New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | DH1 | = 1519281 | 409 (0.700) | 68 (0.130) +AACCTTCTAATT |
42/276 | 34.8 | 15.3% | coding (788/900 nt) | yfaD | transposase |
? | DH1 | 1519282 = | 409 (0.700) | coding (787/900 nt) | yfaD | transposase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
TCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > DH1/1519242‑1519281 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGATAA > DH1/1519282‑1519427 |||||||||||| TCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTTGTGCTTACGGATCGGCAAaatccg > 5:1759677/1‑145 ATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGCTGAAGGTTCATCAAAATCCTAAATA > 2:177883/1‑150 TGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTTGTGGTTTAGGTTCCGCAATCTCCgggata > 5:1581989/1‑143 gggcttacgatcTTAATGGCTTGTTTATGGAAAGGTTCTAATATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGGCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAAC < 7:1059749/139‑1 CAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTTGTGGTGACCGTTCGGCAGTCTCCTCCATAAAAGGG > 5:1890198/1‑151 ccgagcTTTTAATCGCTTTTTCATTCACTCCTTCAAATATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATCAAACGGGT < 1:1926440/145‑1 aatgaTAATCGCATGTTCATTCAAAGCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGGAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAA < 6:1889346/146‑1 TTTTAATGGCTTGTTTATGGAAACCTTCAATTTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATA < 6:711905/137‑1 TTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTTGTGCTGAACGTTCTGCAATATCCTCAATA > 5:712360/1‑137 TTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGATGAAGGATCGTCAATCTCATAAATAATACGTGTGAAACG > 6:2085319/1‑151 TTTAATGGCTTTTTCATTCAAAGCTTCTAAATTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGA < 1:1687591/146‑1 TTTAATGGCTTTTTAATTCAATGCTTCAACATTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGGCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGT < 1:1208147/144‑1 TTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTTAACGTTAGGCAATCTCATAAATAAAACGGGT > 2:1925881/1‑144 TTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAATCGGGTGAAACGG > 3:1575223/1‑151 TTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGATCGGCAATATCCTAAATAAAACGTGTca > 2:1686740/1‑144 TTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTT < 2:1892078/118‑1 TTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGTTGAACGTT > 1:1892539/1‑118 TAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAA < 8:1495712/113‑1 TAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAA > 7:1496534/1‑113 TAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTCGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTCAAACGGG > 3:885747/1‑150 TAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTTAACGTTCTGCAATCTCATGAATAAAGCGGGTGAAACGGG > 7:2022246/1‑150 TAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTTAACGTTCAGCAATCTCCTAAATAAAAC > 8:1059146/1‑138 TAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGATTAACGATCGTCAAACTCATCAATAAAAC > 8:188730/1‑138 TAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGGCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACG > 1:1631437/1‑148 TAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACG < 2:1630646/148‑1 taagatcTGTTCATGCAATCGTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGG < 8:564128/142‑1 AATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTTAACGTTAGGCAATATCCTAAATAAAACGGGTGAAACGGG > 3:1531157/1‑149 AATCGCTTGTTCATTCAAAGCTTCAACTATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGACCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCT < 7:1612169/125‑1 TGGCTTTTTAATTCAATCGTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGT < 3:729430/82‑1 TGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAA > 6:1712357/1‑132 GCTTGTTCATGCAATCGTTCAAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTAT < 8:2020933/151‑1 GCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGT < 4:18503/111‑1 GCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGT > 3:18534/1‑111 gttttttattctattCTTCTATTTTACCTTCCTGCGAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCTGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATC < 4:1088174/136‑1 CTTGTTCATGCAAAGCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATT < 4:1174276/83‑1 CTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGTGTGAAACGGGAGCTATC > 5:1274562/1‑151 CTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGACCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATT > 3:1175227/1‑83 tttTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGA < 8:1271562/134‑1 TTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTT > 3:174701/1‑110 TTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGTTGAACGTTCGGCAATCTCATCAATAAAACGGGTGA > 7:1272430/1‑137 TTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCATCA > 8:1450392/1‑124 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8:46761/142‑1 ATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGGAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAACACGTGTGAACCGCGAGGTATCGCCGCAT > 5:944974/1‑151 ATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGTGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCAT > 3:746376/1‑151 TGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCATCAATAAAAGTTGTGCAACGGGAGGTATCGCCTCATT > 1:966420/1‑151 atAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATT < 1:646234/148‑1 GCAAAGCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGT < 3:323202/139‑1 GCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATT < 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TTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGGCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCTCATTGCAGC > 8:1239333/1‑148 TTCTAATATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAAC < 6:1495315/125‑1 tgTAATTTACCTTCCTGCGAGCGAATTTGATGGCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGA < 8:449578/148‑1 gaataTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGGCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGAT < 7:153358/145‑1 cttATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAA < 3:2187442/64‑1 TAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGTGTCAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGATA > 3:744427/1‑150 TAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCATCAATAAAACGTGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGC > 1:1167338/1‑142 TAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGAga > 4:1745941/1‑148 TAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGACCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGC < 2:1166486/142‑1 AATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGTGTGCAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGATAA > 5:91631/1‑150 AATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGAT < 2:965746/148‑1 ATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGGCCTTCCTGCCGGAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATA > 2:715718/1‑107 ATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATA < 1:715868/107‑1 ATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGACCTTCCTGCCGGAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCATCAATAAAACGTGTCAA > 6:449010/1‑118 |||||||||||| TCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > DH1/1519242‑1519281 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGATAA > DH1/1519282‑1519427 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |