| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | DH1 | 2,413,243 | (A)7→6 | intergenic (‑157/+174) | insD1 ← / ← paaY | hypothetical protein/phenylacetic acid degradation protein PaaY |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | DH1 | 2,413,237 | 0 | A | . | 97.8% | 1871.5 / 33.3 | 409 | intergenic (‑151/+180) | insD1/paaY | hypothetical protein/phenylacetic acid degradation protein PaaY |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (6/3); new base . (179/221); total (185/224) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.10e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 443 total aligned reads displayed.
ATAAATCCTTCTGGCGAATATAAAGAAAGCCGGATGCACTAACCCGACCAATTAGTTATTTAAAACATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAATAAAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCT > DH1/2413088‑2413382 | aaaTCCTTCTGGCGAATATAAAGAAAGCCGGATGCACTAACCCGACCAATTAGTTATTTAAAACATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAATaaa > 2:381029/1‑150 (MQ=255) aaTCCTTCTGGCGAATATAAAGAAAGCCGGATGCACTAACCCGACCAATTAGTTATTTAAAACATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAATaaaa > 1:519544/1‑150 (MQ=255) ccTTCTGGCGAATATAAAGAAAGCCGGATGCACTAACCCGACCAATTAGTTATTTAAAACATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAATaaaaaaga < 5:1699769/151‑3 (MQ=255) tGGCGAATATAAAGAAAGCCGGATGCACTAACCCGACCAATTAGTTATTTAAAACATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATg > 2:1218380/1‑151 (MQ=255) ggCGAATATAAAGAAAGCCGGATGCACTAACCCGACCAATTAGTTATTTAAAACATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTACCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATg < 4:1383368/150‑1 (MQ=255) cGAATATAAACAAAGCCGGATGCACTAACCCGACCAATTAGTTATTTAAAACATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGaaa < 4:373533/151‑1 (MQ=255) gAATATAAAGAAAGCCGGATGCACTAACCCGACCAATTAGTTATTTAAAACATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAat < 1:1269385/151‑1 (MQ=255) tataAAGAAAGCCGGATGCACTAACCCGACCAATTAGTTATTTAAAACATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAatat > 2:1501032/1‑150 (MQ=255) tataAAGAAAGCCGGATGCACTAACCCGACCAATTAGTTATTTAAAACATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAatat > 6:211472/1‑150 (MQ=255) ataAAGAAAGCCGGATGCACTAACCCGACCAATTAGTTATTTAAAACATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAatatat < 4:148705/151‑1 (MQ=255) ataAAGAAAGCCGGATGCACTAACCCGACCAATTAGTTATTTAAAACATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAatatat < 7:1532283/151‑1 (MQ=255) taAAGAAAGCCGGATGCACTAACCCGACCAATTAGTTATTTAAAACATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAatatat > 6:526854/1‑150 (MQ=255) aaagaaagCCGGATGCACTAACCCGACCAATTAGTTATTTAAAACATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAAtatata < 3:1584908/150‑1 (MQ=255) aaagaaagCCGGATGCACTAACCCGACCAATTAGTTATTTAAAACATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATaa < 1:1149583/151‑1 (MQ=255) aaagaaagCCGGATGCACTAACCCGACCAATTAGTTATTTAAAAAAAACAGGAAATCAAAAATTGCCAGTAGATAATTAACAAATCAAAAATACTTTCCAAAAATTAACAATTTTAATTCTGGTAAAT‑AAAAAATACAATGAAAaatata > 3:1142335/1‑150 (MQ=255) aagaaagCCGGATGCACTAACCCGACCAATTAGTTATTTAAAACATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATaaa < 1:1349993/151‑1 (MQ=255) ccGGATGCACTAACCCGACCACTTAGTTATTTAAAACATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGCCCATGAAATATATAAATTGTGta < 8:1003695/151‑1 (MQ=255) cGGATGCACTAACCCGACCAATTAGTTATTTAAAACATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGtat < 7:621296/151‑1 (MQ=255) cGGATGCACTAACCCGACCAATTAGTTATTTAAAACATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGtat > 8:404211/1‑151 (MQ=255) ggATGCACTAACCCGACCAATTAGTTATTTAAAACATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGtat > 7:808938/1‑150 (MQ=255) ggATGCACTAACCCGACCAATTAGTTATTTAAAACATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGtat > 2:234940/1‑150 (MQ=255) gATGCACTAACCCGACCAATTAGTTATTTAAAACATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGtatat < 5:521129/151‑1 (MQ=255) aTGCACTAACCCGACCAATTAGTTATTTAAAACATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGtatata < 2:1443480/151‑1 (MQ=255) tcACTAACCCGACCAATTAGTTATTTAAAACATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTatataa < 1:1042385/149‑1 (MQ=255) cACTAACCCTACCAATTAGTTATTTAAAACATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTatataat < 8:833791/150‑1 (MQ=255) cACTAACCCGACCAATTAGTTATTTAAAACATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAAATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTatataat > 5:1368514/1‑150 (MQ=255) aCTAACCCGACCAATTAGTTATTTAAAACATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTatataatat > 8:921424/1‑151 (MQ=255) aaCCCGACCAATTAGTTATTTAAAACATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTatataatata < 1:381431/149‑1 (MQ=255) aCCCGACCAATTAGTTATTTAAAACATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAAt > 1:993725/1‑151 (MQ=255) cccGACCAATTAGTTATTTAAAACATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAAtt < 2:1338434/151‑1 (MQ=255) cccGACCAATTAGTTATTTAAAACATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACCTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAAtt < 6:1592883/151‑1 (MQ=255) ccGACCAATTAGTTATTTAAAACATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAAtt > 8:1278541/1‑150 (MQ=255) ccGACCAATTAGTTATTTAAAACATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTa < 3:13528/151‑1 (MQ=255) gACCAATTAGTTATTTAAAACATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTAc > 6:1116282/1‑150 (MQ=255) gACCAATTAGTTATTTAAAACATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTAc > 3:758165/1‑150 (MQ=255) gACCAATTAGTTATTTAAAACATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACa < 5:1539490/151‑1 (MQ=255) aCCAATTAGTTATTTAAAACATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACaa < 2:939519/151‑1 (MQ=255) tAGTTATTTAAAACATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTaa > 1:1632533/1‑150 (MQ=255) tAGTTATTTAAAACATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTaa > 7:1008929/1‑150 (MQ=255) aGTTATTTAAAACATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTaaa > 5:809085/1‑150 (MQ=255) aGTTATTTAAAACATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTaaa < 2:473740/150‑1 (MQ=255) tATTTAAAACATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAAcc < 5:632084/150‑1 (MQ=255) tAAAACATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACAtt > 8:372611/1‑151 (MQ=255) aaaCATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATtct < 8:1447434/151‑1 (MQ=255) aaCATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATtct > 8:1242069/1‑150 (MQ=255) aaTAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCAt < 4:1090645/150‑1 (MQ=255) tAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCAttt > 6:1353724/1‑150 (MQ=255) agaagaCATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACAATCAAATATATAAATTGTTTATATAATATAAATTACAAATTAAAAcaaaataataatta > 4:501549/1‑137 (MQ=255) aagaCATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTataa < 5:361140/151‑1 (MQ=255) aagaCATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCACGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATtata > 4:1663790/1‑150 (MQ=255) caCATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTataaat < 1:1420485/150‑1 (MQ=255) aCATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTataaat > 8:711057/1‑150 (MQ=255) aTCCAATGTTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAaataat > 3:1235245/1‑151 (MQ=255) aTCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAaataat > 7:1423773/1‑151 (MQ=255) ccAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAAtt > 1:254294/1‑150 (MQ=255) ccAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATta < 6:297602/151‑1 (MQ=255) cAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTTAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATtat < 5:1424650/151‑1 (MQ=255) cAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATtat > 6:431839/1‑151 (MQ=255) aaTATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATtat > 6:889866/1‑150 (MQ=255) atatTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTatat < 2:1630132/151‑1 (MQ=255) tatTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTatatt > 8:1110439/1‑150 (MQ=255) tGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATatgat < 4:1242545/150‑1 (MQ=255) ccAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATAtgatga > 3:226551/1‑150 (MQ=255) ccAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGaa < 7:399227/151‑1 (MQ=255) cAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGaa > 2:1114708/1‑150 (MQ=255) tAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGaaaaa < 8:1503717/150‑1 (MQ=255) aGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGaaaaaa < 7:1279923/150‑1 (MQ=255) gATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGTAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACg > 5:225833/1‑151 (MQ=255) tattatCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGt > 2:1575164/1‑150 (MQ=255) tattatCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGt < 7:238518/150‑1 (MQ=255) tattatCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGt < 1:85623/150‑1 (MQ=255) tatCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATg > 1:118819/1‑150 (MQ=255) tatCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATg < 1:673551/150‑1 (MQ=255) aaTCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAAt < 4:871611/148‑1 (MQ=255) aTCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAAt > 3:418103/1‑151 (MQ=255) aTCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAAt > 3:821368/1‑151 (MQ=255) tCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAAt > 3:604433/1‑150 (MQ=255) aaaaCATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATAc < 6:1224463/150‑1 (MQ=255) cATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCaa < 6:101652/151‑1 (MQ=255) aTACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCaa > 7:44022/1‑150 (MQ=255) tCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCaaataaat < 5:1597630/150‑1 (MQ=255) tCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCaaataaat < 4:660599/150‑1 (MQ=255) ccTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAaataaata > 4:684049/1‑150 (MQ=255) ccTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAaataaata > 4:1169009/1‑150 (MQ=255) cTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAATAAAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAaataaata > 3:503864/1‑150 (MQ=255) tataATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAataaataa > 1:190893/1‑149 (MQ=255) ataATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGc < 7:1331883/151‑1 (MQ=255) taATTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGc > 5:1233717/1‑150 (MQ=255) aaTTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGc > 7:1572920/1‑149 (MQ=255) aaTTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGc > 2:683212/1‑149 (MQ=255) aaTTCACAATTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCa < 6:1167058/150‑1 (MQ=255) aaTTATAATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTa > 8:624222/1‑150 (MQ=255) tataATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAAc > 3:1420019/1‑150 (MQ=255) ataATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACAt > 6:766005/1‑151 (MQ=255) ataATTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACAt > 7:1069342/1‑151 (MQ=255) aaTTCAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATa > 2:794918/1‑150 (MQ=255) cAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAActct > 8:1572451/1‑151 (MQ=255) cAGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAActct > 4:1605928/1‑151 (MQ=255) aaagTGAAT‑AAAAAACAACATGAAATATATAAATTGTTTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAActct < 1:917838/148‑1 (MQ=255) aGGTGAAT‑AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTg < 1:1219513/151‑1 (MQ=255) | ATAAATCCTTCTGGCGAATATAAAGAAAGCCGGATGCACTAACCCGACCAATTAGTTATTTAAAACATAGAAGACATCCAATATTGCCAGTAGATTATTATCTAATCAAACATACTTTCCTATAATTCACAATTATAATTCAGGTGAATAAAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCT > DH1/2413088‑2413382 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |