Read alignment evidence... | |||||||||||
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Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
TCCACCCCGCGTCACCGTACTGCTTTTACTTCATCAAATTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTT‑TTTTTACCCCGATCACGGATT > DH1/936146‑936443 | ggcACCCCGCTTCCCCGTACTGCGGGTACTGCGTGATATTTCATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTGACCGTACTGC‑TTTACTTCATCAAAtttt < 3:1917883/149‑1 (MQ=14) aCCGTACTGCTTTTACTTCATCAAATTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCCAGTAGTCC‑TATACTTCAGCAAAGTATAATTGCTTGAggg > 1:329831/1‑151 (MQ=17) cTGCTTTTACTTCATCAAATTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCAACCCAACCTCAACGTAGTGC‑TATACATAATCATATTATAATTAGTTCCggggggagc > 8:110079/1‑147 (MQ=17) 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gaGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCCCGTAGTGC‑GTTAATTCATCAAAGTTTATTTGGTTCCGGGGTCAGGATTTGACCCGCCCCCCTTCGGGTTTAGAGGCCGACTAGCTACAACGCTACTCCCGACCGCGTCCGTCGATgatccg > 7:720225/1‑146 (MQ=9) aGGCTGCTCCACCCCGCGTCCCGGTAGGGC‑GTTTCTTCATCAAATTTTAATTGGTTCCGCGGGCCGGATTTGCACCGAACCCCTTCGGGTTATGAGACCGACGAGCGACCAGGCTGCTGCCCACAGAGTCCGTGGATgatccgtaaagtcc > 2:167278/1‑138 (MQ=9) ggCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGCCCCGCCGACCTTCGGGTTATGAGCCCGCCGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGGGGATGCGCACTATACTCCg > 1:1213655/1‑151 (MQ=255) cACCCCGCGTCACCGTACTGCTTTTAATTAAGCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCCTGGATGCGGAGTATACTCCGCTGGGGtt > 2:641264/1‑151 (MQ=11) cACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGtt > 5:327120/1‑151 (MQ=255) 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acataaaTTTTTATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTT‑TTTTTACCCCGATc < 3:1451035/147‑1 (MQ=255) atcaAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTGGCGTTTTCATGCAACCTTT‑TTTTTACCCCGATc > 1:792392/1‑150 (MQ=255) atcaAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTT‑TTTTTACCCCGATc > 2:704666/1‑150 (MQ=255) atcaAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTT‑TTTTTACCCCGATc > 1:689528/1‑150 (MQ=255) atcaAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTT‑TTTTTACCCCGATc > 3:43052/1‑150 (MQ=255) 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caAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTT‑TTTTTAACCAGATCACg > 6:1064468/1‑151 (MQ=255) caAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTCAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATCCAACCTAT‑TTTTTACCCCGATCACg > 5:987703/1‑151 (MQ=255) aaaTTTTTATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTT‑TTTTTACCCCGATCACgg < 4:764175/151‑1 (MQ=255) aaaTTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTT‑TTTTTACCCCGATCACgg > 3:1178960/1‑151 (MQ=255) aaaTTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCAACCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTT‑TTTTTACCCCGATCACgg > 2:1933019/1‑151 (MQ=255) aaTTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTT‑TTTTTACCCCGATCACgg > 6:83145/1‑150 (MQ=255) aaTTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTT‑TTTTTACCCCGATCACgg > 7:653811/1‑150 (MQ=255) aaTTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTT‑ATTTTACCCCGATCACgg > 6:926647/1‑150 (MQ=255) aTTTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTT‑TTTTTACCCCGATCACGGAt < 6:1440514/151‑1 (MQ=255) aTTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTT‑TTTTTACCCCGATCACGGAt > 5:587291/1‑151 (MQ=255) aTTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTT‑TTTTTACCCCGATCACGGAt > 4:884042/1‑151 (MQ=255) ttttAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTT‑TTTTTACCCCGATCACGGAtt > 1:630948/1‑151 (MQ=255) | TCCACCCCGCGTCACCGTACTGCTTTTACTTCATCAAATTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTT‑TTTTTACCCCGATCACGGATT > DH1/936146‑936443 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |