| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | DH1 | 3,906,837 | 0 | C | G | 33.7% | 115.6 / 27.9 | 90 | intergenic (+8/‑27) | ECDH1_RS19315/ECDH1_RS19320 | tRNA‑Leu/tRNA‑Leu |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (45/10); new base G (28/0); total (77/13) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.41e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAAAACCACGTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAATTATCTTTACTTCCTTTCTTGTTTCTTCCTTGATTT > DH1/3906690‑3906987 | gggtcaacgccccccccTCGCACCAACAACCACGTTGATATTGCTCGCACTTTGCGAAGGGGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAACGAGGCGat < 1:1130311/142‑1 (MQ=18) ccccccccTCGCACCAAAAAACAGGTTTAGATTGCTGGAAATGTGCGAAGGTTTAGGAAAGTGTAGACGATAAAGATTCAGGTGTTAGTGTAATTACGGACTTGGGGGTTAAAGTCGCCACCCACGCCCACAAAAAGGGGATATCagtaa > 2:438241/1‑146 (MQ=255) cTCGCACCAAAAACCACGTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAAAAACGTGAAATCCAAAAAAGttac > 4:447449/1‑147 (MQ=18) tCGCACCAAAAACCACGTTGATATTGCTAGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAATCATGGAGAGATGCAAAAAAGTataat > 6:131795/1‑147 (MQ=18) cGCACCAAAAACGACTTTGATATTGCTCGCAGTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGCGAGCCGGGCTCCCTTGAGGTGTTCGGCTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATg < 1:1301785/151‑1 (MQ=21) cGCACCAAAAACCACGTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAAGAAGGGTACATCATAAAAAGTTAGTTg > 5:392459/1‑151 (MQ=18) gCACCAAAAACCACGTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTGAAGTCCCCCCCCTCGCCCCAAAAGACTGTATATCAATTAAAGtttgtttc > 1:1645763/1‑144 (MQ=18) gCACCAAAAACCACGTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTACTTACGGACGTGGGGCTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAAAAACGATAAATCAAAAAAAGttacatc > 2:1202251/1‑144 (MQ=18) caaccaaccggttgttATTTCTCGTGCTGGGGGAAGGTGGCGTAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTGCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAACGAGGCGATATAAAAAAAAGTAAGATGACtgt < 5:473881/141‑1 (MQ=18) cAAAAACCACGTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCGCGCACCAAATGACGGGAAATGAAAAAAAGTAAAATGACtgt > 1:1353295/1‑151 (MQ=18) cGTTTATATTGGTGGGTCTTGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAgg < 7:634393/149‑1 (MQ=18) tttatatAGCTGGTACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTgg < 7:588275/147‑1 (MQ=255) atatTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCCCACGAGGCGATATCAAAAAAACTAAGAAGACTGTGCGAAGGTGGCggc > 3:558850/1‑150 (MQ=255) aatatatgtgggtgtgCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTTTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGa < 8:102864/135‑1 (MQ=21) aagacctgcccctaggCGAAGGTGGCGGAATTGGTATTCTTTCTATCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTATGGACTTGGGGGTTCAAGTTCCCCCACTCGCACCATACTAGGATATATCATAAAAAGTAATATGACTCTGCGAAGGTGGCGGaa < 2:1629147/137‑1 (MQ=12) cTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAAAGTGGGGATATCAAATAAAGTAAGATGACTGTTGTTTGGTGGCGGAATTgaaatacgt > 3:765132/1‑143 (MQ=17) tGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAAGGTGGGTAAATCAAATAATGTTTGATGCGTGTTGTTTGGTGGCGGAATTGGTAgcaccc > 1:471575/1‑146 (MQ=14) cggCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTTTTTTTTTTATTATTGTGGTTGGCGTGCTAGTTCCACACCTCTAAACAATCTATGCGATATCTAATATATTACGATGAGTTTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGAcgcg < 6:194966/149‑1 (MQ=12) tgCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCg < 3:101868/124‑1 (MQ=255) gAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAAGAAGGGGATATCAAAAAATGTTTGTTGACTGTTGGTTGGTGGCGGAATTGCTataagttgtagc > 7:1429103/1‑140 (MQ=14) gCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTGAAGTCCCCCCCCGCGCCCCAAACGAGGGGTTATCAAAAAAAGTTTGATGACTGTTGGTTGGTGGCGGAATTTGTTTACGCGGTTGCTTCAGgt > 7:1230158/1‑151 (MQ=18) cGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAAGGAGGGGAAATCATATAATGTTAGTTGACTGTGTGTAGGTGGCGGATTTGTTTGCCGGGCTATCTGCAGgtt > 1:1426947/1‑150 (MQ=14) cGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAAGGAGGCGATATCAAAAAAAGTTTGATGACTGTTCGAACGTGGCGGAATTGCTAGACTCACTATCATCAGgtt > 1:1434855/1‑150 (MQ=18) aaTTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTGAAGTCCCCCCCCGCGCCCCCAAAGAGGGGAAATCAAAAAAAGTTTGATGAATGTTGGTTGGTGGCGGAATTGTTATACGGGGTAGCATCAGGTGtt > 8:603422/1‑150 (MQ=17) tttttAGACGCTCTAGCGTCAGGTGGTACTGTGCTTACGGTCCTGGGGGTGCTACGCCCCCCCCTCGCAGCAAACGACTAGATATCAATAAAATTCATATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAg < 3:531354/146‑1 (MQ=16) gcgcTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTGAAGTCCCCCCCCACGCCCCAAAAGACGGGCTATACAAAAAAGTTAGATGACTGTTGGAATGTGGGGGCATTTGTTGCCGCGGTATCTTCAGGTTTTTGTGTCCTTACg > 7:1486266/1‑151 (MQ=12) cgcTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTGAAGTCCCCCCCCCCGCCCCCAACGAGGGGATATAAAAAAAAGTTAGATGAATGTTGTTTGGTGGCGGGATTGGTATACGCGGTATCGTCAGGTGTTAGTGTACTTTCgg > 7:18838/1‑151 (MQ=16) cgcTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAAGGAGTGGATATCCAAAAATGTTTGATGCATGTGTTTTGGTGGCGGAATTTGTTTAAGGTGTAGCATCAGGTGTTAgtgtagttaggg > 8:585403/1‑143 (MQ=9) gcTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCACGCACCAAAAGAGGCGAAATAAAAAAAAGTAAGATGAATGTGGGAACGTGGCGGAATTGGTATACGAGGTAGCTTCAGGTTTTAgtgtaaataagg > 8:85048/1‑142 (MQ=21) aGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCGCGCACCAAAAGAGGGGAAATGAAAAAAAGTAAGATGCATGTTGTTAGGTGGCGGAATTTGTATAATGGGTATCTTCAGGGGTTAgtgtaataaaggccgg > 7:551370/1‑139 (MQ=12) ttCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAAAAAGGTTAAATCAAATAAAGTTAGATGCCTGTGGGGAGGTGGAGGGATAGGTTGACGGGCGAGGTTGAGGTGTGAGTGTGCGTCCGGAcctttt > 2:504615/1‑146 (MQ=12) tCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAAGGAGGGGATATAAAAAAAAGTTTGTTGACTGTGGGTTGGTGGCGGCATTGGTAGACCCGCAAGCTTCACGAGTTTGTGTCGTTACGGACGTggtg > 1:1350881/1‑149 (MQ=21) tCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAAATAGGGTATATCAAATAAAGTTTGATGAATGATTTTTGGTGGCGGAATTAAAATAAGAGATAGGTACAGGTGGTTGTTTGCTTACGGAGGtttgg > 8:745628/1‑147 (MQ=2) gcAGGTGGTCGTGCGCTTCCGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTACGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTgg < 5:196298/148‑1 (MQ=25) cAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAAAGAGGGGATATCAAAAAAAGTATGTTGACTGTGGGTTGGTGGCGGAATTGGTTTACGGGGTAGCTTCATGTGTGAGTGTACTTAAGGACGTggggg > 7:1329640/1‑151 (MQ=21) cAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGT‑CCCCCCCTCGCACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGGTAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTAATTACGGACGTGGGGGt > 1:849056/1‑151 (MQ=37) accgttgaggttgcTTTCGGTCGTTGTGGTTCTAGTCCCCGCCCTCGCACTATCAGATTATATATCTATTATATTTAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGt < 2:1636641/138‑1 (MQ=9) tgtTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAAAGACGGTAGATCAAAAAAAGTTAGATGCCTGTGGGTTGGTGGCGGATTTGGTATAAGGGCTAGCTTCAGGTTTTACTGTAATTACGGCCGTGGGGGttg > 3:597606/1‑149 (MQ=16) gtTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAAGGAGGGTATTTCAAATAAAGTTAGATGAATGTTAGTAGGTGCCTGATTTGGTATACGAGGAAGCAGCATGTTGTAGTGAAAATAGGGCCGTGGGGGTTct > 7:517377/1‑149 (MQ=9) tAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAACGAGGGGATATCAAAAAATGTATGATGCATGTTGGATGGTGGCGGAATTGGTATAATCTGTAGCTTCAGGTGTTAGTGTAATTACGGAAGTGGGGGTTGAAGt > 5:811589/1‑151 (MQ=21) tAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTACCCCCCCACGCACCAAAAGACGGGATATCAAAAAAAGTTAGATGACTGTGAGTAGGTGGCGGAATTAGTATAAGAAGTATCATCAGGAGTTAGAGTAATTAAGGAccggcgggtggatct > 8:934109/1‑137 (MQ=12) gtgtTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCACGCACCAAACGAGGGGAGATGAAAAAATGTTAGATGACTGTGAGAATGTGGCGGAATTGGTATACGGGCTAGCTTCAGGTTTTTGTGTAGTTTCGGGCGTggggcgtgtaatcc > 7:1184735/1‑141 (MQ=19) tgtTCTTACGGACGTGGGGGTTAAAGTCCCCCCCCTCCCACCAAAAAACGGGAAATCAAAAAAAGTTAGATGAAAGTGGGAAAGTGCCGGAATTGATAAAAGAGATAGAAACAGGTGAAAGTGTACGTAAAGAAGTgggggatgcactcgc > 4:1660394/1‑141 (MQ=255) gtTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAACGAGGGGATATCAAAAAAAGTTAGATGACTGTTATAAGCTGGCGGAATTGGTAGAATGGCTATCTTCATGTGTTAGTGTCATTACGGAAGTGGGGGTTGAAggaac > 7:1410145/1‑146 (MQ=25) ttCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAACGAGGGGATATCAAAAAAAGTAAGATGAATGTTGGTAGGTGGCGGAATTGGAAGAAGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTACTAAAGGCCGTGGGGGTTGAAggcaaa > 7:215124/1‑145 (MQ=25) tCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAAGGAGGGGAGATAAAAAAAAGTTAGATGCATGTTCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGGGGGAGCTTCATGTGTTAGTGTAAATAAGGCAGTGGGGGttggaggcacccc > 8:143066/1‑140 (MQ=16) ttACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCACGCCCCAAAAGAGGGGATTTCAAAAAAAGTTTGTTGCCTGTGGTAAGGTGGCGGCATTGGTATACGGGGTAGCTTCAGGGTTTAGTGTAATAAAGGCCCGGGGGGTGGAAGTcccccccc > 5:1229854/1‑151 (MQ=255) ttACGGACGTGGGGGTTCAACTACCCCCCCTCGCACCAAACGAGGCGAAATCAAAAAAAGGAAGATGACTGTGCGAAAGGGGCGGAATTGGTAGACGAGCAAGCATCAGGTGTGAGTGTCCTTAAGGCCGTTGCGGTTACAGTccccaccc > 7:1257209/1‑151 (MQ=25) tACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCCCCAAAAGAGGCGATATCAAAAAAATTAAGATGCATGTGGGTAGGTGGCGGAATTGGTATAAGCGGTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCATTAAGGACCTGGGGGGTGAACTccccccccc > 3:1355758/1‑150 (MQ=21) acgttcgtttgggTTCAATTCCCCCCCCTCGCACCAAACGAGGCGATATCAAATAAATTTAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTc < 4:558372/141‑1 (MQ=21) ggACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAAGGAGGGGAGATCAAAAAAAGTTAGATGAATGTGGGTAGGTGGCGGAATTGGTTGAAGGGGGAGCAGCAGGTTTGAGTGTACTTAGGCACGGGGGGGTTGAAggtaaagcgacggc > 8:144993/1‑138 (MQ=16) ggACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAAAGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGGGAAGGTGGCGGAATTGGTATACGCGCTAGCTTCAGGTTTTAGTGTCATTAAGGACGTGGGGGTTGAAGTccccccacgagc > 3:1100876/1‑145 (MQ=25) cccccccTCGCACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTGCAGTCCCCCCCCGCGCCCCAATTATGTTTACttgc > 7:22594/1‑149 (MQ=21) cccccccTCGCACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAATTATCTTTACTTcc > 3:695343/1‑151 (MQ=255) ccccccTCGCACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAATTATCTTTACTTCCt > 3:434486/1‑151 (MQ=255) ccccccTCGCACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGGCCCCCCCCCCGCCCCCATTATCTTTACTGccg > 7:1018170/1‑150 (MQ=255) ccccccTCGCACCAAAAGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTGAAGTAACCCCCCACGCACCAATTAtaattgggtact > 4:819798/1‑140 (MQ=21) cccccTCGCACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGGTAAGGTGGCGGATTTGGTAGACGCGATAGCTTCAGGTGTTAGTGTCATTCCGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCATCGCACCAATTTTGTTTAATTCCtt > 5:1345508/1‑151 (MQ=21) 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cGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTGAAGGCCCCCCCCGCGCACCAATTATGTTTACTGCCTTTGTTGTTTGTTccgt > 8:757879/1‑149 (MQ=21) cGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAATTATATTTAATTCCTTTATTTTTTATTACtt > 6:366559/1‑151 (MQ=18) cGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGCGTTCAAGTCCCCCCCCTAGCACCAATTATCTTTACTTCCTATCTAGTTTCTTACt > 6:815367/1‑150 (MQ=255) gAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAATTATCTTTACTTCCTTTCTTGTTTCTTCCTTg > 3:435830/1‑151 (MQ=255) gAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTACCCCCCCAAGCACCAAATATCTTTACTTGCTTTATTGTTTATTACttt > 4:367066/1‑150 (MQ=18) gAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGGCCCCCCCCGCGCACCAATTATCTTTACTGGCTTTCTTGTTTCTTCCTTg > 3:1346616/1‑151 (MQ=255) gAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTGCAAGTCCCCCCCCTCGCCCCAATTATCTTTTCTTCCTTTCTTGTTTCTTCCTTg > 4:123360/1‑151 (MQ=255) aGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTGAAGTGCCCCCCCGCGCCCCCATTTTGTTTTATTGCGTTATTGtttggtgctttt > 8:915903/1‑142 (MQ=17) aGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGGTCAAGTGCCCCCCCGCGCCCCAAATATATTTAAATCCGTTCTTGTTTGTTACTTg > 8:82751/1‑150 (MQ=18) gCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGTGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAATTATCTTTACTTCCTTTCTTGTTTCTTCCTTGAtt > 4:787032/1‑151 (MQ=255) gCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCCCCAATTTTCTTTACTTCCTTTCTTGTTTCTTCCTTGttt > 4:680242/1‑151 (MQ=255) gCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAATTATCTTTACTTCCTTTCTTGTTTCTTCCTTGAtt > 2:728691/1‑151 (MQ=255) cGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTGAAGTCCCCCCCCTCGCACCAATTATCTTTACTTCCTTTCTTGTTTCTTCCTTGAttt > 1:230163/1‑151 (MQ=255) cGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTGCCCCCCCGGGCACCAATTATATTTAATTCCTTTCTTGTTTCTTCCTTGAttt > 7:1049913/1‑151 (MQ=255) cGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGAGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTGGCACAAATTATCTTTACTTCCTTTATTGTTTCTTCATTGtttt > 1:1203767/1‑151 (MQ=21) | GGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAAAACCACGTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAATTATCTTTACTTCCTTTCTTGTTTCTTCCTTGATTT > DH1/3906690‑3906987 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |