑1 (MQ=32) ccccGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTGAt > 2:513475/1‑151 (MQ=33) ggCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTGATcccc < 8:159442/151‑1 (MQ=33) aTTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTGATCCCCGcc > 3:612878/1‑151 (MQ=35) aTTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTGATCCCCGcc < 6:78949/151‑1 (MQ=35) tACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTGATCCCCGCCa < 4:947877/150‑1 (MQ=35) aCGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCGTATGGGAGTGATCCCCGCCAc < 3:32651/150‑1 (MQ=37) tGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTGATCCCCGCCACttt > 6:194115/1‑150 (MQ=39) ccGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTGATCCCCGCCACTTTAc > 8:1498498/1‑150 (MQ=40) cagAAGTATCCAGTTCATCGGTCTTACAAATATGGGCCAGAATTGCTGAGCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGTCAAGTTAAATCATATCAGGCTTAATAACACAACCCTTAAGTTAGCGATTATGGGAGTGATCCCCGCCACTTTACa < 6:290124/149‑1 (MQ=14) gTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTGATCCCCGCCACTTTACAGGTGc < 4:868217/151‑1 (MQ=255) ttcGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTGATCCCCGCCACTTTACAGGTGCTCGCATATCtt > 6:1702849/1‑151 (MQ=255) tcGGGCTTACCAATATGGGCGAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCACGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTGATCCCCGCCACTTTACAGGTGCTCGCATATCtt < 2:1053649/150‑1 (MQ=255) tcGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTGATCCCCGCCACTTTACAGGTGCTCGCATATCtt < 4:1853303/150‑1 (MQ=255) tcGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTGATCCCCGCCACTTTACAGGTGCTCGCATATCtt < 7:1172983/150‑1 (MQ=255) 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aaTTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTGATCCCCGCCACTTTACAGGTGCTCGCATATCTTCAACGCACCCTATTTTTACCCAgg > 1:1553267/1‑151 (MQ=255) aaTTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTGATCCCCGCCACTTTACAGGTGCTCGCATATCTTCAACGCACCCTATTTTTACCCAgg < 2:1385507/151‑1 (MQ=255) aTTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTCAGCGCTTATGGGAGTGATCCCCGCCACTTTACAGGTGCTCGCATATCTTCAACGCACCCTATTTTTACCCAGGc > 3:817254/1‑151 (MQ=255) tGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCCTCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGGTTATGGGAGTGATCCCCGCGCGTTTACAGGTGCTCGCATATCTTCAACGCACCCTATTTTTACCCAGGCCt > 4:1575686/1‑151 (MQ=255) cTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTGATCCCCGCCACTTTACAGGTGCTCGCATATCTTCAACGCACCCTATTTTTACCCAGGCCTGc > 7:237417/1‑151 (MQ=255) cTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTGATCCCCGCCACTTTACAGGTGCTCGCATATCTTCAACGCACCCTATTTTTACCCAGGCCTGc > 3:665263/1‑151 (MQ=255) tGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTGATCCCCGCCACTTTACAGGTGCTCGCATATCTTCAACGCACCCTATTTTTACCCAGGCCTGcc > 7:1063992/1‑151 (MQ=255) gACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTGATCCCCGCCACTTTACAGGTGCTCGCATATCTTCAACGCACCCTATTTTTACCCAGGCCTGccc < 3:1182964/151‑1 (MQ=255) aCCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTGATCCCCGCCACTTTACAGGTGCTCGCATATCTTCAACGCACCCTATTTTTACCCAGGCCTGCCCa < 5:320048/151‑1 (MQ=255) ccAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTGATCCCCGCCACTTTACAGGTGCTCGCATATCTTCAACGCACCCTATTTTTACCCAGGCCTGCCCAc > 6:1034322/1‑151 (MQ=255) 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cGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTGATCCCCGCCACTTTACAGGTGCTCGCATATCTTCAACGCACCCTATTTTTACCCAGGCCTGCCCACGGGCAGGc < 2:860732/151‑1 (MQ=255) cGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTGATCCCCGCCACTTTACAGGTGCTCGCATATCTTCAACGCACCCTATTTTTACCCAGCCATGCCCACGGGCAGGc > 5:1581372/1‑151 (MQ=255) gTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTGATCCCCGCCACTTTACAGGTGCTCGCATATCTTCAACGCACCCTATTTTTACCCAGGCCTGCCCACGGGCAGGCt > 8:168695/1‑151 (MQ=255) gagTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTGATCCCCGCCACTTTACAGGTGCTCGCATATCTTCAACGCACCCTATTTTTACCCAGGCCTGCCCACGGGCAGGCTTTTg < 5:1499518/151‑1 (MQ=255) gagTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTGATCCCCGCCACTTTACAGGTGCTCGCATATCTTCAACGCACCCTATTTTTACCCAGGCCTGCCCACGGGCAGGCTTTTg > 5:1076830/1‑151 (MQ=255) agTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTGATCCCCGCCACTTTACAGGTGCTCGCATATCTTCAACGCACCCTATTTTTACCCAGGCCTGCCCACGGGCAGGCTTTTgg > 3:981416/1‑151 (MQ=255) ttCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTGATCCCCGCCACTTTACAGGTGCTCGCATATCTTCAACGCACCCTATTTTTACCCAGGCCTGCCCACGGGCAGGCTTTTGGGGAgg > 7:1440206/1‑151 (MQ=255) cATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTGATCCCCGCCACTTTACAGGTGCTCGCATATCTTCAACGCACCCTATTTTTACCCAGGCCTGCCCACGGGCAGGCTTTTGGGGAGGtt > 5:130276/1‑151 (MQ=255) cATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTGATCCCCGCCACTTTACAGGTGCTCGCATATCTTCAACGCACCCTATTTTTACCCAGGCCTGCCCACGGGCAGGCTTTTGGGGAGGtt > 1:1246261/1‑151 (MQ=255) tCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTGATCCCCGCCACTTTACAGGTGCTCGCATATCTTCAACGCACCCTATTTTTACCCAGGCCTGCCCACGGGCAGGCTTTTGGGGAGGtt > 8:1791250/1‑149 (MQ=255) 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ttAAGTTAGCGCTTATGGGAGTGATCCCCGCCACTTTACAGGTGCTCGCATATCTTCAACGCACCCTATTTTTACCCAGGCCTGCCCACGGGCAGGCTTTTGGGGAGGTTAGCGGGTCAGGTCGTCAAAAAACTTCTTCACACCATCaa > 2:339097/1‑149 (MQ=255) aaGTTAGCGCTTATGGGAGTGATCCCCGCCACTTTACAGGTGCTCGCATATCTTCAACGCACCCTATTTTTACCCAGGCCTGCCCACGGGCAGGCTTTTGGGGAGGTTAGCGGGTCAGGTCGTCAAAAAACTTCTTCACACCATCAaaga < 2:580410/150‑1 (MQ=255) aaGTTAGCGCTTATGGGAGTGATCCCCGCCACTTTACAGGTGCTCGCATATCTTCAACGCACCCTATTTTTACCCAGGCCTGCCCACGGGCAGGCTTTTGGGGAGGTTAGCGGGTCAGGTCGTCAAAAAACTTCTTCACACCATCAaaga < 2:705493/150‑1 (MQ=255) aaGTCAGCGCTTATGGGAGTGATCCCCGCCACTTTACAGGTGCTCGCATATCTTCAACGCACCCTATTTTTACCCAGGCCTGCCCACGGGCAGGCTTTTGGGGAGGTTAGCGGGTCAGGTCGTCAAAAAACTTCTTCACACCATCAaagaa < 4:816288/151‑1 (MQ=255) aGTTAGCGCTTATGGGAGTGATCCCCGCCACTTTACAGGTGCTCGCATATCTTCAACGCACCCTATTTTTACCCAGGCCTGCCCACGGGCAGGCTTTTGGGGAGGTTAGCGGGTCAGGTCGTCAAAAAACTTCTTCACACCATCAaagaag < 8:1068468/151‑1 (MQ=255) 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aTGGGAGTGATCCCCGCCACTTTACAGGTGCTCGCATATCTTCAACGCACCCTATTTTTACCCAGGCCTGCCCACGGGCAGGCTTTTGGGGAGGTTAGCGGGTCAGGTCGTCAAAAAACTTCTTCACACCATCAAAGAAGCTCTTTGAgcg > 1:656406/1‑151 (MQ=255) ggAGTGATCCCCGCCACTTTACAGGTGCTCGCATATCTTCAACGCACCCTATTTTTACCCAGGCCTGCCCACGGGCAGGCTTTTGGGGAGGTTAGCGGGTCAGGTCGTCAAAAAACTTCTTCCCACCATCAAAGAAGCTCTTTGAGCGCgg > 6:1804211/1‑151 (MQ=255) | AGAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTGATCCCCGCCACTTTACAGGTGCTCGCATATCTTCAACGCACCCTATTTTTACCCAGGCCTGCCCACGGGCAGGCTTTTGGGGAGGTTAGCGGGTCAGGTCGTCAAAAAACTTCTTCACACCATCAAAGAAGCTCTTTGAGCGCGGGC > DH1/3855841‑3856140 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |