New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | DH1 | 1355966 = | 217 (0.370) | 213 (0.370) +CTTC |
40/292 | 37.6 | 50.2% | noncoding (76/76 nt) | ECDH1_RS06685 | tRNA‑Val |
? | DH1 | = 3099542 | NA (NA) | noncoding (268/268 nt) | repeat_region | repeat region | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 415 total aligned reads displayed.
CTCAAACCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGAT > DH1/3099392‑3099692 | caaACCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGAcccc < 6:203015/150‑1 (MQ=32) aaCCTGCTGCTTGTTCGTATGTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTg < 5:80061/151‑1 (MQ=255) aCCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGc < 6:687377/151‑1 (MQ=35) ccTGCTGCAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCg > 3:2264762/1‑151 (MQ=35) atcttgcTGGTTGGATTCTTTTAGTATAGGATATAGCAAAAAAGCTCCTTTAGTGAGCTTTTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGAcccatacgg < 8:1585660/146‑7 (MQ=11) tgcAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGAcccatacgggtgtt > 4:1025470/1‑140 (MQ=9) tgcAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGAcccatacgggtgtt > 2:1002332/1‑140 (MQ=9) tgcAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGAcccatacggcgatt > 7:1586534/1‑140 (MQ=9) gcAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGAtt < 7:296994/150‑1 (MQ=40) gcAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGAtt < 7:1768638/150‑1 (MQ=40) cAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTAAAAAGCAATACCAACTGAGATAACGACACCTTGCGGGAatat > 8:1164690/1‑151 (MQ=14) aGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTAtg > 3:955206/1‑151 (MQ=255) ggTTCGAATCTTTGAGTATCGGAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGAcccatacgggtgttacct < 1:1002980/151‑16 (MQ=11) tCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAAGCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGAGCGACCAACTGAGCTACATACCCCTTTCGGGATTTtgctg > 5:927544/1‑150 (MQ=14) tCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTAtgctg < 7:1633521/150‑1 (MQ=255) tCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTAtgctg < 3:1455334/150‑1 (MQ=255) aaTCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATAGGGGGGTTaaggtgaatt > 7:19279/1‑142 (MQ=11) tttGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCCGGATTATGCTGCCTTAATc > 4:18265/1‑151 (MQ=255) ttGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTa < 8:186436/147‑1 (MQ=255) ttGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATc < 5:1202794/150‑1 (MQ=255) ttGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATc < 2:99425/150‑1 (MQ=255) tGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCa < 4:1575638/150‑1 (MQ=255) gAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCAt < 3:185134/150‑1 (MQ=255) gTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCa < 1:141658/151‑1 (MQ=255) gTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCa < 7:2240332/151‑1 (MQ=255) aTCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAgg < 6:46005/151‑1 (MQ=255) aTCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGATAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCATTAATCATTCAgg > 4:1128177/1‑151 (MQ=255) gCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGCGCTACCGCCCCCTTCGGGGGTTATCGGGCCTTAATCAtggagggtg > 3:695533/1‑143 (MQ=14) aTAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGAtggtg < 3:1183687/150‑1 (MQ=255) gCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTc < 5:43774/151‑1 (MQ=255) gCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTc < 5:1689331/151‑1 (MQ=255) aaaaaGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTg < 1:606549/151‑1 (MQ=255) aaaGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCa < 6:1085233/151‑1 (MQ=255) aGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAgg < 3:2086255/151‑1 (MQ=255) gcgcCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGa < 6:1155738/151‑1 (MQ=255) cgcCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGAt > 3:131000/1‑151 (MQ=255) gcCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATg > 3:570528/1‑151 (MQ=255) ccTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATg > 2:1977307/1‑150 (MQ=255) 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tctaaCTGAGCTAACTAACCCTTTCGGTATTCTGCTGGCTTTATCTTTCATTATGTGGGGTGGTGCAGGATGTCTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTaa < 8:2212379/147‑1 (MQ=21) aCCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCttt < 2:1504179/148‑1 (MQ=255) aCCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTaaa < 4:131095/151‑1 (MQ=255) aCCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTAAGTCTCGCGCTGAGGTCCGTAGATAACGCAACGTTATCCATCACGTTCTGTACCatataccacaattta > 1:706877/1‑136 (MQ=25) ccAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGATCTCTACCAGTAACCACGTTTAAAt > 7:594626/1‑151 (MQ=255) cAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAAtt > 2:1397005/1‑151 (MQ=255) actcgCTAACGAACCCTTTCGGGATTCTGCTCGCTTAATCTATCAGAATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATtggt < 2:495254/147‑1 (MQ=21) tGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATtggtg > 2:1595683/1‑151 (MQ=255) gAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATtggtgg > 3:499682/1‑151 (MQ=255) aggtaccGACACGTTGCGGGAATCTGCTGCCGGAATCTTTGAGGATGGTGGGGCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTggg < 3:29750/145‑1 (MQ=21) aGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGCATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTggg < 5:643888/151‑1 (MQ=255) cTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGGTATCATACACGGTCTCTACAAGTAAGCACCTTTAAATTGGTGGGTc > 3:84780/1‑151 (MQ=37) cTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGAATTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCAGAACAAGTAACCGCCGTTAAATTTGAGGGtg > 2:1711750/1‑150 (MQ=21) tAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCg > 8:1298754/1‑151 (MQ=255) aaCGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGAGTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTGATGCTTCACGTTCTCGACCATTAACCCGCTTTAAATTGGTGGGTCGt > 7:2181458/1‑151 (MQ=37) aaCGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTc < 1:587177/149‑1 (MQ=255) aCGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCCTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTTCCGCAGCGGTATGCTTCACGGTCTCGACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTg > 5:2312024/1‑151 (MQ=37) gACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGc > 3:2009779/1‑150 (MQ=255) aCCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTACGTCTCGCCCATCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATAGGTGGGTCGTGc > 4:542444/1‑149 (MQ=255) cccTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGAATACGTCTCCCACGTAGAGCCGTTGATAACCCAACATTATAATTCACTATATCTAATAGTAAAAAACTTTAAATTGGTGGTTAGTGAAgg > 6:2082103/1‑150 (MQ=255) accTTGCTGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATTGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACTTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATT‑GTGGGTCGTGCAGGAt < 4:954820/150‑1 (MQ=255) ccTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGAATTCCTCTCGCCCTTCGGCCAGTTTCTACCGCAAATTTATCCTTCACGTAAAATATCAGTAAGAACGTTTAAATAGCTGGGTAGAGCAgggt > 8:2058035/1‑149 (MQ=16) | CTCAAACCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGAT > DH1/3099392‑3099692 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |