| Predicted mutation | ||||||
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| JC | DH1 | 3,702,452 | (GTCATAACGACCGCCTAGGG)1→2 | coding (1442/2244 nt) | fhuA ← | ferrichrome‑iron receptor |
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| ? | DH1 | = 3702452 | 111 (0.190) | coding (1442/2244 nt) | fhuA | ferrichrome‑iron receptor | |||||
Only 100 of 1124 total aligned reads displayed.
CGAAGAAGGTTCAAACGATTCGCTATAGCTGAAGTAAGGTGTTACACCATTATCAAACAGGTAGTTAACACCACCACGCCAGGTAAACTGTTTGTCATCACGTTTATCGGTCGTCCCGGCAACGCGGTTAAGAGATTCTTGATCTGCCCAGTCATAACGACCGCCTAGGGTGACCAGCACTTTATCCCACTGCGCCTGATCCTGAACATAAACGCCCGTTTGTTTCTGTTTATTCAGAATGCGGTAAGGGCCGGAGTTTGCCGGATCTTTGGCATTGAAGTCGAAATCGGTATTCACCGGA > DH1/3702283‑3702583 | cgctatagctgaagtaaggtgttacaccattatcaaacaggtagttaacaccaccacgccaggtaaattgtttgtcatcacgtttatcggtcgtcccggcaacgcggttaagagattcttgatctgcccagtcataacgaccgcctagggg > 3:361516‑M1/151‑151 (MQ=255) gaagaaGGTTCAAACGATTCGCTATAGCTGAAGTAAGGTGTTACACCATTATCAAACAGGTAGTTAACACCACCACGCCAGGTAAACTGTTTGTCATCACGTTTATCGGTCGTCCCGGCAACGCGGTTAAGAGATTCTTGATCTGCCCAGt > 3:1565260/1‑151 (MQ=255) ctatagctgaagtaaggtgttacaccattatcaaacaggtagttaacaccaccacgccaggtaaactgtttgtcatcacgtttatcggtcgtcccggcaacgcggttaagagattcttgatctgcccagtcataacgaccgcctagggGTc < 8:1029762‑M1/3‑1 (MQ=255) gaagGTTCAAACGATTCGCTATAGCTGATGTAAGGTGTTACACCATTATCAAACAGGTAGTTAACACCACCACGCCAGGTAAACTGTGTGTCATCCCGTTTATCGGTCGTCCCGGCAACGCGGTTAAGAGATTCTTGATCTGCCCAGTCAt > 6:1461930/1‑151 (MQ=255) gaagGTTCAAACGATTCGCTATAGCTGAAGTAAGGTGTTACACCATTATCAAACAGGTAGTTAACACCACCACGCCAGGTAAACTGTTTGTCATCACGTTTATCGGTCGTCCCGGCAACGCGGTTAAGAGATTCTTGATCTGCCCAGTCAt > 5:540110/1‑151 (MQ=255) aagGTTCAAACGATTCGCTATAGCTGAAGTAAGGTGTTACACCATTATCAAACAGGTAGTTAACACCACCACGCCAGGTAAACTGTTTGTCATCACGTTTATCGGTCGTCCCGGCAACGCGGTTAAGAGATTCTTGATCTGCCCAGTCAt > 6:2113941/1‑150 (MQ=255) aagGTTCAAACGATTCGCTATAGCTGAAGTAAGGTGTTACACCATTATCAAACAGGTAGTTAACACCACAACGCCAGGTAAACTGTTTGTCATCACGTTTATCGGTCGTCCCGGCAACGCGGTTAAGAGATTCTTGATCTGCCCAGTCAt > 4:1927511/1‑150 (MQ=255) agctgaagtaaggtgttacaccattatcaaacaggtagttaacaccaccacgccaggtaaactgtttgtcatcacgtttatcggtcgtcccggcaacgcggttaagagattcttgatctgcccagtcataacgaccgcctagggGTCATaa > 5:1127383‑M1/145‑151 (MQ=255) 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aaaacgaccgcctagggGTAATAACGACCGCCTAGGGTGACCAGCACTTTATCCCACTGCGCCTGATCCTGAACATAAACGCCCGTTTGTTTCTGTTTATTCAGAATGCGTTAAGGGCCGGAGTTTGCCGGATCTTTGGCATTGAAGTCGa > 1:2297089‑M1/18‑151 (MQ=255) aacgaccgcctagggGTCATAACGACCGCCTAGGGTGACCAGCACTTTATCCCACTGCGCCTGATCCTGAACATAAACGCCCGTTTGTTTCTGTTTATTCAGAATGCGGTAAGGGCCGGAGTTTGCCGGATCTTTGGCATTGAAGTCGaa < 2:561439‑M1/135‑1 (MQ=255) aacgaccgcctagggGTCATAACGACCGCCTAGGGTGACCAGCACTTTATCCCACTGCGCCTGATCCTGAACATAAACGCCCGTTTGTTTCTGTTTATTCAGAATGCGGTAAGGGCCGGAGTTTGCCGGATCTTTGGCATTGAAGTCGaa < 8:832623‑M1/135‑1 (MQ=255) gaccgcctagggGTCATAACGACCGCCTAGGGTGACCAGCACTTTATCCCACTGCGCCTGATCCTGAACATAAACGCCCGTTTGTTTCTGTTTATTCAGAATGCGGTAAGGGCCGGAGTTTGCCGGATCTTTGGCATTGATGTCGAAATCg < 6:1129610‑M1/139‑1 (MQ=255) gATCTGCCCAGTCATAACGACCGCCTAGGGgtcataacgaccgcctagggtgaccagcactttatcccactgcgcctgatcctgaacataaacgcccgtttgtttctgtttattcagaatgcggtaagggccggagtttgccggatcttt > 2:1751635‑M2/1‑30 (MQ=255) ccgcctagggGTCATAACGACCGCCTAGGGTGACCAGCACTTTATCCCACTGCGCCTGATCCTGAACATAAACGCCCGTTTGTTTCTGTTTATTCAGAATGCGGTAAGGGCCGGAGTTTGCCGGATCTTTGGCATTGAAGTCGAAATCGGt > 2:115564‑M1/11‑151 (MQ=255) cgcctagggGTCATAACGACCGCCTAGGGTGACCAGCACTTTATCCCACTGCGCCTGATCCTGAACATAAACGCCCGTTTGTTTCTGTTTATTCAGAATGCGGTAAGGGCCGGAGTTTGCCGGATCTTTGGCATTGAAGTCGAAATCGGt < 1:215941‑M1/141‑1 (MQ=255) cctagggGTCATAACGACCGCCTAGGGTGACCAGCACTTTATCCCACTGCGCCTGATCCTGAACATAACCGCCCGTTTGTTTCTGTTTATTCAGAATGCGGTAAGGGCCGGAGTTTGCCGGATCTTTGGCATTGAAGTCGAAATCGGTAtt < 6:843648‑M1/144‑1 (MQ=255) tagggGTCATAACGACCGCCTAGGGTGACCAGCACTTTATCCCACTGCGCCTGATCCTGAACATAAACGCCCGTTTGTTTCTGTTTATTCAGAATGCGGTAAGGGCCGGAGTTTGCCGGATCTTTGGCATTGAAGTCGAAATCGGTATTc < 3:1448861‑M1/145‑1 (MQ=255) cAGTCATAACGACCGCCTAGGGgtcataacgaccgcctagggtgaccagcactttatcccactgcgcctgatcctgaacataaacgcccgtttgtttctgtttattcagaatgcggtaagggccggagtttgccggatctttggcattgaa > 5:1982588‑M2/1‑22 (MQ=255) cAGTCATAACGACCGCCTAGGGgtcataacgaccgcctagggtgaccagcactttatcccactgcgcctgatcctgaacataaacgcccgtttgtttctgtttattcagaatgcggtaagggccggagtttgccggatctttggcattgaa > 5:902019‑M2/1‑22 (MQ=255) gTCATAACGACCGCCTAGGGgtcataacgaccgcctagggtgaccagcactttatcccactgcgcctgatcctgaacataaacgcccgtttgtttctgtttattcagaatgcggtaagggccggagtttgccggatctttggcattgaagt > 4:823915‑M2/1‑20 (MQ=255) | CGAAGAAGGTTCAAACGATTCGCTATAGCTGAAGTAAGGTGTTACACCATTATCAAACAGGTAGTTAACACCACCACGCCAGGTAAACTGTTTGTCATCACGTTTATCGGTCGTCCCGGCAACGCGGTTAAGAGATTCTTGATCTGCCCAGTCATAACGACCGCCTAGGGTGACCAGCACTTTATCCCACTGCGCCTGATCCTGAACATAAACGCCCGTTTGTTTCTGTTTATTCAGAATGCGGTAAGGGCCGGAGTTTGCCGGATCTTTGGCATTGAAGTCGAAATCGGTATTCACCGGA > DH1/3702283‑3702583 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |