| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | DH1 | 936,293 | 0 | T | . | 33.3% | 336.4 / 188.4 | 155 | intergenic (‑27/+7) | ECDH1_RS04620/ECDH1_RS04625 | tRNA‑Met/tRNA‑Met |
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.05e-01 | |||||||||||
Only 100 of 158 total aligned reads displayed.
TGCTTTTACTTCATCAAATTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCG‑TCACCGTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCA‑CCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACGGATT > DH1/936166‑936443 | tGCTTTTACTTCATCAAATTTGATTGGTTGCGTGTTATTTATTTGAATTGACTATCTTCGTTTTATTAGTCATAAGATCTACCATGCTTCTCCACCCCGCG‑TCACCGTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGttt < 6:381681/139‑1 (MQ=12)tGCTTTTACTTCATCAAATTTGATTGGTTGAGGGGGCCGGATTTGAACCGACGAAATTCGGGATATGAGCCAGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCG‑TCACCGTAGTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGtt > 5:382184/1‑139 (MQ=18) tcaataaTTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCG‑TCACCGTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTg < 7:755545/114‑1 (MQ=21) tcaataaTTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCG‑TCACCGTACTGC‑TTT‑AAATAATCAAAATTTAATTg > 8:755127/7‑120 (MQ=11) tGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCG‑TCCCCGGAGTGG‑GTT‑ACTTCATCTAAGTTTATTTGGTTGCGGGGGCGGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGttt > 7:1288358/1‑150 (MQ=11) cGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCG‑TCCCCGTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCcgacgac > 3:377681/1‑150 (MQ=255) gggTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCG‑TCCGCGGAATGG‑GAT‑ACTTCTGCGATGTTTAATTGCTTGCGGGTGCCTGATAAGCACCGCCGACCTTAGGCTTAAGATAGATCCGACCTACCAGGCTTATCCA‑ACCcgc > 7:321514/1‑151 (MQ=2) gaGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCG‑TCACCGTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAAcc < 6:1763748/84‑1 (MQ=255) aGGCTGCTCCACCCCGCG‑TCACGGTAGTGC‑GAG‑ACTTCAACAAAGTTTAATTGGTTGAGGGGGCGGGATTAGAACATACGACCTTGGGGATATGAGACAGACGAGATAACAGGCTGCTCCA‑CCACGATTCAGAGGATGGGGACTATCCtac > 5:1197544/1‑149 (MQ=9) aGGCTGCTCCACCCCGCG‑TCACCGTAGTGC‑GTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGCCCTTCGGGTTAAGAGCCCGCCGAGCTACCAGGCTGCTCCA‑CCCCGAGTCCGGGCATGGGCAGTATACTcc > 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ccctcccGCGCTCACCGTACTGC‑TTT‑AACTCCTGAAAATTTCATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCTCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCA‑CCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTcgcg < 3:788802/147‑1 (MQ=17) ccACCCCGCG‑TCACCGTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCA‑CCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGt > 4:125120/1‑151 (MQ=255) aCCCCGCG‑TCACCGTACTGCTTTT‑AGTTAATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCAGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGATACCGAAGAGCTACCAGGCTGATCCC‑CCCCGCGTCCGAGTAAGGGAAGTATACTgcgcagtagttt > 6:1231194/1‑143 (MQ=14) aCCCCGCG‑TCACCGTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCA‑CCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGttt > 7:1114236/1‑151 (MQ=255) ccccGCG‑TCACCGTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCA‑CCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGtttt > 5:817882/1‑151 (MQ=255) ccccGCG‑TCACCGTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCA‑CCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGtttt > 6:1467950/1‑151 (MQ=255) cccGCG‑TCACCGTACTGCTTTT‑ACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCA‑CCCCGCGTCCGTGGATGGGGAGTATACTCCGCTCGCGTTTTc > 3:1762755/1‑151 (MQ=11) cccGCG‑TCACCGTACTGCTTTT‑ACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCA‑CCCCGCGTCCGTGGAGGCGCTCTATACTcgataggaagagcc > 7:1787023/1‑138 (MQ=1) cccGCG‑TCACCGTACTGCTTTT‑ACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCA‑CCCCGCGTCCGAGGATTCCCAATATAcaacgatagagtt > 8:1201142/1‑136 (MQ=11) cccGCG‑TCACCGTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCA‑CCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTc > 1:1212448/1‑151 (MQ=255) 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t‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCA‑CCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTAccc > 1:491153/1‑151 (MQ=255) t‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCA‑CCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTAccc > 1:1115058/1‑151 (MQ=255) t‑ACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCA‑CCCCGCGTCCCGGGAGGCGGACTATACTCCGCTCGCGTTTTCCTGCACCCTGTTTTTTAcccc > 5:910186/1‑151 (MQ=17) aCTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCA‑CCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGATCTATTTTTCATGCACCCTTTTTTTTAacccc > 3:585952/1‑150 (MQ=17) cTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCA‑CCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCg > 4:1980231/1‑151 (MQ=255) 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tcatcaAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCA‑CCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGAt > 6:756368/1‑151 (MQ=255) tcatcaAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCA‑CCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTATTCATGAAACATTTTTTTTACACCGAt > 6:2212633/1‑151 (MQ=255) tcatcaAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCA‑CCCCGCGTCCGTGGATGGGCACAATACACCGAAGGCGTATTCCTTCCACCTGTCTTATAcccac > 1:1640194/1‑146 (MQ=11) catcaAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCA‑CCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATc > 7:1547828/1‑151 (MQ=255) atcaAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCA‑CCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATc > 3:1789238/1‑150 (MQ=255) atcaAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCA‑CCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATc > 8:2063061/1‑150 (MQ=255) atcaAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCA‑CCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCAc < 7:1385376/151‑1 (MQ=255) tcaAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCA‑CCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCAc > 1:2007452/1‑151 (MQ=255) tcaAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCA‑CCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCAc > 1:1404393/1‑151 (MQ=255) tcaAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCA‑CCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGc > 1:2050260/1‑127 (MQ=255) tcaAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCA‑CCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGc < 2:2049311/127‑1 (MQ=255) caAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCA‑CCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACg > 4:911642/1‑151 (MQ=255) aaaTTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACg > 8:697463/1‑151 (MQ=255) aaaTTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCA‑CCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACgg > 6:926556/1‑151 (MQ=255) aaTTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCA‑CCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACgg > 3:2153613/1‑150 (MQ=255) | TGCTTTTACTTCATCAAATTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCG‑TCACCGTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCA‑CCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACGGATT > DH1/936166‑936443 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |