New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | DH1 | 1355966 = | 217 (0.370) | 107 (0.190) +CTTC |
41/292 | 37.1 | 27.1% | noncoding (76/76 nt) | ECDH1_RS06685 | tRNA‑Val |
? | DH1 | = 3099750 | 375 (0.640) | noncoding (1/76 nt) | ECDH1_RS15360 | tRNA‑Lys | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 390 total aligned reads displayed.
ACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGT‑GTTACCTGAAA‑GATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGT‑CGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCACGCTTAACATCTGAGTTTGATGTTAAAACTGGT > DH1/3099600‑3099900 | aCTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTGTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGCACCGGCGACCCATTGATTAAAAGTGAAATGCTCTACCAACTGAGCTAACGAgcc > 1:2204723/1‑151 (MQ=18) tCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGCCCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGAccccac > 1:1168410/1‑148 (MQ=255) cGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACAAGTAACCACCTTTAAATTGTTTTGTCGTGCAGGATTCTAACCTGCTACCAATTGATTAAAATTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATAc < 8:394780/151‑1 (MQ=18) ctcGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACggg > 1:1327190/1‑151 (MQ=255) cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTGACGTTCACTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCAGCGACCAATTGATTTAAAGTGAACTGCTCTAACAAATGAGCTAACGAcccgaagggggg > 5:1590784/1‑142 (MQ=18) cTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTATCTACCAGTAACAACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGAACAAATGATTAAAAGTAAACTGCTCTACCAAATGAGATAAAGAAACATACGGGT‑GTTAc > 8:2181061/1‑151 (MQ=21) cTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTATCAAACAGAAAAAAACTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTAGAAACTGAGACCAATTGAATAAAAGTCAAATGCTCTACGAACTGAGCTAACAAAAAATACGGGT‑GTTAc > 6:366566/1‑151 (MQ=18) ccGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGT‑GTTACCTGaa > 7:726491/1‑149 (MQ=255) cGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAACGAAACGGCTAGACGAAGTGAGCTAAAGACGGAGACGGGA‑GTTAGCTGaa > 2:1550251/1‑148 (MQ=21) ttGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACATTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGACCCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGATAACGACCAATACGGGT‑GTTACATGAAA‑AAtt > 8:1866350/1‑151 (MQ=25) gtGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACAATTAACCACCTTTAAATTGGTGCTTCGTGCAGGATTGGATCCTGCGACCAATTGATTAAACGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGT‑GTTACCTGAAA‑GAtt < 1:493742/150‑1 (MQ=25) gCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGT‑GTTACCTGAAA‑GAtttt < 6:1830857/151‑1 (MQ=255) cTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGAGCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGT‑GTTACCTGAAA‑GAttttt > 1:1463979/1‑151 (MQ=255) cTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGAGCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGAACCATACGGGT‑GTTACCTGAAA‑GAttttt > 6:2154663/1‑151 (MQ=255) aaCGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGT‑GTTACCTGAAA‑GATTTTTa < 5:534818/150‑1 (MQ=255) gCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGT‑GTTACCTGAAA‑GATTTTTACTCg < 7:1066628/151‑1 (MQ=255) aCGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATATATTAAGAGGAAACTTCTCAACGAAATGAGCTAACTACCCATACGGGT‑GTTCGCTTAAT‑GATTTTTaataggtg > 7:341338/1‑144 (MQ=21) tATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGT‑GTTACCTGAAA‑GATTTTTACTCGGGGCCa > 1:75939/1‑150 (MQ=255) 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ccAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGT‑GTTACCTGAAA‑GATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTggg < 2:1378839/150‑1 (MQ=255) tagttagcttttttATATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGT‑GTTACCTGAAA‑GATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGt < 4:347354/139‑1 (MQ=255) gttcgcttttttACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGT‑GTTACCTGAAA‑GATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGT‑Cg < 6:726802/141‑1 (MQ=255) gTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGT‑GTTACCTGAAA‑GATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGT‑CGt < 1:848010/151‑1 (MQ=255) tAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCAAAAGGGT‑GTTGAATGAAA‑GATATATACTAGGGGACAAACTATAAGAAtggtagatagtg > 8:869566/1‑143 (MQ=17) 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aCTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGT‑GTTACCTGAAA‑GATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGT‑CGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCACGCtt > 2:1786264/1‑150 (MQ=255) tctACCAACTGAGCTAACGACCCGTAGGGGT‑GTTGCGTGAAA‑GATTTTTACTCGGGCCCAATCGTTAAGATTGGTGGGT‑AGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTCCGGGCCGTTGCTGGCGCAACCTTATACTTCACGCGTAACAt > 5:230396/1‑150 (MQ=25) tctACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGT‑GTTCCGTGAAA‑GATTTTTACTCGGGGCCAATCGTTAAGAGTGGTGGGT‑CGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTCCGGGCCGTTGCTGGCGCGACGTTATCCTTCCCGCTTAACAtg > 3:2090304/1‑150 (MQ=25) gctACAAACTGAACTAACGAGCGAGACGGGT‑GTTAACTGTTC‑GTGTTTTCCTCTCTGCCAATCTTTAAGTTTGGTGGGT‑CGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCACGCTTAACATc < 5:1706490/150‑1 (MQ=17) ctACCAACTGCGCTAACGACCCATACGGGT‑GTTACCTGAAA‑GATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGT‑CGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCACGCTTAACAt < 3:1377631/149‑1 (MQ=255) ctACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGT‑GTTACCTGAAA‑GATTTATACTCCGGCCCAATCATTAAGATTGGTGGGT‑CGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACGGGCCGTTGCTCGCGCAACGTTATCCTTCACGCTTAACATCt > 3:338438/1‑151 (MQ=255) ctACCAAATGTGCTCACGAGCGATACGGGG‑GTTTCGTGAAA‑GATTTTTACTCGGGGACAATCTTTAAGATTGGTGGGT‑CGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCACGCTTAACAt < 7:1373947/149‑1 (MQ=21) aCCCACTGAGCTAAGGCCCCCTAGTGGT‑GTTTCCTGATA‑GATTTTTAGTGGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGT‑CGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCACGCTTAACATCTg < 3:658738/150‑1 (MQ=18) ccAACTGAGCTAACGACCCATACGGGT‑GTTACCTGAAA‑GATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGT‑CGTGCAGGATGCCTCGCTTCGCTCGCCCTACGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATGCTTCACGCTTAACATCTg > 8:1629778/1‑149 (MQ=255) ccAACTGAGCTAACGACCCATACGGGT‑GTTACCTGAAA‑GATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGT‑CGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCACGCTTAACATCTGAg < 2:697527/151‑1 (MQ=255) aaCTGAGCTAACGACCCATACGGGT‑GTTACCTGAAA‑GATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGT‑CGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCACGCTTACCATCTGAGtt > 1:1999299/1‑151 (MQ=255) gAGCTAACGACCCATCCGCTC‑GTTACCTGTAA‑GATTTTTACTCGGGGACAATCTTTAAGATTGGTGGGT‑CGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCACGCTTAACATCTGAGTTTg < 5:18381/149‑1 (MQ=21) gAGCTAACGACCCATACGGGT‑GTTACCTGAAA‑GATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGT‑CGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCACGCTTAACATCTGAGTTTg < 4:1869479/149‑1 (MQ=255) atcTAACGACCCATAGGGGT‑TTTTCCTTAAT‑GNTTTTTTCGCGGGGCGNATATTTTTGA‑TGTTNGGTGCGTGCTGGTTGACTCGGTTGGCTCGCCCTACGGGCCGTTGCTTTCGCAACGTTATCNTTCACGCTTAACATCTGAGTTTGAt < 5:776432/148‑1 (MQ=12) gCTAACGACCCATACGGGT‑GTTACCTGAAA‑GATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGT‑CGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCACGCTTAACATCTGAGTTTGATGt < 7:261282/151‑1 (MQ=255) tAACGACCCATACGGGT‑GTTACCTGAAA‑GATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGT‑CGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCACGCTTAACATCTGAGTTTGATGtt > 2:2207217/1‑150 (MQ=255) caCGACCCATACGGGT‑GTTACCTGAAA‑GATTTTTCCTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGT‑CGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCACGCTTAACATCTGAGTTTGATGTTaa < 7:2182419/150‑1 (MQ=255) aaCGACCGATACGGGT‑GTTACCTGAAA‑GATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGT‑CGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCACGCTTAACATCTGAGTTTGATGTTa > 1:1904488/1‑150 (MQ=255) aaCGACCCATACTTGT‑GTTACATGAAA‑GATTTTTACTCGGGGACAATCTTTAAGATTGGGTGGT‑CGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCACGCTTAACATCTGAGTTTGATGtt < 1:1593680/149‑1 (MQ=25) aCGAGCCTTACTGGT‑GTTACCTGACA‑GATTTTTACTGGCGCCCAATCTTTACGATTGGTGGGT‑CGTGCAGTAGGACTCGCTTCGCTCGCCCTACGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCACGCTTAACATCTGAGTTTGATGTTaaa < 5:1417511/151‑1 (MQ=18) gACCCATACGGGT‑GTTACCTGAAA‑GATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGT‑CGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCACGCTTAACATCTGAGTTTGATGTTAAAAc > 1:608431/1‑151 (MQ=255) acgcATACGGGT‑GTTACCTGAAA‑GATTTTTACTCGGGTCCAATCTTTAAGATTGGTGGGT‑CGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCACGCTTAACATCTGAGTTTGATGTTAAAACt < 7:187936/148‑1 (MQ=255) aCCCATACGGGT‑GTTACCTGAAA‑GATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGT‑CGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCACGCTTAACATCTGAGTTTGATGTTAAAACt > 2:316403/1‑151 (MQ=255) cccATACGGGT‑GTTACCTGAAA‑GATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGT‑CGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCACGCTTAACATCTGAGTTTGATGTTAAAACtg < 3:782685/151‑1 (MQ=255) | ACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGT‑GTTACCTGAAA‑GATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGT‑CGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCACGCTTAACATCTGAGTTTGATGTTAAAACTGGT > DH1/3099600‑3099900 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |