| Read alignment evidence... | |||||||||||
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AATGGCGCTTTTTTATGGGAGACCAGAAACAAAAAAACACCCGTTAGGGTGTTCAATAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACTGCTTTTACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCA > DH1/936020‑936249 | attGGCTCTTTTTTTTGGGAGACCACTACCAATAAAACAGTTGTTTGGTTGTTAAATTATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACTGCt < 2:1033272/148‑1 (MQ=14)aaTGGCGCTTTTTTATGGGAGACCCGTTACAATAAAACACCGTTTAGGGTGTTCAATTATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACTGCtt < 4:174696/151‑1 (MQ=18)aaTGGCGCTTTTTTATGGGAGACCAGAAACAAAAAAACACCCGTTAGGGTGTTCAATAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACTGCtt > 4:534156/1‑151 (MQ=255)aaTGGCGCTTTTTTATGGGAGACCAGAAACAAAAAAACACCCGTTAGGGTGTTCAATAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACTGCtt > 5:376273/1‑151 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acacCATTTAGGGTTTTAAATAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTCGACCCGACGCCCTTCGGGTTATCAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCCCGTCACCGTACTGCTTTTACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGa < 7:180646/151‑1 (MQ=17) cGTGAGGGAGTTCAATAATTGGTTGCGGGGGCCGGAGTTGAACCGTCGACCTTCGGGTTATCAGCCCGTATAGCTACGTTTCTTCTCCACCCCTCGTCAACGTAATGCGTTTACATCTTGATA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGa < 5:1624451/151‑1 (MQ=9) atTGGTTGCGGGGGCCGGAGTTGACCCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTTCTCCACCCCGCGTCACCGTACTGCTTTTACTTCCTCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGt < 7:96553/151‑1 (MQ=255) gagcggacgacCTTCGGGTTAAGAGCCCGAAGAGCTACCAGGCTCCTCGACCCCGCTTAACCGTACTGCTTTTACTTCATCTTA‑TATGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCa < 7:90304/145‑1 (MQ=14) | AATGGCGCTTTTTTATGGGAGACCAGAAACAAAAAAACACCCGTTAGGGTGTTCAATAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACTGCTTTTACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCA > DH1/936020‑936249 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |