| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | DH1 | = 1355505 | 546 (0.930) | 65 (0.130) | 40/260 | 33.9 | 14.7% | noncoding (54/348 nt) | repeat_region | repeat region |
| ? | DH1 | 3099693 = | 283 (0.560) | noncoding (58/76 nt) | ECDH1_RS15360 | tRNA‑Lys | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 353 total aligned reads displayed.
CTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACGGGCC > DH1/3099543‑3099842 | cTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGATTGCGTCTCGCGCTTACGGAAGATCCTACCTCACCGTTAACCTTAACGTTCTCTACCAGTAAACACCTTTAAATTTGTTTATCGTCCAGGAtt > 7:1403974/1‑151 (MQ=255) tgagggATTATGCTGCCTTAATCATGCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTGGCTAAGGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTACCCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTc < 5:1609825/147‑1 (MQ=255) tGCGGGATTCTGCGGCCTTACTCATTCAGGATGGTGGGACGTGGAGGATGACTCGACTTCGTCTCGGTCTTCCGGCCGTTTCTCACGCAACGTTATCCTACACGTTCTCTACCAGTAAGCACATTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGAtt < 3:457988/149‑1 (MQ=25) tGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGGGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTc < 7:1121964/150‑1 (MQ=255) gCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGa < 3:1129042/151‑1 (MQ=255) gCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGAGGACTCCACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCg < 3:1374557/150‑1 (MQ=255) gggATTATGCTGCCGTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAAc < 7:126988/151‑1 (MQ=255) gtttATGCTGCCTTAATCATTCAGGATTTTTGTTTGTTCAGGTTGACTAGTCTTCTTCTATCTCTTGTGGGATTTTCTTAGTAAAGGTTATACTTAAATTTCTCTTTTAGTTAGCTGTTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCt < 4:1035590/149‑1 (MQ=255) aTTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGTGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTg < 7:20197/151‑1 (MQ=255) ttATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATGCTTCACGGTCACTACCAGTAACAACGTTTAAATTGGTGGGGCGTGCAGGATGCGCACCGGc > 7:1084423/1‑151 (MQ=25) cctgccgcCTCACTCATTCAGGATGGTGGGTCGTGAAGTCTGACTCGACTTCCTCTCTCCAATCCGGCCGTTGATAACGCAACGTTATACTTCACGCTATCTACCAGTCACCTTCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCg < 4:1857730/149‑1 (MQ=21) gctgcGTTCATCCTTCAGGGGGGGGGGTCGTGCAGTCTGACGACAGGTCGCCTCGCGCTTCGGGCCGTTGCTCAGTCAAGGTTATCCTTCACCTTCTCTACCAGTAAGCAGGTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGAcc < 3:802749/151‑1 (MQ=16) gctgcCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGAcc > 5:927022/1‑151 (MQ=255) tgcCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACATTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCa > 5:1536235/1‑150 (MQ=255) ccTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCCTCTCGCAATTCGGCCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCATCACGTTAAATAACAGTAACAAAAATAAAATTAGAGGGTCGTGAAGGATTAGAAAATGAGACCaagt > 6:510660/1‑149 (MQ=12) ttAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCATTCGGCCAGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTAAATAGCAGTAACAACGTTTAAATTGGTGGGTCGTGCTGGATAGCAACCTGCTCCCaagtc > 5:1367035/1‑147 (MQ=18) tacaccttCAGGAGGGCGGGCCCGCCAGGAAGACGCGACTGCCGCTCCGCCTTCGGCCCTTCGCAAACTCAACGTTATACTACACCTTCTCCACCAGTCCGCTCATTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGa < 5:414567/144‑1 (MQ=9) tAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGAt > 1:2058679/1‑151 (MQ=255) aaTCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGAtt > 2:1475031/1‑151 (MQ=255) tCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCATTCACGTTAAATAACAGTAAGAACATTTAAATTGGTAGCTCGTGAACGAGTCGTAGATGCAAACAATttatta > 4:980440/1‑150 (MQ=17) aTTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATGGTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGGTTCGACGCTGCGGCCAGTTGAttt > 5:2013170/1‑147 (MQ=21) ttCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGACCCTGCGACCAATTGATTaaaat > 1:140591/1‑150 (MQ=255) ttCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTaaa > 3:1480767/1‑149 (MQ=255) caggagcgggggTCGTGCCGGAGGCCTCTACTTAGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTc < 5:1143721/142‑1 (MQ=18) cAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACAACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGAATAGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGt > 4:1515210/1‑150 (MQ=255) aGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTc > 5:300058/1‑150 (MQ=255) ggggtgTCGTGCAGGATGCCTCGCCTTCGTCTGGGCCTTCGGGCCGTGGCTAACTAAACGTTATCCTTAAATTTCTCTAGCAGTTAGCAGCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTg < 7:697142/145‑1 (MQ=18) gtggGGCGTTCAGGAGGACTGAAATGCGGCGGGGCCTTCGGTCGGGTGCTAACGCTACGTTATCCTTCACGTTCTCTACGAGTCAGCATTTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGct < 7:738654/151‑1 (MQ=12) gggTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGCCCAATTGATTAAAAGTGAACTGgtct > 5:2199812/1‑151 (MQ=255) tGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTGTCTAGCAGTAAGCGCCTTTAAATGGGTGGGTCGTTGAGGATTCGAGCCTGCGCCAATTTGATTAACAGTCCACTGCTGTACCAAc > 1:596369/1‑151 (MQ=18) tGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAAc > 8:1066008/1‑151 (MQ=255) tGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGGTATAAAGCAGTAAGAAAATTTAAATTTGTTGGTAGTGAAGGATTAGAACATGCGAACAATTGAGTTAAAGTCAAGTGATCTagctac > 2:188088/1‑146 (MQ=12) gCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAAATGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTTCGACCAATTGATTAAAACTCAACAGCTCTACCAAc > 2:2244231/1‑150 (MQ=255) cAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGATAAATAACAGAAAAAACATTAAANTTAGACNGTCGTGAAGGAATAGAAACTCATAGCAATTGAATATAACTGAACTGctcaanaaaat > 6:775866/1‑142 (MQ=2) ggATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTg > 3:308208/1‑149 (MQ=255) aTGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTGTCTACCAGTAACCCCCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGACCCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACGAACTg > 1:1209512/1‑147 (MQ=255) tGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATAAAAAGGAAActcctcgaggaaggaaaaa > 6:2251930/1‑137 (MQ=18) gACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGCCCAATTGATTTAAAGTCCACTGCTCTACCAACTGAGCTa > 3:1042729/1‑150 (MQ=255) aCTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTATCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTAGTGCAGGATTCGAACCTGCCACCAAATGAATAAAAGTCAACGGGTAAACCAAAAGAGCTaa > 8:1637454/1‑150 (MQ=18) aCTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGGTGTCGACCAGTAACGAGCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGAGTCGACCCTGCGACGCATTGATTAACAGTGAAGGGCTCTACCAACTGAGCTAAc > 1:1109411/1‑151 (MQ=18) gccccTTCGTCTCCCCTTTGGGCCCGTTCCTAACGAAAGGTTATCTTTCAGGTTCTCTACCTCTATCCACCTTAAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACg < 8:238341/146‑1 (MQ=14) aCTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGAccc > 7:1772226/1‑151 (MQ=255) aCTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGAcc > 3:492151/1‑150 (MQ=255) 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cccTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCACAACCGAATGAGCTACAGAACGCTAAGGGTGtt > 4:658346/1‑151 (MQ=18) cccTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTAGAACCTGCGCCCAATTGATTAAAAGTCCACACCTCTGCCAACACAGCAAACCAACCATACGGGGGtt > 7:280112/1‑151 (MQ=21) ccTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTa < 8:412189/151‑1 (MQ=255) cTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTATCTACCAGTAACAACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGAACAAATGATTAAAAGTAAACTGCTCTACCAAATGAGATAAAGAAACATACGGGTGTTAc > 8:2181061/1‑151 (MQ=21) cTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTATCAAACAGAAAAAAACTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTAGAAACTGAGACCAATTGAATAAAAGTCAAATGCTCTACGAACTGAGCTAACAAAAAATACGGGTGTTAc > 6:366566/1‑151 (MQ=18) ttCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTAAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTAcc > 2:524667/1‑151 (MQ=255) tCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTAGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCagaacggaataacct > 2:84324/1‑137 (MQ=18) ggCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGCCCAAGTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACCGGTGTTACCTGa > 7:180547/1‑150 (MQ=255) cGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGCCCAATTGAGTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTAGCTGAAAgt > 3:179688/1‑150 (MQ=255) gTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGATAACGAACAAAACGGGTGTTACCTGaa > 4:782564/1‑147 (MQ=255) 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cAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTACAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAAATGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGCGTGTTAACTGAAAGATTTTTACTCgg > 3:261197/1‑151 (MQ=255) aaCGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCggg < 3:2231593/151‑1 (MQ=255) aCGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATATATTAAGAGGAAACTTCTCAACGAAATGAGCTAACTACCCATACGGGTGTTCGCTTAATGATTTTTaataggtg > 7:341338/1‑144 (MQ=21) cGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGACCCTGCGACCAAATGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACACCAACGGGTGGTCAATGAAAGATTTATAATccgccc > 3:2040390/1‑146 (MQ=18) tATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCa > 1:75939/1‑150 (MQ=255) ccTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCCAACCTGCGAACAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCAACCAACTCAGATAACGACCCATACTGGTGTTAAATGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCt > 7:971063/1‑151 (MQ=25) cTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTACAACCAAATAAATAAAAGTAAACAAATCTACAATATGAGATAAAAAAACAAACGGGTGTGACATGAAATAATTATAATAGGGGCCAGTCtt > 4:147281/1‑151 (MQ=16) cACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTa < 6:926265/150‑1 (MQ=255) gTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCAAACGGGTGGTTCCTGAAAGATTTTTACTCCGGGCCAATCttga > 3:769697/1‑145 (MQ=255) ctctACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGATCGCAATAGATTAGAAGTGGGATACTCTAGCATCTGCTCTAAAGAGCAATACGGGGGTGGAATGATATAATTTTACTCGGGGCGAGTGTGTAAGCTtgg > 2:1108162/1‑151 (MQ=255) cctttaggtcgcttttttACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATtggtg < 6:1709464/136‑1 (MQ=18) tACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTa > 6:1363408/1‑90 (MQ=255) aCCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTaa > 6:2106992/1‑62 (MQ=255) aCCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTggg < 2:2042844/151‑1 (MQ=255) tatgtcgcttttttAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGt < 2:734348/139‑1 (MQ=255) tagttagcttttttATATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGt < 4:347354/139‑1 (MQ=255) agtgcgcttttttAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCACCTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTc < 3:637943/140‑1 (MQ=255) aaCCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTg < 7:695/150‑1 (MQ=255) cgcttttttACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTa < 3:1549029/110‑1 (MQ=255) catgtttACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGATACCAATTGATTAAAAGTCAACTGATCTACCAACTGATCTAACGACCCATACTGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCTTGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAgg < 6:1584583/147‑1 (MQ=21) ttttttACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTAc < 4:1179400/96‑1 (MQ=255) ccTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGAt < 1:1475394/151‑1 (MQ=255) tttACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGgt < 7:2211466/91‑1 (MQ=25) tttAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACAAATTGATTAAAAGTCGACTGCTCTAACAAATGAGATAACGAGCAATAAGTGTGTTAGCTGAAAGATTTTTAATAAGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATgc > 8:816929/1‑150 (MQ=21) ttACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGtt < 1:296540/93‑1 (MQ=255) ttACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGtt > 2:296805/1‑93 (MQ=255) tAAATTGGTGGGTCGTTCAGTATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGGCAAATGCTCTACCAACTTAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGAc < 8:1961200/150‑1 (MQ=255) aacgaggtggGGAGTGCAGTATTCGAGACTGCTCTTAAGAGCTTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACtc < 1:1785027/146‑1 (MQ=37) tggtggGGCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCATCTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACtcgct < 4:2076795/150‑1 (MQ=255) ggtggGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCTATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGGTAAAGACCCATACGGTTGTTACCTGTAATATTTTTACTCGTGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACtcgctt < 8:657441/150‑1 (MQ=25) ggtggGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGAATAAAAGTCATCTGCTCTATCTACTGACCTAACGACCCATACGGCTGTTAACTGAAAGATTTTTACTCGGGTCCAATCTTTAATATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACtcgctt < 2:1358922/150‑1 (MQ=25) ggCAGGATACGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCt < 7:886834/150‑1 (MQ=255) gCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACCGGTGTTAACTGAAATATATAAAATCGGCTCCAATCTTTAAGATTCTTCCTACCTTAAGGATCACTCGATTCGCTCTCCCt > 4:29146/1‑150 (MQ=9) cgATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAACTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGTGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACgg < 6:2199159/150‑1 (MQ=255) aatCGACCCTGCGACCAATTGATTAAGACTGATCTACTCTACCTACTTCGGTACCGACGCATACGTTTCGTACCTGTACGCTTTTTACTCTGCGCCAATCATTAAGCTTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACggg < 1:1025720/148‑1 (MQ=16) aTTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGa < 2:596373/128‑1 (MQ=255) aTTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGGCAACTGCTCTACCAACTGAGATAACTACCCATAAGGGTGGTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCAAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACGGGc > 5:1826842/1‑151 (MQ=38) | CTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACGGGCC > DH1/3099543‑3099842 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |