New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | DH1 | = 1519086 | 252 (0.590) | 37 (0.090) | 31/300 | 35.7 | 13.2% | coding (71/186 nt) | ECDH1_RS07485 | hypothetical protein |
? | DH1 | 1519099 = | 235 (0.550) | coding (58/186 nt) | ECDH1_RS07485 | hypothetical protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
GCCCATGGGGATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > DH1/1518939‑1519086 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTC > DH1/1519099‑1519154 GCCCATGGGGATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATAC > 4:1412575/1‑151 CCATGGGGATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCT > 6:267553/1‑151 ATGGGGATCGGCTGTGGTCCTGTGTTAATTAGTTCTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACATGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTT < 2:100836/150‑1 ATGGGGATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTT > 1:101113/1‑150 GGGATCGTATGTGGTCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCAAGATCTGCTTCGCTTAGCTGGGTTGCCGCGAGCACATGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTC < 2:488598/148‑1 GGGATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTC > 1:488874/1‑148 GGATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCAGC > 6:1031764/1‑151 GATGGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCTCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCC < 5:1033132/151‑1 ATCGTCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTCGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACATGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCA < 6:432384/151‑1 ATCGGCTGGGGGCCTGTGTTAATTATTGGTTATACGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCA < 4:695465/151‑1 taagatcttCCTTTGTTAATTATTGCTTATTGGCTGCCAGATCTGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGC < 6:1384099/141‑1 atttttgtCCTGTGTTAATTATTGGTGATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGGTTAGGTGGGTGGGCGCGAGCACATTGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCA < 6:586475/143‑1 aTGTGGGCCTGTGTAAATTATTCGTTATTCGCTGCCATATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGGCGCCAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAA < 6:1266204/150‑1 ggagTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTTGTCACGATCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTG < 5:1039237/146‑1 GGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGGCAGCCATTTTGc > 6:1037877/1‑150 GCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCGTGACAGCatatcgga > 5:1385541/1‑142 TGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCAGCCTCCCAAATTGAacccc > 1:1117925/1‑145 TGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAT > 2:164126/1‑123 GTTAATTAGTGCTTATTCGCTGCCATATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTTGGCGCGAGCACCTTGTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCT < 2:1117160/150‑1 TAGTGGTGATTGGCCGCCAGATCCGCTTCTCTTAGCTGGTTGGCCGCCAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCCGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGC < 2:600956/150‑1 ttcGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCATAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCG < 2:62576/147‑1 CAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAT > 1:640070/1‑99 CAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGGTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAT < 2:639384/99‑1 GATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAT < 4:72467/97‑1 ATCCGCTTCGCTGAGCTGGGGGGGCGCCAGCACCAGGTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGT < 6:899323/150‑1 tccggTTCGGTTAGGTGGGTGGCCGCGAGCACCTTGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTC < 4:1176656/145‑1 GGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTT < 4:400233/98‑1 CGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCGTG > 3:1526270/1‑97 CGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTG < 4:1524672/97‑1 CGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACATGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCT < 7:1098395/116‑1 ACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCat > 8:831149/1‑71 ACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCT < 7:832067/73‑1 CTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCC > 7:1683712/1‑70 CTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCC < 8:1681581/70‑1 TCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACC > 7:1638714/1‑56 TCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACC < 8:1636683/56‑1 AAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCC < 1:637590/58‑1 GCCCATGGGGATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > DH1/1518939‑1519086 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTC > DH1/1519099‑1519154 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |