| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | DH1 | 2290085 = | 199 (0.410) | 305 (0.630) | 183/296 | 1.4 | 60.5% | coding (447/531 nt) | ydeS | fimbrial‑like adhesin protein |
| ? | DH1 | 2409238 = | NA (NA) | noncoding (4/1335 nt) | repeat_region | repeat region | |||||
Only 100 of 505 total aligned reads displayed.
GGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACGGCGTACCACACAGGAAAAGAT > DH1/2409088‑2409384 | ggCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGttt < 5:333514/151‑1 (MQ=255)ggCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGttt < 2:1518993/151‑1 (MQ=255)ggCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGttt < 6:559185/151‑1 (MQ=255) cTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGttt > 3:62608/1‑149 (MQ=255) ccTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGc < 5:1595683/151‑1 (MQ=255) ctgctgTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGcccc > 3:466091/1‑151 (MQ=255) gctgTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCt < 7:1315537/151‑1 (MQ=255) gTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGa < 8:230845/150‑1 (MQ=255) gTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGa < 1:69150/150‑1 (MQ=255) gTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGa > 3:1402271/1‑150 (MQ=255) aaaTGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAAt < 6:1015409/150‑1 (MQ=255) gTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTcc > 7:1548890/1‑150 (MQ=255) tCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTcc > 5:180808/1‑148 (MQ=255) tCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAg < 5:401941/150‑1 (MQ=255) gTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACAAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCAGCAGAc > 6:891678/1‑150 (MQ=255) tctcATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACa > 4:1399542/1‑150 (MQ=255) ctcATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAAc > 5:701001/1‑151 (MQ=255) cATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACaa < 1:1786418/148‑1 (MQ=255) tCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAat < 3:1417354/150‑1 (MQ=255) cAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAata < 3:1625141/150‑1 (MQ=255) aaaaaaCCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATc < 6:628908/151‑1 (MQ=255) ccTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTaa < 2:1284041/151‑1 (MQ=255) ccGCAACCCCATGTTTTCACATAACTTTTGCGTTGAACAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCATCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAAt < 5:555924/150‑1 (MQ=255) ccGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAAt < 8:576809/150‑1 (MQ=255) ccGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAAt < 4:6035/150‑1 (MQ=255) ccGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAAt < 4:178899/150‑1 (MQ=255) ccAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAg < 2:244185/150‑1 (MQ=255) aaCCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTg > 8:1483991/1‑151 (MQ=255) aaCCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTg < 7:316324/151‑1 (MQ=255) ccccATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGAt > 4:162513/1‑151 (MQ=255) cATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGt > 7:573039/1‑151 (MQ=255) cATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGt < 3:1865374/151‑1 (MQ=255) cATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGt < 5:1452008/151‑1 (MQ=255) cATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGt < 1:415156/151‑1 (MQ=255) cATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGt < 7:1707893/151‑1 (MQ=255) aTGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTc < 3:708475/151‑1 (MQ=255) gTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCtt < 6:710274/151‑1 (MQ=255) gTTTTCACATAACTGTGGCGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCtt < 3:1708017/151‑1 (MQ=255) ttttCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAATTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCtt < 4:1064203/150‑1 (MQ=255) cacaTAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATa < 8:334134/150‑1 (MQ=255) cacaTAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATa < 7:435378/150‑1 (MQ=255) aaCTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGt < 1:938322/150‑1 (MQ=255) cTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGtttt > 2:1706563/1‑151 (MQ=255) gTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGttttt < 3:1346835/150‑1 (MQ=255) gTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTa < 2:1038774/151‑1 (MQ=255) gCGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTCATAGTCTAAATACTAGTTTTTAGAc > 6:1859658/1‑151 (MQ=255) cGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACt < 7:468510/151‑1 (MQ=255) gTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACt > 3:928191/1‑150 (MQ=255) gTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTa < 5:1330148/151‑1 (MQ=255) ttGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTat > 8:781280/1‑150 (MQ=255) gACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGt < 7:1810830/150‑1 (MQ=255) aCCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTc > 7:1632455/1‑150 (MQ=255) aaTTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTg > 7:70926/1‑151 (MQ=255) aTTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTgg < 6:171018/151‑1 (MQ=255) aTTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTgg < 3:1489773/151‑1 (MQ=255) gAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTgg > 6:420823/1‑148 (MQ=255) aTCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTCATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGaa > 5:1260471/1‑150 (MQ=255) aTCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTGTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACACCCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAAc > 2:744505/1‑151 (MQ=255) aCAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAgat < 1:1401592/151‑1 (MQ=255) aCAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAg < 2:883526/149‑1 (MQ=255) aaGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAgatg > 4:788372/1‑150 (MQ=255) aGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAgatgat > 3:29220/1‑151 (MQ=255) aCCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAACTTCTAGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGAtgattg < 7:1404623/150‑1 (MQ=255) ccTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGATCAGAtgattgat > 6:1556495/1‑151 (MQ=255) ccTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGAtgattgat > 6:1469325/1‑151 (MQ=255) cTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATg > 3:525324/1‑151 (MQ=255) ttattaACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATg < 8:414669/149‑1 (MQ=255) ttattaACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATg < 1:247148/149‑1 (MQ=255) ttattaACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGt < 5:790842/150‑1 (MQ=255) tattaACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTc < 6:1330366/150‑1 (MQ=255) tattaACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTc < 5:211583/150‑1 (MQ=255) attaACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCt < 1:1540335/150‑1 (MQ=255) aCAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAggg > 4:915654/1‑151 (MQ=255) cAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGc > 1:1251587/1‑151 (MQ=255) aaaTTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGGCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATAATAGTTTTTAGAGTAGTCATTGGAGAACTGATGATTGATGTCTTAggc > 4:253967/2‑149 (MQ=255) tttCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTACAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCgg < 8:1849877/150‑1 (MQ=255) tCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCgg > 5:886126/1‑148 (MQ=255) gCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGaa > 4:514304/1‑150 (MQ=255) cGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGc > 8:137485/1‑150 (MQ=255) ggAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGc > 2:583630/1‑149 (MQ=255) gAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGa < 4:377106/151‑1 (MQ=255) gAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGa < 1:1914495/151‑1 (MQ=255) aaTCAGCATAAGTAATTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGAc < 7:965024/151‑1 (MQ=255) aaTCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGAc > 4:722477/1‑151 (MQ=255) cAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACgg < 3:1070132/150‑1 (MQ=255) cAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACGGc > 3:833682/1‑151 (MQ=255) cAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACGGc < 8:1646354/151‑1 (MQ=255) cATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGCGAAACGCAGACGGCGt > 4:981974/1‑150 (MQ=255) aagtaagtTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACGGCGTAcc > 1:106358/1‑150 (MQ=40) taagtTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACGGCGTACcacac > 6:1167035/1‑151 (MQ=37) aagtTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACGGCGTACcacaca < 1:1185238/151‑1 (MQ=37) aagtTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACGGCGTACcacaca < 8:1138757/151‑1 (MQ=37) gtTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACGGCGTACCACACAgg < 2:1861899/151‑1 (MQ=35) gtTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACGGCGTACCACACAgg < 5:1776756/151‑1 (MQ=35) ttCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACGGCGTACCACACAgg < 2:1593149/150‑1 (MQ=34) tCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGCAACGCAGACGGCGTTCCACACAggc > 7:1169554/1‑149 (MQ=18) tCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACGGCGTACCACACAGGa < 3:1139296/150‑1 (MQ=33) ggggTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACGGCGTACCACACAGGaaa < 6:254588/149‑1 (MQ=31) ggggTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACGGCGTACCACACAGGaaa < 5:1073074/149‑1 (MQ=31) ggTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACGGCGTACCACACAGGAAAAGAt < 5:1558213/151‑1 (MQ=11) | GGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACAAGTACCTTTATTAACAATTTTCGCACCGGAATCAGCATAAGTAAGTTCTGGGGTTTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATGTCTTAGGGCCGGAGAAACGCAGACGGCGTACCACACAGGAAAAGAT > DH1/2409088‑2409384 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |